● Regiunea de codificare a proteinelor vizate: prin captarea și secvențierea regiunii de codificare a proteinei, hWES este utilizat pentru a dezvălui variante legate de structura proteinei;
● Precizie ridicată: cu adâncime mare de secvențiere, hWES facilitează detectarea variantelor comune și a variantelor rare cu frecvențe mai mici de 1%;
● Cost eficient: hWES produce aproximativ 85% din mutațiile bolii umane din 1% din genomul uman;
● Cinci proceduri QC stricte care acoperă întregul proces cu Q30>85% garantat.
Platformă
| Bibliotecă
| Strategia de captare a exonului
| Recomandați strategia de secvențiere
|
Platforma Illumina NovaSeq
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Gb 10 Gb |
Tip eșantion
| Cantitate(Qubit®)
| Volum
| Concentraţie
| Puritate (NanoDrop™) |
ADN genomic
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1,8-2,0 fără degradare, fără contaminare
|
Pentru tulburări mendeliane/boli rare: adâncime de secvențiere efectivă peste 50×
Pentru probele tumorale: adâncimea efectivă de secvențiere peste 100×
1.Statistici de aliniere
Tabelul 1 Statistica rezultatului hărții
Tabelul 2 Statisticile captării exomului
2.Detecția variației
Figura 1 Statistica SNV și InDel
3.Analiză avansată
Figura 2 Diagrama Circos a SNV și InDel dăunătoare la nivel de genom
Tabelul 3 Screening-ul genelor cauzatoare de boli