MICROBIAN
Compatibilitatea bacteriană și imobilizarea cu biochar a îmbunătățit degradarea tebuconazolului, compoziția și funcționarea microbiomului solului
Secvențierea ampliconilor 16S de lungime completă |PacBio HiFi |Diversitatea alfa |Diversitatea beta
În acest studiu, secvențierea ampliconilor 16S de lungime completă de către PacBio și analiza bioinformatică au fost furnizate de Biomarker Technologies.
Repere
Bacteriile degradante de tebuconazol imobilizate cu biochar Alcaligenes faecalis WZ-2 a fost studiată asupra eficienței biodegradării și afectează solul contaminat cu tebuconazol în comparație cu tulpina de degradare liberă WZ-2.
1. WZ-2 imobilizat cu biochar a arătat o degradare mai eficientă în tebuconazol în comparație cu WZ-2 liber prin reducerea timpului de înjumătățire al tebuconazolului în sol de la 18,7 zile la 13,3 zile.
2. WZ-2 imobilizați cu biochar au fost capabili să restabilească activitățile enzimatice microbiene native ale solului, inclusiv ureaza, dehidrogenaza și invertaza etc.
3. Profilul microbian în solul tratat cu WZ-2 imobilizat cu biochar determinat prin secvențierea 16S pe toată lungimea a susținut puternic faptul că acest sistem ar putea restabili sănătatea solului prin îmbunătățirea structurii comunității bacteriene sub contaminarea cu tebuconazol.
Experiență (referită de secvențiere)
Grupare: CK: Sol natural;T: Sol îmbrăcat cu tebuconazol;S: Tebuconazol conținut de sol cu tulpina liberă WZ-2;BC: Tebuconazol conținea sol cu biochar;BCS: Tebuconazol conținea sol cu biochar imobilizat WZ-2.
Eșantionare: extracția totală a ADN-ului din sol amplificată de primeri 16S rDNA
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) și 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),reprezentând ADNr 16S de lungime întreagă
Platformă de secvențiere: PacBio RS II
Strategia de secvențiere: citește CCS HIFI
Analiza datelor:BMKCloudPlatforma bioinformatică face peștii aurii un sistem excelent model genetic pentru fiziologia și evoluția peștilor.
Rezultat
Structura comunității microbiene din sol a fost determinată prin secvențierea ADNr 16S.Bogăția OTU și indicele de diversitate alfa, inclusiv indicii Chao1, Ace, Shannon și Simpson au fost evaluați pentru a dezvălui diversitatea speciilor în fiecare sistem.După 60 de zile de incubație, toți indicii au prezentat o tendință similară, adică tebuconazolul ar putea induce reducerea bogăției speciilor și diversității în sol.Cu toate acestea, prin adăugarea tulpinii WZ-2, comunitatea bacteriilor din sol a fost parțial recuperată atât în ceea ce privește bogăția, cât și diversitatea.S-au observat diferențe limitate între BC, BCS și CK, ceea ce indică faptul că biochar și WZ-2 imobilizat cu biochar ar putea restabili în mod eficient sănătatea biologică a solului.
Metoda de grup de perechi neponderată cu medii aritmetice (UPGMA) a fost aplicată în acest studiu pentru a arăta diversitatea beta între grupuri.După cum se arată în figura următoare, BC, BSC și CK au împărtășit un model mai similar de compoziție microbiană în comparație cu grupul T și S, ceea ce a indicat în continuare că introducerea biocharului în bioremedierea solului contaminat cu tebuconazol ar putea facilita în mare măsură recuperarea comunității microbiene din sol.
Figura.Gruparea UPGMA a comunității bacteriene la nivel de filum sub tratament diferit
Referinţă
Sun, Tong și colab.„Compatibilitatea bacteriană și imobilizarea cu biochar au îmbunătățit degradarea tebuconazolului, compoziția și funcționarea microbiomului solului.”Jurnalul de materiale periculoase398 (2020): 122941.
Știri și Repere își propune să împărtășească cele mai recente cazuri de succes cu Biomarker Technologies, surprinzând realizări științifice noi, precum și tehnici proeminente aplicate în timpul studiului.
Ora postării: 08-ian-2022