-
Secvențierea ARNm de lungime completă-Nanopore
Secvențierea ARN a fost un instrument neprețuit pentru analiza cuprinzătoare a transcriptomului.Fără îndoială, secvențierea tradițională de citire scurtă a realizat numeroase dezvoltări importante aici.Cu toate acestea, întâmpină adesea limitări în identificarea izoformelor de lungime completă, cuantificarea, biasul PCR.
Secvențierea Nanopore se distinge de alte platforme de secvențiere, prin faptul că nucleotidele sunt citite direct fără sinteza ADN și generează citire lungă la zeci de kilobaze.Acest lucru împuternicește citirea directă încrucișarea transcrierilor întregi și abordarea provocărilor din studiile la nivel de izoforme.
Platformă：Nanopore PromethION
Bibliotecă:cADN-PCR
-
De novo Secvențierea transcriptomului complet -PacBio
De novosecvențierea transcriptomului de lungime completă, cunoscută și caDe novoIso-Seq beneficiază de avantajele secvencerului PacBio în ceea ce privește lungimea de citire, care permite secvențierea moleculelor de ADNc de lungime completă fără întreruperi.Acest lucru evită complet orice erori generate în etapele de asamblare a transcripției și construiește seturi unigene cu rezoluție la nivel de izoformă.Acest set unigen oferă informații genetice puternice ca „genom de referință” la nivel de transcriptom.În plus, combinând cu datele de secvențiere de generație următoare, acest serviciu permite o cuantificare precisă a expresiei la nivel de izoforme.
Platformă: PacBio Sequel IIBibliotecă: SMRT bell library -
Secvențierea ARNm eucariotic-Illumina
Secvențierea ARNm permite profilarea tuturor ARNm-urilor transcriptate din celule în condiții specifice.Este o tehnologie puternică pentru dezvăluirea profilului de expresie a genelor, a structurilor genelor și a mecanismelor moleculare ale anumitor procese biologice.Până în prezent, secvențierea ARNm a fost utilizată pe scară largă în cercetarea fundamentală, diagnosticarea clinică, dezvoltarea medicamentelor etc.
Platformă: Illumina NovaSeq 6000
-
Secvențierea ARNm pe bază de non-referință-Illumina
Secvențierea ARNm adoptă tehnica de secvențiere de generație următoare (NGS) pentru a capta ARN-ul mesager (ARNm) din forma eucariotă la o anumită perioadă în care unele funcții speciale sunt activate.Cea mai lungă transcriere îmbinată a fost numită „Unigene” și folosită ca secvență de referință pentru analiza ulterioară, care este un mijloc eficient de a studia mecanismul molecular și rețeaua de reglementare a speciei fără referință.
După asamblarea datelor transcriptomului și adnotarea funcțională unigenă
(1) Analiza SNP, analiza SSR, predicția CDS și structura genei vor fi preformate.
(2) Se va efectua cuantificarea expresiei unogene în fiecare probă.
(3) Unigenele exprimate diferențiat între probe (sau grupuri) vor fi descoperite pe baza expresiei unigene
(4) Se vor efectua analize de grupare, adnotare funcțională și îmbogățire a unigenelor exprimate diferențial
-
Secvențiere lungă fără codificare-Illumina
ARN-urile lungi non-coding (lncRNAs) sunt un tip de molecule de ARN cu o lungime care depășește 200 nt, care se caracterizează printr-un potențial de codare extrem de scăzut.LncRNA, ca membru cheie în ARN-urile necodificatoare, se găsește în principal în nucleu și plasmă.Dezvoltarea tehnologiei de secvențiere și a bioinformticii permite identificarea a numeroase lncRNA-uri noi și asocierea celor cu funcții biologice.Dovezile acumulate sugerează că lncRNA este implicat pe scară largă în reglarea epigenetică, reglarea transcripției și reglarea post-transcripție.
-
Secvențierea ARN mic-Illumina
ARN mic se referă la o clasă de molecule de ARN necodificatoare care au, de obicei, o lungime mai mică de 200nt, inclusiv micro ARN (miARN), ARN de interferență mic (siRNA) și ARN-ul piwi-interacting (piRNA).
MicroARN (miARN) este o clasă de ARN endogen mic, cu o lungime de aproximativ 20-24nt, care joacă o varietate de roluri importante de reglare în celule.miARN implicat în multe procese ale vieții care dezvăluie expresia specifică a țesutului și stadiului specific și foarte conservat la diferite specii.
-
secvențierea circARN-Illumina
Secvențierea întregului transcriptom este concepută pentru a profila toate tipurile de molecule de ARN, inclusiv ARN-urile codificatoare (ARNm) și necodificante (inclusiv ARNlnc, ARN-circ și miARN) care sunt transcrise de celule specifice la un anumit moment.Secvențierea întregului transcriptom, cunoscută și sub denumirea de „secvențiere totală a ARN-ului”, urmărește să dezvăluie rețele cuprinzătoare de reglementare la nivel de transcriptom.Profitând de tehnologia NGS, secvențele de produse întregi de transcriptom sunt disponibile pentru analiza ceRNA și analiza ARN-ului comun, care oferă primul pas către caracterizarea funcțională.Dezvăluirea rețelei de reglementare a ceRNA bazată pe circRNA-miRNA-mRNA.
-
Secvențierea întregului transcriptom – Illumina
Secvențierea întregului transcriptom este concepută pentru a profila toate tipurile de molecule de ARN, inclusiv ARN-urile codificatoare (ARNm) și necodificante (inclusiv ARNlnc, ARN-circ și miARN) care sunt transcrise de celule specifice la un anumit moment.Secvențierea întregului transcriptom, cunoscută și sub denumirea de „secvențiere totală a ARN-ului”, urmărește să dezvăluie rețele cuprinzătoare de reglementare la nivel de transcriptom.Profitând de tehnologia NGS, secvențele de produse întregi de transcriptom sunt disponibile pentru analiza ceRNA și analiza ARN-ului comun, care oferă primul pas către caracterizarea funcțională.Dezvăluirea rețelei de reglementare a ceRNA bazată pe circRNA-miRNA-mRNA.
-
Secvențierea ARN procariotic
Secvențierea ARN procariotic folosește secvențierea de generație următoare (NGS) pentru a dezvălui prezența și cantitatea de ARN la un moment dat, prin analizarea transcriptomului celular în schimbare.Secvențierea ARN-ului procariotic a companiei noastre vizează în mod special procariotele cu genomi de referință, oferindu-vă profilarea transcriptomului, analiza structurii genelor etc. A fost aplicată pe scară largă cercetării științifice de bază, cercetării și dezvoltării medicamentelor și multe altele.
Platformă: Illumina NovaSeq 6000
-
Secvențierea metatranscriptomului
Secvențierea metatranscriptomului identifică expresia genetică a microbilor (atât eucariote, cât și procariote) în mediile naturale (de exemplu, sol, apă, mare, fecale și intestin.). În mod specific, acest serviciu vă permite să obțineți profilarea expresiei genice întregi a comunităților microbiene complexe, analiză taxonomică. a speciilor, analiza de îmbogățire funcțională a genelor exprimate diferit și multe altele.
Platformă: Illumina NovaSeq 6000
