Produse

Genomul fungic

Tehnologiile Biomarker oferă studiul genomului, genomul fin și genomul complet al ciupercilor, în funcție de obiectivul specific al cercetării.Secvențierea, asamblarea și adnotarea funcțională a genomului pot fi realizate prin combinarea secvențierii de generație următoare + secvențierea a treia generație pentru a obține asamblarea genomului la nivel înalt.Tehnologia Hi-C poate fi, de asemenea, utilizată pentru a facilita asamblarea genomului la nivel de cromozom.

Platformă:PacBio Sequel II

Nanopore PromethION P48

Platforma Illumina NovaSeq

Contactaţi-ne

Detalii serviciu

Rezultate Demo

Avantajele serviciului

● Strategii multiple de secvențiere disponibile pentru diferite obiective de cercetare

● Foarte experimentat în asamblarea genomului ciupercilor cu peste 10.000 de genom complet pene asamblat.

● Echipa profesională de asistență tehnică post-vânzare care îndeplinește nevoi de cercetare mai specifice.

Specificații de service

Serviciu	Strategia de secvențiere	Calitate garantată	Timp de întoarcere estimat
Hartă fungică fină	Illumina 50X+Nanopore 100X	Contig N50≥2 Mb	35 de zile lucrătoare
Hartă fungică fină	PacBio HiFi 30X	Contig N50≥2 Mb	35 de zile lucrătoare
Pene fungice-hartă completă	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Raport de ancorare a cromozomilor >90%	45 de zile lucrătoare

Analize bioinformatice

● Controlul calității datelor brute

● Asamblarea genomului

● Analiza componentelor genomului

● Adnotarea funcției genelor

● Analiza genomică comparativă

Cerințe pentru mostre și livrare

Cerințe pentru eșantion:

Pentruextracte de ADN:

Tip eșantion	Cantitate	Concentraţie	Puritate
extracte de ADN	> 1,2 μg	> 20 ng/μl	OD260/280= 1,6-2,5

Pentru probele de țesut:

Tipul eșantionului

Eșantion de tratament recomandat

Depozitarea și expedierea probelor

Ciuperca unicelulară

Observați drojdia la microscop și colectați-le în faza lor exponențială

Se transferă cultura (conținând aproximativ 3-4,5e9 celule) într-un eppendorf de 1,5 sau 2 ml.(Păstrați pe gheață)

Centrifugați tubul timp de 1 min la 14000 g pentru a colecta bacteriile și îndepărtați cu grijă supernatantul

Sigilați tubul și înghețați bacteriile în azot lichid timp de cel puțin 1-3 ore.Păstrați tubul în frigider -80 ℃.

Congelați probele în azot lichid timp de 3-4 ore și depozitați în azot lichid sau -80 de grade până la rezervare pe termen lung.Este necesară expedierea probei cu gheață uscată.

Macro ciuperca

Se recomandă țesut în faza de creștere activă.

Clătiți țesutul cu apă fără endotoxine, apoi etonal 70%.

Păstrați proba în crio-tuburi.