Sequenciamento do transcriptoma completo – Illumina
Características
● Biblioteca dupla para sequenciar o transcriptoma completo: depleção de rRNA seguida de preparação da biblioteca PE150 e seleção de tamanho seguida de preparação da biblioteca SE50
● Análise bioinformática completa de mRNA, lncRNA, circRNA e miRNA em relatórios de bioinformática separados
● Análise conjunta de todas as expressões de RNA no relatório combinado, incluindo análise de redes ceRNA.
Vantagens do serviço
●Análise aprofundada das redes regulatórias: a análise da rede ceRNA é possibilitada pelo sequenciamento conjunto de mRNA, lncRNA, circRNA e miRNA e por um exaustivo fluxo de trabalho de bioinformática.
●Anotação abrangente: usamos vários bancos de dados para anotar funcionalmente os genes expressos diferencialmente (DEGs) e realizar a análise de enriquecimento correspondente, fornecendo insights sobre os processos celulares e moleculares subjacentes à resposta do transcriptoma.
●Ampla experiência: com um histórico de fechamento com sucesso de mais de 2.000 projetos inteiros de transcriptoma em vários domínios de pesquisa, nossa equipe traz uma vasta experiência para cada projeto.
●Rigoroso controle de qualidade: implementamos pontos de controle centrais em todas as etapas, desde a preparação de amostras e bibliotecas até sequenciamento e bioinformática.Esse monitoramento meticuloso garante a entrega de resultados consistentemente de alta qualidade.
● Anotação abrangente: usamos vários bancos de dados para anotar funcionalmente os genes expressos diferencialmente (DEGs) e realizar a análise de enriquecimento correspondente, fornecendo insights sobre os processos celulares e moleculares subjacentes à resposta do transcriptoma.
●Suporte pós-venda: Nosso compromisso vai além da conclusão do projeto com um período de serviço pós-venda de 3 meses.Durante esse período, oferecemos acompanhamento do projeto, assistência na solução de problemas e sessões de perguntas e respostas para esclarecer quaisquer dúvidas relacionadas aos resultados.
Requisitos de amostra e entrega
| Biblioteca | Estratégia de sequenciamento | Dados recomendados | Controle de qualidade |
| rRNA esgotado | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Tamanho selecionado | Illumina SE50 | 10-20 milhões de leituras |
Requisitos de amostra:
Nucleotídeos:
| Conc.(ng/μl) | Quantidade (μg) | Pureza | Integridade |
| ≥ 100 | ≥ 1 | DO260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 Contaminação limitada ou inexistente de proteínas ou DNA mostrada no gel. | Plantas: RIN≥6,5 Animal: RIN≥7,0 5,0≥28S/18S≥1,0; elevação limitada ou nenhuma elevação da linha de base |
Entrega de amostra recomendada
Recipiente:
Tubo de centrífuga de 2 ml (folha de estanho não é recomendada)
Rotulagem da amostra: Grupo+réplica, por exemplo, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Envio:
1.Gelo seco: As amostras precisam ser embaladas em sacos e enterradas em gelo seco.
2.Tubos RNAstable: As amostras de RNA podem ser secas em tubo de estabilização de RNA (por exemplo, RNAstable®) e enviadas em temperatura ambiente.
Fluxo de trabalho de serviço
Projeto de experimento
Entrega de amostra
Extração de RNA
Construção de biblioteca
Sequenciamento
Análise de dados
Serviços pós-venda
Bioinformática
Visão geral da expressão de RNA
Genes diferencialmente expressos
análise de ceRNA
MiRNAs expressos diferencialmente e RNAs relacionados
Explore os avanços da pesquisa facilitados pelos serviços de sequenciamento de transcriptoma completo da BMKGene por meio de uma coleção selecionada de publicações.
Dai, Y. et al.(2022) 'Perfis de expressão abrangentes de mRNAs, lncRNAs e miRNAs na doença de Kashin-Beck identificados por sequenciamento de RNA', Molecular Omics, 18(2), pp.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al.(2022) 'Análise completa de transcriptomas de resistência ao frio de Apis cerana na montanha Changbai durante o período de inverno.', Gene, 830, pp.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) 'Priorização baseada na integração multi-Omics de redes concorrentes de regulação de RNA endógeno em câncer de pulmão de pequenas células: características moleculares e candidatos a medicamentos', Frontiers in Oncology, 12, p.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'A análise integrada dos perfis de expressão lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA revela novos insights sobre mecanismos potenciais em resposta aos nematóides das galhas no amendoim', BMC Genomics, 23(1), pp.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURAS/7.
Yan, Z. et al.(2022) 'Sequenciamento de RNA do transcriptoma completo destaca os mecanismos moleculares associados à manutenção da qualidade pós-colheita em brócolis por irradiação LED vermelho', Postharvest Biology and Technology, 188, p.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
