-
Secvențierea metatranscriptomului
Secvențierea metatranscriptomului identifică expresia genică a microbilor (atât eucariote, cât și procariote) în mediile naturale (de exemplu, sol, apă, mare, fecale și intestin.). În mod specific, acest serviciu vă permite să obțineți profilarea expresiei genice întregi a comunităților microbiene complexe, analiză taxonomică. a speciilor, analiza de îmbogățire funcțională a genelor exprimate diferit și multe altele.
Platformă: Platforma Illumina NovaSeq
-
Genomul fungic
Tehnologiile Biomarker oferă studiul genomului, genomul fin și genomul complet al ciupercilor, în funcție de obiectivul specific al cercetării.Secvențierea, asamblarea și adnotarea funcțională a genomului pot fi realizate prin combinarea secvențierii de generație următoare + secvențierea a treia generație pentru a obține asamblarea genomului la nivel înalt.Tehnologia Hi-C poate fi, de asemenea, utilizată pentru a facilita asamblarea genomului la nivel de cromozom.
Platformă:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Platforma Illumina NovaSeq
-
Truse de instrumente
BMKCloud este o platformă bioinformatică lider care oferă o soluție unică pentru programele genomice, în care cercetătorii din diverse domenii au încredere, inclusiv medicale, agricole, de mediu etc. BMKCloud se angajează să furnizeze servicii integrate, fiabile și eficiente, inclusiv platforme și instrumente de analiză bioinformatică. , resurse de calcul, bază de date publică, cursuri online bioinformtice etc. BMKCloud are diverse instrumente bioinformatice utilizate frecvent, inclusiv adnotarea genelor, instrumente genetice evolutive, ncRNA, controlul calității datelor, asamblare, aliniere, extragere a datelor, mutații, statistici, generator de figuri, secvență analiza, etc.
-
Genomul complet al bacteriilor
Biomarker Technologies oferă servicii de secvențiere pentru construirea genomului complet al bacteriilor cu zero decalaj.Fluxul de lucru principal al construcției complete a genomului bacteriilor include secvențierea de a treia generație, asamblarea, adnotarea funcțională și analiza bioinformatică avansată care îndeplinește obiectivele specifice de cercetare.O profilare mai cuprinzătoare a genomului bacteriilor permite dezvăluirea mecanismelor fundamentale care stau la baza proceselor lor biologice, care ar putea oferi, de asemenea, o referință valoroasă pentru cercetările genomice la speciile eucariote superioare.
Platformă:Nanopore PromethION P48 + Platforma Illumina NovaSeq
PacBio Sequel II
-
ARN mic
ARN-urile mici sunt tipuri de ARN scurt necodificant, cu o lungime medie de 18-30 nt, incluzând miARN, siARN și piARN.S-a raportat că acești ARN mici sunt implicați în diferite procese biologice, cum ar fi degradarea ARNm, inhibarea translației, formarea heterocromatinei etc. Analiza de secvențiere a ARN-ului mic a fost aplicată pe scară largă în studiile privind dezvoltarea animalelor/plantelor, boli, virus etc. ARN-ul mic. Platforma de analiză de secvențiere constă în analiză standard și extragere avansată de date.Pe baza datelor ARN-seq, analiza standard poate realiza identificarea și predicția miARN, predicția genei țintă miARN, analiza de adnotare și expresie.Analiza avansată permite căutarea și extracția personalizată a miRNA, generarea diagramei Venn, construirea rețelei miARN și a genelor țintă.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS este o platformă de analiză de resecvențiere a întregului genom, care este dezvoltată pe baza experienței bogate în tehnologiile biomarker.Această platformă ușor de utilizat permite trimiterea rapidă a unui flux de lucru de analiză integrat prin simpla setare a câțiva parametri de bază, care se potrivesc pentru datele de secvențiere ADN generate atât de platforma Illumina, cât și de platforma de secvențiere BGI.Această platformă este implementată pe un server de calcul de înaltă performanță, care permite o analiză foarte eficientă a datelor într-un timp foarte limitat.Exploatarea datelor personalizate este disponibilă pe baza analizei standard, inclusiv interogarea genelor mutante, proiectarea primerului PCR etc.
-
ARNm (referință)
Transcriptomul este legătura dintre informațiile genetice genomice și proteomul funcției biologice.Reglarea nivelului transcripțional este cel mai important și cel mai larg studiat mod de reglare al organismelor.Secvențierea transcriptomului poate secvenționa transcriptomul în orice moment sau în orice condiție, cu o rezoluție precisă la o singură nucleotidă. Poate reflecta dinamic nivelul transcripției genelor, poate identifica și cuantifica simultan transcriptele rare și normale și poate oferi informații structurale ale probă de transcrieri specifice.
În prezent, tehnologia de secvențiere a transcriptomului a fost utilizată pe scară largă în agronomie, medicină și alte domenii de cercetare, inclusiv reglementarea dezvoltării animalelor și plantelor, adaptarea mediului, interacțiunea imună, localizarea genelor, evoluția genetică a speciilor și detectarea bolilor genetice și a tumorilor.
-
Metagenomica (NGS)
Această platformă de analiză este concepută pentru analiza datelor metagenomice ale puștilor pe baza anilor de experiență.Acesta constă în flux de lucru integrat care conține diverse analize metagenomice necesare în mod obișnuit, inclusiv procesarea datelor, studii la nivel de specie, studii la nivel de funcție a genelor, separarea metagenomului etc. , setarea parametrilor, generarea figurilor personalizate etc.
-
LncRNA
ARN-urile lungi necodificatoare (lncRNA) sunt un tip de transcrieri cu lungime mai mare de 200 nt, care nu pot codifica proteine.Dovezile acumulate sugerează că majoritatea lncRNA-urilor sunt foarte probabil să fie funcționale.Tehnologiile de secvențiere de înaltă performanță și instrumentele de analiză bioinformatică ne permit să dezvăluim secvențele lncRNA și informațiile de poziționare mai eficient și ne conduc să descoperim lncRNA-uri cu funcții de reglementare cruciale.BMKCloud este mândru să ofere clienților noștri platforma de analiză a secvențierii lncRNA pentru a realiza o analiză lncRNA rapidă, fiabilă și flexibilă.
-
GWAS
Studiul de asociere la nivelul genomului (GWAS) are ca scop identificarea variantelor genetice (genotip) care se asociază cu trăsături specifice (fenotip).Studiile GWA investighează markerii genetici care traversează întregul genom al unui număr mare de indivizi și prezic asocierile genotip-fenotip prin analize statistice la nivel de populație.Resecvențierea întregului genom poate descoperi toate variantele genetice.Cuplat cu datele fenotipice, GWAS poate fi procesat pentru a identifica SNP-uri, QTL-uri și gene candidate legate de fenotip, ceea ce susține puternic creșterea animalelor/plantelor moderne.SLAF este o strategie de secvențiere simplificată a genomului dezvoltată de sine, care descoperă markeri distribuiți la nivelul genomului, SNP.Aceste SNP, ca markeri genetici moleculari, pot fi procesate pentru studii de asociere cu trăsături vizate.Este o strategie rentabilă în identificarea trăsăturilor complexe asociate variațiilor genetice.
-
Nanopore transcriptomică de lungime completă
Izoformele alternative complexe și variabile în organisme sunt mecanisme genetice importante pentru reglarea expresiei genelor și a diversității proteinelor.Identificarea precisă a structurilor de transcriere este baza pentru studiul aprofundat al modelelor de reglare a expresiei genelor.Platforma de secvențiere Nanopore a adus cu succes studiul transcriptomic la nivel de izoforme.Această platformă de analiză este concepută pentru a analiza datele ARN-Seq generate pe platforma Nanopore pe baza genomului de referință, care realizează analize calitative și cantitative atât la nivel de genă, cât și la nivel de transcriere.
-
circ-ARN
ARN circular (ARNcirc) este un tip de ARN necodificator, despre care s-a descoperit recent că joacă un rol vital în rețelele de reglare implicate în dezvoltarea, rezistența mediului etc. Diferit de moleculele de ARN liniar, de exemplu ARNm, lncRNA, 3′ și 5′ Capetele circARN sunt unite între ele pentru a forma o structură circulară, care le salvează de digestia exonucleazei și sunt mai stabile decât majoritatea ARN-ului liniar.S-a descoperit că CircRNA are diverse funcții în reglarea expresiei genelor.CircRNA poate funcționa ca ceRNA, care leagă miARN în mod competitiv, cunoscut sub numele de burete miARN.Platforma de analiză de secvențiere CircRNA permite analiza structurii și expresiei circRNA, predicția țintei și analiza comună cu alte tipuri de molecule de ARN
