1) Rezoluție sub-celulară: Fiecare zonă de captură a conținut > 2 milioane de puncte spațiale cu coduri de bare cu un diametru de 2,5 µm și o distanță de 5 µm între centrele spotului, permițând analiza transcriptomului spațial cu rezoluție sub-celulară (5 µm).
2) Analiză de rezoluție pe mai multe niveluri: Analiză flexibilă pe mai multe niveluri, variind de la 100 μm la 5 μm pentru a rezolva diverse caracteristici ale țesutului la rezoluție optimă.
3) Profilul cuprinzător al transcriptomului: Transcrierile capturate de pe întreaga lamă de țesut pot fi analizate, fără restricții privind numărul de gene țintă și zona țintă.
Bibliotecă | Strategia de secvențiere | Ieșire de date recomandată |
Biblioteca de ADNc S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Gb/probă |
Probă | Număr | mărimea | Calitatea ARN |
Bloc de țesut încorporat OCT | 2-3 blocuri/probă | Aproximativ.6,8x6,8x6,8 mm3 | RIN≥7 |
Pentru mai multe detalii despre instrucțiunile de pregătire a mostrelor și fluxul de lucru pentru service, nu ezitați să discutați cu aexpert BMKGENE
Datele generate de BMKMANU S1000 sunt analizate folosind software-ul „BSTMatrix”, care este proiectat independent de BMKGENE, incluzând:
1) Generarea matricei de expresie genică
2) Procesarea imaginii HE
3) Compatibil cu software-ul terță parte din aval pentru analiză
4) Online „BSTViewer” ajută la obținerea rezultatelor de vizualizare la diferite rezoluții.
1.Clustering spot
2.Distribuția spațială
Note: Rezoluțienivel=13 (100 µm, stânga); 7 (50 µm, dreapta)
3. Harta termică de grupare a abundenței expresiei markerului
4.Analiza datelor între probe