Produse

Analiza asociației la nivelul genomului

Studiul de asociere la nivelul genomului (GWAS) are ca scop identificarea variantelor genetice (genotip) care se asociază cu trăsături specifice (fenotip).Studiul GWAS investighează markerii genetici care traversează întregul genom al unui număr mare de indivizi și prezice asociațiile genotip-fenotip prin analize statistice la nivel de populație.A fost aplicat pe scară largă în cercetarea bolilor umane și a exploatării genelor funcționale pe trăsături complexe ale animalelor sau plantelor.

Contactaţi-ne

Detalii serviciu

Rezultat Demo

Publicație recomandată

1. Avantajele serviciului

● Cazuri de proiecte abundente: de la înființarea sa în 2009, BMKGENE a finalizat sute de proiecte de specii în cercetarea populației GWAS, a ajutat cercetătorii să publice peste 100 de articole, iar factorul de impact cumulat a ajuns la 500.
● Analiști profesioniști.
● Ciclu scurt de analiză.
● Exploatarea precisă a datelor.

2. Specificații de service

Tip	Scara Populației	Strategia de secvențiere și profunzime
SLAF-GWAS	Numărul eșantionului ≥200	Dimensiunea genomului < 400M, cu genom ref, se recomandă WGS
		Dimensiunea genomului ≤ 1G, 100K etichete și 10X
		1G ≤ dimensiunea genomului ≤ 2G, 200K etichete și 10X
		Dimensiunea genomului > 2G, 300K etichete și 10X
WGS-GWAS	Numărul eșantionului ≥200	10X pentru fiecare probă

3. Selectarea materialului

Diferite soiuri, subspecii, rase locale/banci de gene/familii mixte/resurse sălbatice

Diferite soiuri, subspecii, rase locale

Familie cu frați jumătate/Familie cu frați întregi/resurse sălbatice

4. Analiza bioinformației

● Analiza asocierii la nivelul genomului
● Analiza și screening-ul SNP semnificativ
● Adnotarea funcțională a genei candidate

5. Fluxul de lucru al serviciului

Design experiment

Livrare mostre

extracția ARN

Construcția bibliotecii

Secvențierea

Analiza datelor

Servicii post-vânzare

Anterior: Secvențierea ARN cu un singur nucleu

Următorul:

A.Fenotip QC

Histograma distribuției de frecvență

Statistica fenotipului

b.Analiza asocierii (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

Complot QQ

Plot Manhattan

An	Jurnal	IF	Titlu
2022	NC	17.69	Baza genomică a giga-cromozomilor și giga-genomul bujorului de copac Paeonia ostii
2015	NP	7.43	Amprentele domestice ancorează regiunile genomice de importanță agronomică în boabele de soia
2018	MP	9.32	Resecvențierea întregului genom a unei colecții la nivel mondial de accesări de rapiță dezvăluie baza genetică a divergenței lor de ecotip
2022	HR	7.29	Analiza de asociere la nivelul genomului oferă perspective moleculare asupra variației naturale a mărimii semințelor de pepene verde