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Sequenciamento de mRNA completo-Nanopore
O sequenciamento de RNA tem sido uma ferramenta inestimável para análise abrangente do transcriptoma.Sem dúvida, o sequenciamento tradicional de leitura curta alcançou vários desenvolvimentos importantes aqui.No entanto, muitas vezes encontra limitações nas identificações de isoformas completas, quantificação, viés de PCR.
O sequenciamento de nanoporos se distingue de outras plataformas de sequenciamento, pois os nucleotídeos são lidos diretamente sem síntese de DNA e geram leitura longa em dezenas de quilobases.Isso permite a leitura direta cruzando transcrições completas e enfrentando os desafios em estudos em nível de isoforma.
Plataforma：Nanopore PromethION
Biblioteca:cDNA-PCR
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Sequenciamento completo do transcriptoma de novo -PacBio
De novosequenciamento completo do transcriptoma, também conhecido comoDe novoO Iso-Seq aproveita as vantagens do sequenciador PacBio em comprimento de leitura, o que permite o sequenciamento de moléculas de cDNA de comprimento total sem interrupções.Isso evita completamente quaisquer erros gerados nas etapas de montagem da transcrição e constrói conjuntos de unigenes com resolução em nível de isoforma.Esses conjuntos de unigenes fornecem informações genéticas poderosas como “genoma de referência” no nível do transcriptoma.Além disso, combinando-se com dados de sequenciamento de próxima geração, esse serviço possibilita uma quantificação precisa da expressão em nível de isoforma.
Plataforma： PacBio Sequel IIBiblioteca: biblioteca de sinos SMRT -
Sequenciamento de mRNA eucariótico - Illumina
O sequenciamento de mRNA permite o perfil de todos os mRNAs transcritos de células sob condições específicas.É uma tecnologia poderosa para revelar o perfil de expressão gênica, estruturas gênicas e mecanismos moleculares de certos processos biológicos.Até o momento, o sequenciamento de mRNA tem sido amplamente empregado em pesquisas fundamentais, diagnósticos clínicos, desenvolvimento de medicamentos, etc.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
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Sequenciamento de mRNA não baseado em referência - Illumina
O sequenciamento de mRNA adota a técnica de sequenciamento de próxima geração (NGS) para capturar o RNA mensageiro (mRNA) da forma eucariótica em um período específico em que algumas funções especiais estão sendo ativadas.O splicing de transcrição mais longo foi chamado de 'Unigene' e usado como sequência de referência para análise posterior, que é um meio eficaz para estudar o mecanismo molecular e a rede regulatória das espécies sem referência.
Após a montagem dos dados do transcriptoma e anotação funcional unigene
(1) Análise de SNP, análise de SSR, previsão de CDS e estrutura gênica serão realizadas.
(2) A quantificação da expressão unigene em cada amostra será realizada.
(3) Unigenes expressos diferencialmente entre amostras (ou grupos) serão descobertos com base na expressão unigene
(4) Agrupamento, anotação funcional e análise de enriquecimento de unigenes diferencialmente expressos serão realizados
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Sequenciamento longo sem codificação - Illumina
Os RNAs longos não codificantes (lncRNAs) são um tipo de moléculas de RNA com comprimento superior a 200 nt, que se caracterizam por um potencial de codificação extremamente baixo.LncRNA, como um membro chave em RNAs não codificantes, é encontrado principalmente no núcleo e no plasma.O desenvolvimento da tecnologia de sequenciamento e da bioinformática permite a identificação de inúmeros novos lncRNAs e associá-los a funções biológicas.Evidências acumuladas sugerem que o lncRNA está amplamente envolvido na regulação epigenética, regulação da transcrição e regulação pós-transcrição.
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Sequenciamento de RNA pequeno - Illumina
O RNA pequeno refere-se a uma classe de moléculas de RNA não codificantes que geralmente têm menos de 200 nt de comprimento, incluindo micro RNA (miRNA), RNA de interferência pequeno (siRNA) e RNA de interação com piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) é uma classe de RNA endógeno pequeno com um comprimento de cerca de 20-24nt, que desempenha uma variedade de papéis reguladores importantes nas células.miRNA envolvido em muitos processos vitais que revelam expressão tecidual – específica e de estágio – específica e altamente conservada em diferentes espécies.
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sequenciamento de circRNA-Illumina
O sequenciamento completo do transcriptoma é projetado para perfilar todos os tipos de moléculas de RNA, incluindo RNAs codificantes (mRNA) e não codificantes (incluindo lncRNA, circRNA e miRNA) que são transcritos por células específicas em um determinado momento.O sequenciamento completo do transcriptoma, também conhecido como “sequenciamento total de RNA”, visa revelar redes regulatórias abrangentes no nível do transcriptoma.Aproveitando a tecnologia NGS, sequências de produtos completos do transcriptoma estão disponíveis para análise de ceRNA e análise conjunta de RNA, que fornece o primeiro passo para a caracterização funcional.Revelando a rede reguladora de ceRNA baseado em circRNA-miRNA-mRNA.
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Sequenciamento completo do transcriptoma – Illumina
O sequenciamento completo do transcriptoma é projetado para perfilar todos os tipos de moléculas de RNA, incluindo RNAs codificantes (mRNA) e não codificantes (incluindo lncRNA, circRNA e miRNA) que são transcritos por células específicas em um determinado momento.O sequenciamento completo do transcriptoma, também conhecido como “sequenciamento total de RNA”, visa revelar redes regulatórias abrangentes no nível do transcriptoma.Aproveitando a tecnologia NGS, sequências de produtos completos do transcriptoma estão disponíveis para análise de ceRNA e análise conjunta de RNA, que fornece o primeiro passo para a caracterização funcional.Revelando a rede reguladora de ceRNA baseado em circRNA-miRNA-mRNA.
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Sequenciamento de RNA procariótico
O sequenciamento de RNA procariótico usa sequenciamento de próxima geração (NGS) para revelar a presença e a quantidade de RNA em um determinado momento, analisando a mudança do transcriptoma celular.O sequenciamento de RNA procariótico da nossa empresa visa especificamente procariontes com genomas de referência, fornecendo perfis de transcriptoma, análise de estrutura gênica, etc. Ele tem sido amplamente aplicado à pesquisa científica básica, pesquisa e desenvolvimento de medicamentos e muito mais.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
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Sequenciamento de Metatranscriptoma
O sequenciamento de metatranscriptomas identifica a expressão gênica de micróbios (tanto eucariotos quanto procariontes) em ambientes naturais (ou seja, solo, água, mar, fezes e intestino). de espécies, análise de enriquecimento funcional de genes expressos de forma diferente e muito mais.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
