Хотя секвенирование мРНК на основе NGS служит универсальным инструментом для количественной оценки экспрессии генов, его зависимость от коротких считываний ограничивает его эффективность в сложных транскриптомных анализах.С другой стороны, секвенирование PacBio (Iso-Seq) использует технологию длительного считывания, позволяющую секвенировать полноразмерные транскрипты мРНК.Этот подход облегчает всестороннее исследование альтернативного сплайсинга, слияний генов и полиаденилирования, хотя он не является основным выбором для количественной оценки экспрессии генов.Комбинация 2+3 устраняет разрыв между Illumina и PacBio, полагаясь на считывания PacBio HiFi для идентификации полного набора изоформ транскриптов и секвенирования NGS для количественного определения тех же изоформ.
Платформы: PacBio Sequel II и Illumina NovaSeq.