-
Секвенирование иммунопреципитации хроматина (ChIP-seq)
ChIP-Seq обеспечивает полногеномное профилирование ДНК-мишеней для модификации гистонов, факторов транскрипции и других связанных с ДНК белков.Он сочетает в себе селективность иммунопреципитации хроматина (ChIP) для восстановления специфических комплексов белок-ДНК с возможностями секвенирования следующего поколения (NGS) для высокопроизводительного секвенирования восстановленной ДНК.Кроме того, поскольку комплексы белок-ДНК извлекаются из живых клеток, сайты связывания можно сравнивать в разных типах клеток и тканях или в разных условиях.Область применения варьируется от регуляции транскрипции до путей развития, механизмов заболеваний и не только.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Полногеномное бисульфитное секвенирование
Метилирование ДНК в пятой позиции цитозина (5-mC) оказывает фундаментальное влияние на экспрессию генов и клеточную активность.Паттерны аномального метилирования были связаны с несколькими состояниями и заболеваниями, такими как рак.WGBS стал золотым стандартом для изучения метилирования всего генома с разрешением по одному основанию.
Платформа: Illumina NovaSeq6000
-
Анализ доступного для транспозазы хроматина с помощью высокопроизводительного секвенирования (ATAC-seq)
ATAC-seq представляет собой высокопроизводительный метод секвенирования для анализа доступности хроматина по всему геному, что важно для глобального эпигенетического контроля экспрессии генов.Адаптеры для секвенирования встраиваются в открытые области хроматина с помощью гиперактивной транспозазы Tn5.После ПЦР-амплификации создается библиотека секвенирования.Все открытые области хроматина могут быть получены в определенных пространственно-временных условиях, не ограничиваясь только сайтами связывания фактора транскрипции или определенной модифицированной областью гистонов.
-
Бисульфитное секвенирование с уменьшенной репрезентативностью (RRBS)
Исследование метилирования ДНК всегда было горячей темой в исследованиях болезней и тесно связано с экспрессией генов и фенотипическими признаками.RRBS — это точный, эффективный и экономичный метод исследования метилирования ДНК.Обогащение промотора и островков CpG путем ферментативного расщепления (Msp I) в сочетании с бисульфитным секвенированием обеспечивает обнаружение метилирования ДНК с высоким разрешением.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
