Produse

Secvențierea ADN/ARN – Sequencer Nanopore

Secvențierea ONT este o tehnologie de secvențiere a semnalului electric în timp real cu o singură moleculă bazată pe nanopori, principiul de secvențiere al fiecărei platforme este același.ADN/ARN dublu catenar se va lega de proteina nanoporoasă încorporată în biofilm și se va desfășura sub conducerea proteinei motorii, sub acțiunea diferenței de tensiune de pe ambele părți ale biofilmului, catenele de ADN/ARN trec prin proteina canalului nanopor la un anumit rată.Datorită diferențelor de proprietăți chimice ale diferitelor baze de pe catena ADN/ARN, atunci când o singură bază sau moleculă de ADN trece prin canalul nanoporului, va provoca schimbarea diferitelor semnale electrice.Prin detectarea și corespondența acestor semnale, pot fi calculate tipurile de bază corespunzătoare și poate fi finalizată detectarea în timp real a secvenței.

Contactaţi-ne

Detalii serviciu

Rezultat Demo

Detalii serviciu Caracteristici

Platformă	Dimensiunea bibliotecii	Randamentul teoretic al datelor (per celulă)	Precizie cu o singură bază	Aplicații
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, ultralung, cDNA-PCR	70-90 Gb/celulă	85-92%	Apelare SV, De novo, Secvențiere completă, Iso-Seq, Adnotare genă, Detectarea metilării ADN-ului

Avantajele serviciului

● Peste 5 ani de experiență pe platforma de secvențiere PacBio cu mii de proiecte închise cu diverse specii.
● BMKGENE este partener oficial al Oxford Nanopore, cu certificare ARN/ADN cu platformă duală.
● Există modele obișnuite de secvențiere cu echipament complet și un randament suficient de secvențiere.
● Pe baza platformei Nanopore, au fost publicate peste 10 cercetări Denovo pe animale și plante în reviste de renume internațional.

Cerințe pentru mostre

Tip eșantion

Cantitate

Concentrație (Qubit ®)

Volum

Puritate

Alții

ADN genomic

Depinde de cerințele de date

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

Vârf clar la 260 nm, fără contaminări

Concentrația trebuie măsurată cu Qubit și Qubit/Nanopore ≤ 2

ARN total

≥1,2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5；fara contaminari

Valoarea RIN ≥7,5

Fluxul de lucru al serviciului

pregătirea unei mostre

Construcția bibliotecii

Secvențierea

Analiza datelor

Livrare de proiect

Anterior: Secvențierea ADN/ARN – Sequencer Illumina

Următorul: Secvențierea fragmentelor amplificate în loc specific (SLAF-Seq)

Evaluarea calității datelor a probei de ADN

Tabelul 1. Statistici privind datele curate.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	curatN50Len	curatN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25.90	28.014	15.764	23.090	143.181	9