-
Метагеномное секвенирование -NGS
Метагеном относится к коллекции общего генетического материала смешанного сообщества организмов, такого как метагеном окружающей среды, метагеном человека и т. Д. Он содержит геномы как культивируемых, так и некультивируемых микроорганизмов.Метагеномное секвенирование — это молекулярный инструмент, используемый для анализа смешанных геномных материалов, извлеченных из образцов окружающей среды, который предоставляет подробную информацию о разнообразии и численности видов, структуре популяции, филогенетических отношениях, функциональных генах и сети корреляции с факторами окружающей среды.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Метагеномное секвенирование-нанопоры
Метагеномика — это молекулярный инструмент, используемый для анализа смешанных геномных материалов, извлеченных из образцов окружающей среды, который предоставляет подробную информацию о разнообразии и численности видов, структуре популяций, филогенетических отношениях, функциональных генах и сети корреляции с факторами окружающей среды и т. д. Недавно были представлены платформы секвенирования нанопор. к метагеномным исследованиям.Его выдающиеся характеристики по длине считывания значительно улучшили последующий метагеномный анализ, особенно сборку метагенома.Используя преимущества длины считывания, метагеномное исследование на основе нанопор позволяет добиться более непрерывной сборки по сравнению с метагеномикой дробовика.Было опубликовано, что метагеномика на основе нанопор успешно генерировала полные и закрытые бактериальные геномы из микробиомов (Moss, EL, et. al,Природные биотехнологии, 2020)
Платформа:Нанопор ПрометИОН P48
-
Секвенирование ампликонов 16S/18S/ITS-PacBio
Субъединица 16S и 18S рРНК, содержащая как высококонсервативные, так и гипервариабельные области, является идеальным молекулярным отпечатком для идентификации прокариотических и эукариотических организмов.Используя преимущества секвенирования, эти ампликоны могут быть нацелены на основе консервативных частей, а гипервариабельные области могут быть полностью охарактеризованы для микробной идентификации, что будет способствовать исследованиям, охватывающим анализ микробного разнообразия, таксономию, филогению и т. д. Одиночные молекулы в режиме реального времени (SMRT ) секвенирование платформы PacBio позволяет получать высокоточные длинные чтения, которые могут охватывать полноразмерные ампликоны (около 1,5 Кб).Расширение обзора генетического поля значительно повысило разрешение аннотаций видов в сообществе бактерий или грибов.
Платформа:ПакБио Продолжение II
-
Секвенирование ампликонов 16S/18S/ITS-NGS
Секвенирование ампликонов 16S/18S/ITS направлено на выявление филогении, таксономии и видового разнообразия в микробном сообществе путем исследования ПЦР-продуктов генетических маркеров домашнего хозяйства, которые содержат как высококонверсивные, так и гипервариабельные части.Введение этих идеальных молекулярных отпечатков пальцев Woeses et al (1977) дает возможность проводить профилирование микробиома без изоляции.Секвенирование 16S (бактерии), 18S (грибы) и внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS, грибы) позволяет идентифицировать как распространенные виды, так и редкие и неопознанные виды.Эта технология стала широко применяемым и основным инструментом для определения дифференцированного микробного состава в различных средах, таких как рот человека, кишечник, фекалии и т. д.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Повторное секвенирование полного генома бактерий и грибов
Полное секвенирование генома бактерий и грибов является важнейшим инструментом для завершения геномов известных бактерий и грибов, а также для сравнения нескольких геномов или картирования геномов новых организмов.Очень важно секвенировать полные геномы бактерий и грибов для создания точных эталонных геномов, идентификации микробов и других сравнительных исследований генома.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Метатранскриптомное секвенирование
Метатранскриптомное секвенирование идентифицирует экспрессию генов микробов (как эукариотов, так и прокариотов) в естественной среде (т. е. почве, воде, море, фекалиях и кишечнике). В частности, эта услуга позволяет получить полное профилирование экспрессии генов сложных микробных сообществ, таксономический анализ. видов, анализ функционального обогащения генов с различной экспрессией и многое другое.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Грибной геном
Biomarker Technologies обеспечивает исследование генома, точный геном и полный геном грибов в зависимости от конкретной цели исследования.Секвенирование генома, сборка и функциональная аннотация могут быть достигнуты путем объединения секвенирования следующего поколения и секвенирования третьего поколения для достижения сборки генома высокого уровня.Технология Hi-C также может быть использована для облегчения сборки генома на уровне хромосом.
Платформа:ПакБио Продолжение II
Нанопор ПрометИОН P48
Платформа Illumina NovaSeq
-
Полный геном бактерий
Biomarker Technologies предоставляет услуги секвенирования для построения полного генома бактерий с нулевым пробелом.Основной рабочий процесс построения полного генома бактерий включает секвенирование третьего поколения, сборку, функциональную аннотацию и расширенный биоинформатический анализ для достижения конкретных исследовательских целей.Более полное профилирование генома бактерий позволит выявить фундаментальные механизмы, лежащие в основе их биологических процессов, что также может стать ценным источником информации для геномных исследований высших эукариотических видов.
Платформа:Nanopore PromethION P48 + платформа Illumina NovaSeq
ПакБио Продолжение II
