Продукты

Пространственный транскриптом BMKMANU S1000

Пространственная организация клеток играет жизненно важную роль в различных биологических процессах, таких как иммунная инфильтрация, развитие эмбрионов и т. д. Пространственное секвенирование транскриптома, которое показывает профилирование экспрессии генов, сохраняя при этом информацию о пространственном положении, дает большое представление об архитектуре тканей на уровне транскриптома.С развитием технологий необходимо изучать сверхчеткую морфологию тканей и реальные структурные различия пространственной молекулярной экспрессии с более высоким разрешением.BMKGENE предоставляет комплексную универсальную услугу пространственного секвенирования транскриптома, от образцов до биологических данных.

Технологии пространственной транскриптомики открыли новые перспективы в разнообразной области исследований, разрешив профиль экспрессии генов с пространственным содержанием в гетерогенных образцах.

Чип пространственного транскриптома: BMKMANU S1000

Платформа: Платформа Illumina NovaSeq

Связаться с нами

Детали услуги

Биоинформатика

Демонстрационные результаты

Техническая схема пространственного транскриптома BMKMANU S1000

Преимущества BMKMANU S1000

1) Субклеточное разрешение: каждая область захвата содержала >2 миллионов пространственных пятен со штрих-кодом диаметром 2,5 мкм и расстоянием между центрами пятен 5 мкм, что позволяло проводить пространственный транскриптомный анализ с субклеточным разрешением (5 мкм).

2) Анализ с многоуровневым разрешением: гибкий многоуровневый анализ в диапазоне от 100 мкм до 5 мкм для определения различных характеристик ткани с оптимальным разрешением.

3) Комплексное профилирование транскриптома: транскрипты, захваченные со всего предметного стекла, можно анализировать без ограничений по количеству целевых генов и целевой области.

Технические характеристики услуги

Библиотека	Стратегия секвенирования	Рекомендуется вывод данных
Библиотека кДНК S1000	BMKMANU S1000-Illumina PE150	60 ГБ/выборка

Примеры требований

Образец	Число	Размер	Качество РНК
Встроенный тканевый блок ОКТ	2-3 блока/образец	Прибл.6,8x6,8x6,8 мм³	РИН≥7

Для получения более подробной информации о руководстве по подготовке проб и рабочем процессе обслуживания, пожалуйста, свяжитесь сэксперт БМКГЕНЕ

Рабочий процесс обслуживания

Дизайн эксперимента

Доставка образца

Предварительный эксперимент

Пространственное штрих-кодирование

Строительство библиотеки

Последовательность действий

Анализ данных

Послепродажное обслуживание

Предыдущий: 10 пространственных транскриптомов Genomics Visium

Следующий: Полногеномное секвенирование растений/животных

Данные, генерируемые BMKMANU S1000, анализируются с использованием программного обеспечения «BSTMatrix», независимо разработанного BMKGENE, включая:

1) Генерация матрицы экспрессии генов
2) Обработка изображений HE
3) Совместимость со сторонним программным обеспечением для анализа.
4) Онлайн «BSTViewer» помогает получить результаты визуализации в разном разрешении.

1. Точечная кластеризация

с1000 (4)