-
Секвенирование иммунопреципитации хроматина (ChIP-seq)
ChIP-Seq обеспечивает полногеномное профилирование ДНК-мишеней для модификации гистонов, факторов транскрипции и других белков, связанных с ДНК.Он сочетает в себе селективность иммунопреципитации хроматина (ChIP) для восстановления специфических комплексов белок-ДНК с мощью секвенирования нового поколения (NGS) для высокопроизводительного секвенирования восстановленной ДНК.Кроме того, поскольку комплексы белок-ДНК извлекаются из живых клеток, места связывания можно сравнивать в разных типах клеток и тканях или в разных условиях.Область применения варьируется от регуляции транскрипции до путей развития, механизмов заболеваний и не только.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Полногеномное бисульфитное секвенирование
Метилирование ДНК в пятом положении цитозина (5-mC) оказывает фундаментальное влияние на экспрессию генов и клеточную активность.Аномальные модели метилирования связаны с несколькими состояниями и заболеваниями, такими как рак.WGBS стал золотым стандартом для изучения полногеномного метилирования с разрешением одного основания.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Анализ доступного для транспозазы хроматина с высокопроизводительным секвенированием (ATAC-seq)
ATAC-seq — это высокопроизводительный метод секвенирования для анализа доступности хроматина по всему геному, что важно для глобального эпигенетического контроля экспрессии генов.Адаптеры секвенирования встраиваются в открытые области хроматина с помощью гиперактивной транспозазы Tn5.После ПЦР-амплификации создается библиотека секвенирования.Все открытые области хроматина могут быть получены в определенных пространственно-временных условиях, а не только ограничены сайтами связывания транскрипционного фактора или определенной областью, модифицированной гистонами.
-
Бисульфитное секвенирование с уменьшенным представлением (RRBS)
Исследования метилирования ДНК всегда были горячей темой в исследованиях заболеваний и тесно связаны с экспрессией генов и фенотипическими признаками.RRBS — это точный, эффективный и экономичный метод исследования метилирования ДНК.Обогащение областей промотора и CpG-островков путем ферментативного расщепления (Msp I) в сочетании с бисульфитным секвенированием обеспечивает обнаружение метилирования ДНК с высоким разрешением.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
