BMKCloud Log in
条形banner-03

Știri

Secvențierea transcriptomului de lungime completă pe bază de nanopori

Secvențierea Nanopore se distinge de alte platforme de secvențiere, prin aceea că nucleotidele sunt citite direct fără sinteza ADN și generează citiri lungi la zeci de kilobaze.Acest lucru permite citirea directă a transcrierilor complete și abordarea provocărilor din studiile transcriptomice.

√ Prejudecată scăzută specifică secvenței

√ Citirea completă a cADN-ului pentru studiile structurii genelor

√ Mai puține date necesare pentru a acoperi același număr de transcrieri

√ Identificarea mai multor izoforme per genă

√ Cuantificarea expresiei la nivel de izoforme

nanopor-1

Conducta tipică de bioinformatică

Lungime-întreaga-trans-bix-1024x254

Ultimele cazuri de succes cu tehnologiile Biomarker

1. Analizele comparative ale transcriptomilor de lungime completă dezvăluie dinamica dezvoltării tulpinii Gnetum luofuense

Jurnal: Frontiere în genetică

Publicat: martie 2021

Cuvinte cheie: Minion |Îmbinare alternativă |APA |lncRNA |Transcrieri exprimate diferențiat

Citiți textul integral

2. Mișcarea unidirecțională a ARN-urilor mici de la lăstari la rădăcini în heterogrefe interspecifice

Jurnal: Nature Plants

Publicat: ianuarie 2021

Cuvinte cheie: Nanopore |Illumina |detectarea ARNm mobil de lungime completă

3. Analiza transcriptomului de lungime completă a rădăcinilor de sparanghel dezvăluie mecanismul molecular al toleranței la sare indus de ciupercile micorizale arbusculare

Jurnal: Environmental and Experimental Botany

Publicat: ianuarie 2021

Cuvinte cheie: Minion |Transcrieri exprimate diferențiat |Factori de transcriere |Îmbinare alternativă

4. Modificări caracteristice fiziologice și transcriptom de lungime completă a rădăcinilor și frunzelor de trandafir (Rosa chinensis) ca răspuns la stresul de secetă

Jurnal: Fiziologie vegetală și celulară

Publicat: Oct. 2020

Cuvinte cheie: PromethION |Transcrieri exprimate diferențiat |Predicție funcțională |Izoforme îmbinate |TF și lncARN

5. Analiza și compararea cuprinzătoare a PacBio și secvențierea ARN pe bază de nanopori a transcriptomului Arabidopsis

Jurnal: Metoda plantelor

Publicat: aprilie 2020

Cuvinte cheie: GridION |PromethION |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |Alinierea genomului |Identificarea transcripției |Îmbinare alternativă |SSR |LncRNA |Cuantificare izoforme

Știri și Repere își propune să împărtășească cele mai recente cazuri de succes cu Biomarker Technologies, surprinzând realizări științifice noi, precum și tehnici proeminente aplicate în timpul studiului.


Ora postării: 08-ian-2022

Trimite-ne mesajul tau: