-
Secvențierea imunoprecipitării cromatinei (ChIP-seq)
ChIP-Seq oferă profiluri la nivelul genomului țintelor ADN pentru modificarea histonelor, factori de transcripție și alte proteine asociate ADN-ului.Acesta combină selectivitatea imuno-precipitării cromatinei (ChIP) pentru a recupera complexe specifice proteină-ADN, cu puterea secvențierii de generație următoare (NGS) pentru secvențierea cu randament ridicat a ADN-ului recuperat.În plus, deoarece complexele proteină-ADN sunt recuperate din celulele vii, situsurile de legare pot fi comparate în diferite tipuri de celule și țesuturi, sau în diferite condiții.Aplicațiile variază de la reglarea transcripțională la căile de dezvoltare până la mecanismele bolii și nu numai.
Platformă: Platforma Illumina NovaSeq
-
Secvențierea bisulfitului întregului genom
Metilarea ADN-ului în poziţia a cincea în citozină (5-mC) are o influenţă fundamentală asupra expresiei genelor şi activităţii celulare.Modelele anormale de metilare au fost asociate cu mai multe afecțiuni și boli, cum ar fi cancerul.WGBS a devenit standardul de aur pentru studiul metilării la nivelul întregului genom la rezoluție de bază unică.
Platformă: Platforma Illumina NovaSeq
-
Test pentru cromatina accesibilă transpozazei cu secvențiere cu randament ridicat (ATAC-seq)
ATAC-seq este o metodă de secvențiere cu randament ridicat pentru analiza accesibilității cromatinei la nivelul genomului, care este importantă pentru controlul epigenetic global al expresiei genelor.Adaptorii de secvențiere sunt inserați în regiunile cromatinei deschise prin transpozaza hiperactivă Tn5.După amplificarea PCR, se construiește o bibliotecă de secvențiere.Toate regiunile deschise de cromatină pot fi obținute într-o anumită condiție spațiu-timp, nu numai limitată la situsurile de legare ale unui factor de transcripție sau o anumită regiune modificată cu histonă.
-
Secvențierea bisulfiților cu reprezentare redusă (RRBS)
Cercetarea metilării ADN-ului a fost întotdeauna un subiect fierbinte în cercetarea bolilor și este strâns legată de expresia genelor și trăsăturile fenotipice.RRBS este o metodă precisă, eficientă și economică pentru cercetarea metilării ADN-ului.Îmbogățirea promotorului și a regiunilor insulare CpG prin clivaj enzimatic (Msp I), combinată cu secvențierea bisulfiților, asigură detectarea metilării ADN-ului de înaltă rezoluție.
Platformă: Platforma Illumina NovaSeq
