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Sequenciamento de RNA de núcleo único
O avanço na captura de células únicas e na técnica de construção de bibliotecas individuais combinada com sequenciamento de alto rendimento permite estudos de expressão gênica célula por célula.Ele permite uma análise de sistema mais profunda e completa em populações de células complexas, na qual evita em grande parte o mascaramento de sua heterogeneidade, calculando a média de todas as células.
No entanto, algumas células não são adequadas para serem transformadas em suspensão unicelular, portanto, são necessários outros métodos de preparação de amostras - extração de núcleo de tecidos, ou seja, o núcleo é extraído diretamente de tecidos ou células e preparado em suspensão de núcleo único para sequenciamento celular.
A BMK fornece serviço de sequenciamento de RNA unicelular baseado em 10× Genomics ChromiumTM.Este serviço tem sido amplamente utilizado em estudos relacionados a doenças, como diferenciação de células imunológicas, heterogeneidade tumoral, desenvolvimento de tecidos, etc.
Chip de transcriptoma espacial: 10× Genômica
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Transcriptoma Espacial BMKMANU S1000
A transcriptômica espacial está na vanguarda da inovação científica, capacitando os pesquisadores a mergulhar em intrincados padrões de expressão gênica dentro dos tecidos, preservando seu contexto espacial.Em meio a diversas plataformas, a BMKGene desenvolveu o Chip Transcriptoma Espacial BMKManu S1000, ostentando umresolução aprimoradade 5µM, atingindo a faixa subcelular, e possibilitandoconfigurações de resolução multinível.O chip S1000, com aproximadamente 2 milhões de pontos, emprega micropoços revestidos com esferas carregadas com sondas de captura com código de barras espacial.Uma biblioteca de cDNA, enriquecida com códigos de barras espaciais, é preparada a partir do chip S1000 e posteriormente sequenciada na plataforma Illumina NovaSeq.A combinação de amostras com códigos de barras espaciais e UMIs garante a precisão e especificidade dos dados gerados.O atributo exclusivo do chip BMKManu S1000 reside em sua versatilidade, oferecendo configurações de resolução de vários níveis que podem ser ajustadas com precisão para diferentes tecidos e níveis de detalhe.Essa adaptabilidade posiciona o chip como uma excelente escolha para diversos estudos de transcriptômica espacial, garantindo agrupamento espacial preciso com ruído mínimo.
Usando o chip BMKManu S1000 e outras tecnologias de transcriptômica espacial, os pesquisadores podem obter uma melhor compreensão da organização espacial das células e das complexas interações moleculares que ocorrem dentro dos tecidos, fornecendo informações valiosas sobre os mecanismos subjacentes aos processos biológicos em uma ampla gama de campos, incluindo oncologia, neurociência, biologia do desenvolvimento, imunologia e estudos botânicos.
Plataforma: chip BMKManu S1000 e Illumina NovaSeq
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10x Transcriptoma Espacial Visium Genomics
A transcriptômica espacial é uma tecnologia de ponta que permite aos pesquisadores investigar padrões de expressão gênica dentro dos tecidos, preservando seu contexto espacial.Uma plataforma poderosa neste domínio é o 10x Genomics Visium acoplado ao sequenciamento Illumina.O princípio do 10X Visium reside em um chip especializado com uma área de captura designada onde as seções de tecido são colocadas.Esta área de captura contém pontos com código de barras, cada um correspondendo a uma localização espacial única dentro do tecido.As moléculas de RNA capturadas do tecido são então rotuladas com identificadores moleculares únicos (UMIs) durante o processo de transcrição reversa.Esses pontos com código de barras e UMIs permitem mapeamento espacial preciso e quantificação da expressão gênica em resolução unicelular.A combinação de amostras com códigos de barras espaciais e UMIs garante a precisão e especificidade dos dados gerados.Ao usar esta tecnologia de Transcriptômica Espacial, os pesquisadores podem obter uma compreensão mais profunda da organização espacial das células e das complexas interações moleculares que ocorrem dentro dos tecidos, oferecendo informações valiosas sobre os mecanismos subjacentes aos processos biológicos em vários campos, incluindo oncologia, neurociência, biologia do desenvolvimento, imunologia. e estudos botânicos.
Plataforma: 10X Genomics Visium e Illumina NovaSeq
