Продукты

Секвенирование ДНК/РНК – секвенатор нанопор

Секвенирование ДНК/РНК — изображение секвенатора Nanopore

Секвенирование ONT — это технология секвенирования электрического сигнала в реальном времени для одной молекулы, основанная на нанопорах, принцип секвенирования на каждой платформе одинаков.Двухцепочечная ДНК/РНК будет связываться с нанопористым белком, встроенным в биопленку и раскручивающимся под руководством моторного белка, под действием разности потенциалов с обеих сторон биопленки нити ДНК/РНК проходят через белок канала нанопоры при определенном ставка.Из-за различий в химических свойствах различных оснований на цепи ДНК/РНК, когда одно основание или молекула ДНК проходит через канал нанопор, это вызывает изменение различных электрических сигналов.Обнаружив эти сигналы и соответствуя им, можно вычислить соответствующие базовые типы и завершить обнаружение последовательности в реальном времени.

Связаться с нами

Детали услуги

Демо-результат

Подробности об услуге

Платформа	Размер библиотеки	Теоретический выход данных (на ячейку)	Однобазовая точность	Приложения
Нанопор	8Кб, 10Кб, 20Кб, Сверхдлинный, кДНК-ПЦР	70-90Гб/ячейка	85-92%	Вызов SV, de novo, полноразмерное секвенирование, Iso-Seq, аннотация генов, обнаружение метилирования ДНК

Преимущества сервиса

● Более 5 лет опыта работы на платформе секвенирования PacBio с тысячами закрытых проектов с различными видами.
● BMKGENE является официальным партнером Oxford Nanopore, имеющим сертификацию двойной платформы РНК/ДНК.
● Существуют распространенные модели секвенаторов с полным оснащением и достаточной производительностью секвенирования.
● На основе платформы Nanopore более 10 исследований Denovo на животных и растениях были опубликованы в всемирно известных журналах.

Образцы требований

Тип образца

Количество

Концентрация (Кубит ®)

Объем

Чистота

Другие

Геномная ДНК

Зависит от требований к данным

≥20 нг/мкл

≥15 мкл

ОД260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

Четкий пик при 260 нм, отсутствие примесей

Концентрацию необходимо измерять по кубиту и кубиту/нанопоре ≤ 2.

Общая РНК

≥1,2 мкг

≥100 мкг/мкл

≥15 мкл

ОД260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5；нет загрязнений

Значение РИН ≥7,5

Рабочий процесс обслуживания

Базовые приготовления

Строительство библиотеки

Последовательность действий

Анализ данных

Доставка проекта

Предыдущий: Секвенирование ДНК/РНК – секвенатор Illumina

Следующий: Секвенирование специфичных локусных амплифицированных фрагментов (SLAF-Seq)

Оценка качества данных образца ДНК

Таблица 1. Статистика по чистым данным.

БМКИД	сыройSeqNum	сырсумбасе	ОчиститьSeqNum	CleanSumBase	очиститьN50Len	очиститьN90Len	CleanMeanLen	чистыйМаксЛен	CleanMeanQual
ДНК_BMK01	1 218 239	26.37	1 121 736	25.90	28 014	15 764	23 090	143 181	9

Оценка качества данных образца РНК

Таблица 1. Статистика по чистым данным.

Имя файла	ID клиента	ReadNum	Базенум	Н50	Средняя длина	Максимальная длина	Средний Qscore
РНК_BMK001	C2	8 947 708	4 047 230 083	398	452	129 227	Вопрос 12