Компания BMKGENE предоставила услуги полноразмерного секвенирования транскриптома с использованием технологий PacBio и ONT для исследования под названием «Сравнительный анализ методов секвенирования РНК PacBio и ONT для идентификации яда Nemopilema Nomurai», которое было опубликовано в журнале Genomics.Целью исследования было сравнение эффективности методов секвенирования РНК PacBio и ONT при идентификации яда медуз вида Nemopilema nomurai.
Результаты исследования показывают, что ONT обычно обеспечивает более высокое качество необработанных данных при анализе транскриптома, в то время как PacBio генерирует более длинные длины чтения.Было обнаружено, что PacBio лучше подходит для идентификации кодирующих последовательностей и длинноцепочечных некодирующих РНК, тогда как ONT оказался более экономически эффективным для прогнозирования альтернативных событий сплайсинга, простых повторов последовательностей и факторов транскрипции.
Это исследование имеет важное значение для будущих технологий секвенирования морских медуз и подчеркивает эффективность полноразмерного анализа транскриптома в обнаружении потенциальных терапевтических мишеней для лечения дерматита, вызванного медузами.
Нажмитездесьчтобы узнать больше об этой статье.
Время публикации: 20 декабря 2023 г.