-
BSA
Platforma Bulked Segregant Analysis constă dintr-o analiză standard într-un singur pas și analiză avansată cu setare personalizată a parametrilor.BSA este o tehnică folosită pentru a identifica rapid markerii genetici asociați cu fenotipul.Fluxul de lucru principal al BSA conține: 1. selectarea a două grupuri de indivizi cu fenotipuri extrem de opuse;2. reunirea ADN-ului, ARN-ului sau SLAF-seq (dezvoltat de Biomarker) tuturor indivizilor pentru a forma două cantități mari de ADN;3. identificarea secvențelor diferențiale față de genomul de referință sau între ele, 4. predicția regiunilor candidate legate prin algoritmul ED și SNP-index;5. Analiza funcțională și îmbogățirea genelor din regiunile candidate, etc. Sunt disponibile, de asemenea, extrageri mai avansate de date, inclusiv screeningul markerului genetic și designul primerului.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Platforma Amplicon (16S/18S/ITS) este dezvoltată cu ani de experiență în analiza proiectelor de diversitate microbiană, care conține analiză de bază standardizată și analiză personalizată: analiza de bază acoperă conținutul de analiză principal al cercetării microbiene curente, conținutul analizei este bogat și cuprinzător, iar rezultatele analizelor sunt prezentate sub formă de rapoarte de proiect;Conținutul analizei personalizate este divers.Eșantioanele pot fi selectate și parametrii pot fi setați în mod flexibil în funcție de raportul de analiză de bază și scopul cercetării, pentru a realiza cerințe personalizate.Sistem de operare Windows, simplu si rapid.
-
Genetica evoluționistă
Genetica evolutivă este un serviciu de secvențiere complet conceput pentru a oferi o interpretare cuprinzătoare a informațiilor evolutive ale materialelor date pe baza variațiilor genetice, inclusiv SNP, InDels, SV și CNV.Oferă toate analizele fundamentale necesare pentru descrierea modificărilor evolutive și a caracteristicilor genetice ale populațiilor, cum ar fi structura populației, diversitatea genetică, relațiile de filogeneză etc. Conține, de asemenea, studii asupra fluxului de gene, care permite estimarea mărimii efective a populației, a timpului de divergență.
-
Genomica comparativă
Genomica comparativă înseamnă literalmente compararea secvențelor și structurilor complete ale genomului diferitelor specii.Această disciplină își propune să dezvăluie evoluția speciilor, funcția genelor, mecanismul de reglare a genelor la nivel de genom prin identificarea structurilor secvențelor și a elementelor care s-au conservat sau s-au diferențiat în diferite specii.Studiul genomic comparativ tipic include analize în familia de gene, dezvoltarea evolutivă, duplicarea întregului genom, presiunea selectivă etc.
-
Genetica evoluționistă
Platforma de analiză genetică a populației și evolutivă este stabilită pe baza experienței masive acumulate în cadrul echipei de cercetare și dezvoltare BMK de ani de zile.Este un instrument ușor de utilizat, în special pentru cercetătorii care nu sunt specializați în bioinformatică.Această platformă permite analize de bază legate de genetica evolutivă, inclusiv construcția arborelui filogenetic, analiza dezechilibrului legăturii, evaluarea diversității genetice, analiza selectivă, analiza rudeniei, PCA, analiza structurii populației etc.
-
Ansamblu genom bazat pe Hi-C
Hi-C este o metodă concepută pentru a capta configurația cromozomilor prin combinarea interacțiunilor bazate pe sondarea proximității și secvențierea de mare debit.Se crede că intensitatea acestor interacțiuni este corelată negativ cu distanța fizică pe cromozomi.Prin urmare, datele Hi-C ar putea ghida gruparea, ordonarea și orientarea secvențelor asamblate într-o schiță de genom și ancorarea acestora pe un anumit număr de cromozomi.Această tehnologie împuternicește un ansamblu de genom la nivel de cromozom în absența hărții genetice bazate pe populație.Fiecare genom are nevoie de un Hi-C.
Platformă: Platforma Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Secvențierea genomului de plantă/animal De Novo
De Novosecvențierea se referă la construcția întregului genom al unei specii folosind tehnologii de secvențiere, de exemplu PacBio, Nanopore, NGS etc., în absența unui genom de referință.Îmbunătățirea remarcabilă a lungimii de citire a tehnologiilor de secvențiere de a treia generație a adus noi oportunități în asamblarea genomilor complexe, cum ar fi cei cu heterozigozitate ridicată, raport mare de regiuni repetitive, poliploide etc. Cu lungimea de citire la nivel de zeci de kilobaze, aceste citiri de secvențiere permit rezolvarea elementelor repetitive, a regiunilor cu conținut anormal de GC și a altor regiuni extrem de complexe.
Platformă: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/Illumina NovaSeq Platform
-
Secvențierea întregului exom uman
Secvențierea întregului exom (WES) este considerată o strategie de secvențiere rentabilă pentru identificarea mutațiilor care cauzează boli.Deși exonii ocupă doar aproximativ 1,7% din întregul genom, ei reprezintă direct profilul funcțiilor totale ale proteinei.În genomul uman, s-a raportat că mai mult de 85% dintre mutațiile legate de boală apar în regiunea de codificare a proteinei.
BMKGENE oferă servicii complete și flexibile de secvențiere a întregului exom uman cu diferite strategii de captare a exonilor disponibile pentru a îndeplini diferite obiective de cercetare.
Platformă: Platforma Illumina NovaSeq
-
Secvențierea fragmentelor amplificate în loc specific (SLAF-Seq)
Genotiparea cu randament ridicat, în special pe populația la scară largă, este un pas fundamental în studiile de asociere genetică, care oferă o bază genetică pentru descoperirea genelor funcționale, analiza evolutivă etc. ) este introdus pentru a minimiza costul de secvențiere per probă, menținând în același timp eficiența rezonabilă în descoperirea markerilor genetici.Acest lucru se realizează în mod obișnuit prin extragerea fragmentului de restricție în intervalul de dimensiuni dat, care este numit bibliotecă de reprezentare redusă (RRL).Secvențierea fragmentelor amplificate cu locus specific (SLAF-Seq) este o strategie dezvoltată de sine pentru genotiparea SNP cu sau fără genom de referință.
Platformă: Platforma Illumina NovaSeq -
Illumina și BGI
Tehnologia de secvențiere Illumina, bazată pe Sequencing by Synthesis (SBS), este o inovație NGS adoptată la nivel global, responsabilă pentru generarea a peste 90% din datele de secvențiere din lume.Principiul SBS implică imagistica terminatoare reversibile marcate fluorescent pe măsură ce fiecare dNTP este adăugat și ulterior scindat pentru a permite încorporarea următoarei baze.Cu toate cele patru dNTP-uri reversibile legate de terminator prezente în fiecare ciclu de secvențiere, competiția naturală minimizează părtinirea încorporarii.Această tehnologie versatilă acceptă atât biblioteci cu citire unică, cât și biblioteci cu sfârșit pereche, găzduind o gamă largă de aplicații genomice.Capacitățile de mare debit și precizia secvențierii Illumina o poziționează ca o piatră de temelie în cercetarea genomică, dând putere oamenilor de știință să dezvăluie complexitățile genomului cu detalii și eficiență de neegalat.
DNBSEQ, dezvoltat de BGI, este o altă tehnologie inovatoare NGS care a reușit să scadă și mai mult costurile de secvențiere și să crească debitul.Pregătirea bibliotecilor DNBSEQ implică fragmentarea ADN-ului, prepararea ssDNA și amplificarea cercului rulant pentru a obține nanobsfere de ADN (DNB).Acestea sunt apoi încărcate pe o suprafață solidă și ulterior secvențiate prin sinteza combinatorie sondă-ancoră (cPAS).
Serviciul nostru de secvențiere a bibliotecii prefabricat facilitează clienților să își pregătească bibliotecile de secvențiere din diverse surse (ARNm, genom întreg, amplicon, printre altele).Ulterior, aceste biblioteci pot fi expediate către centrele noastre de secvențiere pentru controlul calității și secvențierea în platformele Illumina sau BGI.
