Studiul de asociere la nivelul genomului (GWAS) are ca scop identificarea variantelor genetice (genotip) care se asociază cu trăsături specifice (fenotip).Studiile GWA investighează markerii genetici care traversează întregul genom al unui număr mare de indivizi și prezic asocierile genotip-fenotip prin analize statistice la nivel de populație.Resecvențierea întregului genom poate descoperi toate variantele genetice.Cuplat cu datele fenotipice, GWAS poate fi procesat pentru a identifica SNP-uri, QTL-uri și gene candidate legate de fenotip, ceea ce susține puternic creșterea animalelor/plantelor moderne.SLAF este o strategie de secvențiere simplificată a genomului dezvoltată de sine, care descoperă markeri distribuiți la nivelul genomului, SNP.Aceste SNP, ca markeri genetici moleculari, pot fi procesate pentru studii de asociere cu trăsături vizate.Este o strategie rentabilă în identificarea trăsăturilor complexe asociate variațiilor genetice.
