Sequenciamento de RNA pequeno-Illumina
Características
● Seleção do tamanho do RNA antes da preparação da biblioteca
● Análise bioinformática centrada na previsão de miRNA e seus alvos
Vantagens do serviço
●Análise abrangente de bioinformática:permitindo a identificação de miRNAs novos e conhecidos, identificação de alvos de miRNAs e correspondente anotação funcional e enriquecimento com múltiplos bancos de dados (KEGG, GO)
●Rigoroso controle de qualidade: implementamos pontos de controle centrais em todas as etapas, desde a preparação de amostras e bibliotecas até sequenciamento e bioinformática.Esse monitoramento meticuloso garante a entrega de resultados consistentemente de alta qualidade.
●Suporte pós-venda: Nosso compromisso vai além da conclusão do projeto com um período de serviço pós-venda de 3 meses.Durante esse período, oferecemos acompanhamento do projeto, assistência na solução de problemas e sessões de perguntas e respostas para esclarecer quaisquer dúvidas relacionadas aos resultados.
●Ampla experiência: com um histórico de fechamento bem-sucedido de vários projetos de sRNA cobrindo mais de 100 espécies em vários domínios de pesquisa, nossa equipe traz uma vasta experiência para cada projeto.
Requisitos de amostra e entrega
| Biblioteca | Plataforma | Dados recomendados | Controle de qualidade de dados |
| Tamanho selecionado | Illumina SE50 | 10 milhões-20 milhões de leituras | Q30≥85% |
Requisitos de amostra:
Nucleotídeos:
| Conc.(ng/μl) | Quantidade (μg) | Pureza | Integridade |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | DO260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 Contaminação limitada ou inexistente de proteínas ou DNA mostrada no gel. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevação limitada ou nenhuma elevação da linha de base |
● Plantas:
Raiz, Caule ou Pétala: 450 mg
Folha ou Semente: 300 mg
Fruta: 1,2g
● Animal:
Coração ou Intestino: 450 mg
Vísceras ou Cérebro: 240 mg
Músculo: 600 mg
Ossos, Cabelo ou Pele: 1,5g
● Artrópodes:
Insetos: 9g
Crustáceos: 450 mg
● Sangue total: 2 tubos
● Células: 106 células
● Soro e Plasma:6ml
Entrega de amostra recomendada
Recipiente:
Tubo de centrífuga de 2 ml (folha de estanho não é recomendada)
Rotulagem da amostra: Grupo+réplica, por exemplo, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Envio:
1.Gelo seco: As amostras precisam ser embaladas em sacos e enterradas em gelo seco.
2.Tubos RNAstable: As amostras de RNA podem ser secas em tubo de estabilização de RNA (por exemplo, RNAstable®) e enviadas em temperatura ambiente.
Fluxo de trabalho de serviço
Projeto de experimento
Entrega de amostra
Extração de RNA
Construção de biblioteca
Sequenciamento
Análise de dados
Serviços pós-venda
Bioinformática
Identificação de miRNA: estrutura e profundidade
Expressão diferencial de miRNA – agrupamento hierárquico
Anotação funcional do alvo de miRNAs expressos diferencialmente
Explore os avanços da pesquisa facilitados pelos serviços de sequenciamento de sRNA da BMKGene por meio de uma coleção selecionada de publicações.
Chen, H. et al.(2023) 'Infecções virais inibem a biossíntese e fotossíntese de saponinas em Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) 'A proteína FREE1 contendo o domínio FYVE da planta associa-se a componentes do microprocessador para reprimir a biogênese do miRNA', relatórios EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) 'O MicroRNA Ame-Bantam-3p controla o desenvolvimento de pupas larvais visando o gene 8 de múltiplos domínios semelhantes ao fator de crescimento epidérmico (megf8) na abelha, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24 (6), p .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'Análise integrada de miRNA e genes associados à qualidade da carne revela que Gga-MiR-140-5p afeta a deposição de gordura intramuscular em galinhas', Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), pp.doi: 10.1159/000489649.
