Грибной геном
Преимущества сервиса
● Доступно несколько стратегий секвенирования для разных целей исследования.
● Имеет большой опыт сборки генома грибов: собрано более 10 000 полных геномов.
● Профессиональная команда послепродажной технической поддержки, выполняющая более конкретные исследовательские потребности.
Технические характеристики услуги
| Услуга | Стратегия последовательности | Качество гарантировано | Ориентировочное время выполнения |
| Мелкая карта грибков | Иллюмина 50X+Нанопор 100X | Контиг N50≥2 Мб | 35 рабочих дней |
| ПакБио HiFi 30X | |||
| Полная карта грибковых пен | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Коэффициент закрепления хромосом >90% | 45 рабочих дней |
Биоинформатический анализ
● Контроль качества исходных данных.
● Сборка генома
● Анализ компонентов генома.
● Аннотация функции гена.
● Сравнительный геномный анализ
Требования к образцам и доставка
Образец требований:
Дляэкстракты ДНК:
| Тип образца | Количество | Концентрация | Чистота |
| экстракты ДНК | > 1,2 мкг | > 20 нг/мкл | ОД260/280= 1,6-2,5 |
Для образцов тканей:
| Тип образца | Рекомендуемая обработка образца | Хранение и отправка образцов |
| Одноклеточный гриб | Наблюдайте за дрожжами под микроскопом и собирайте их в экспоненциальной фазе. Перенесите культуру (содержащую примерно 3-4,5e9 клеток) в эппендорф объемом 1,5 или 2 мл.(Держись на льду) Центрифугируйте пробирку в течение 1 минуты при 14000 g для сбора бактерий и осторожно удалите надосадочную жидкость. Закройте пробирку и заморозьте бактерии в жидком азоте не менее 1-3 часов.Храните пробирку в холодильнике при температуре -80 ℃. | Заморозьте образцы в жидком азоте на 3-4 часа и храните в жидком азоте или при -80 градусах для длительного хранения.Требуется доставка образцов с сухим льдом. |
| Макро Грибок | Рекомендуется ткань в активно растущей фазе. Промойте ткань водой, не содержащей эндотоксинов, затем 70% этоналом. Сохраните образец в криопробирках. |
Рабочий процесс обслуживания
Доставка образца
Строительство библиотеки
Последовательность действий
Анализ данных
Послепродажное обслуживание
1. Диаграмма Циркоса по компонентам генома грибов.
2.Сравнительный геномный анализ: Филогенетическое дерево.
