● Доступно несколько стратегий секвенирования для разных целей исследования.
● Полный геном бактерий с гарантированным нулевым пробелом.
● Имеет большой опыт сборки геномов бактерий: собрано более 10 000 полных геномов.
● Профессиональная команда послепродажной технической поддержки, выполняющая более конкретные исследовательские потребности.
Последовательность действийСтратегия | Библиотека | Качество гарантировано | Ориентировочное время выполнения |
Нанопор 100X + Иллюмина 50X | Нанопор 20К ПЭ150 | 0 разрыв | 30 дней |
ПакБио HiFi 30X | ПакБио 10К |
● Контроль качества исходных данных.
● Сборка генома
● Анализ компонентов генома.
● Аннотация функции гена.
● Сравнительный геномный анализ
Дляэкстракты ДНК:
Тип образца | Количество | Концентрация | Чистота |
экстракты ДНК | > 2 мкг | > 20 нг/мкл | ОД260/280= 1,6-2,5 |
Для образцов тканей:
Тип образца | Рекомендуемая обработка образца | Хранение и отправка образцов |
Бактерии | Наблюдайте за бактериями под микроскопом и собирайте бактерии в их экспоненциальной фазе. Перенесите культуру бактерий (содержащую примерно 3-4,5e9 клеток) в эппендорф объемом 1,5 или 2 мл.(Держись на льду) Центрифугируйте пробирку в течение 1 минуты при 14000 g для сбора бактерий и осторожно удалите надосадочную жидкость. Закройте пробирку и заморозьте бактерии в жидком азоте не менее 30 мин.Храните пробирку в холодильнике при температуре -80 ℃. | Заморозьте образцы в жидком азоте на 3-4 часа и храните в жидком азоте или при -80 градусах для длительного хранения.Требуется доставка образцов с сухим льдом. |
1.Цирк генома бактерий.
2. Предсказание кодирования генов.
3.Сравнительный геномный анализ: филогенетическое древо.