PacBio-Transcriptom de lungime întreagă (non-referință)
Luând ca intrare datele de secvențiere a izoformei Pacific Biosciences (PacBio), această aplicație este capabilă să identifice secvențe de transcriere de lungime completă (fără asamblare).Prin maparea secvențelor de lungime completă împotriva genomului de referință, transcrierile pot fi optimizate prin gene cunoscute, transcrieri, regiuni de codificare etc. În acest caz, se poate obține o identificare mai precisă a structurilor ARNm, cum ar fi splicing alternativ, etc.Analiza comună cu datele de secvențiere a transcriptomului NGS permite adnotări mai cuprinzătoare și cuantificare mai precisă a expresiei la nivel de transcriere, ceea ce beneficiază în mare măsură expresia diferențială în aval și analiza funcțională.