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BSA
A plataforma Bulked Segregant Analysis consiste em análise padrão de uma etapa e análise avançada com configuração de parâmetros personalizada.BSA é uma técnica empregada para identificar rapidamente marcadores genéticos associados ao fenótipo.O fluxo de trabalho principal da BSA contém: 1. seleção de dois grupos de indivíduos com fenótipos extremamente opostos;2. reunir o DNA, RNA ou SLAF-seq (desenvolvido pela Biomarker) de todos os indivíduos para formar dois volumes de DNA;3. identificar sequências diferenciais em relação ao genoma de referência ou entre elas, 4. prever regiões candidatas ligadas por ED e algoritmo de índice SNP;5. Análise funcional e enriquecimento de genes em regiões candidatas, etc. Também está disponível uma mineração mais avançada de dados, incluindo triagem de marcadores genéticos e desenho de primers.
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Amplicon (16S/18S/ITS)
A plataforma Amplicon (16S/18S/ITS) é desenvolvida com anos de experiência em análise de projetos de diversidade microbiana, que contém análise básica padronizada e análise personalizada: a análise básica cobre o conteúdo de análise principal da pesquisa microbiana atual, o conteúdo da análise é rico e abrangente, e os resultados das análises são apresentados na forma de relatórios de projeto;O conteúdo da análise personalizada é diversificado.As amostras podem ser selecionadas e os parâmetros podem ser definidos de forma flexível de acordo com o relatório de análise básica e a finalidade da pesquisa, para atender aos requisitos personalizados.Sistema operacional Windows, simples e rápido.
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Genética Evolutiva
A genética evolutiva é um serviço de sequenciamento compacto projetado para fornecer uma interpretação abrangente das informações evolutivas de determinados materiais com base em variações genéticas, incluindo SNPs, InDels, SVs e CNVs.Fornece todas as análises fundamentais necessárias para descrever mudanças evolutivas e características genéticas de populações, como estrutura populacional, diversidade genética, relações filogenéticas, etc. Também contém estudos sobre fluxo gênico, o que permite estimar o tamanho efetivo da população e o tempo de divergência.
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Genômica Comparada
Genômica comparativa significa literalmente comparar as sequências e estruturas completas do genoma de diferentes espécies.Esta disciplina visa revelar a evolução das espécies, a função dos genes, o mecanismo de regulação dos genes ao nível do genoma, identificando as estruturas de sequência e os elementos que se conservaram ou se diferenciaram em diferentes espécies.O estudo típico de genômica comparativa inclui análises na família de genes, desenvolvimento evolutivo, duplicação de todo o genoma, pressão seletiva, etc.
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Genética Evolutiva
A plataforma de análise genética populacional e evolutiva é estabelecida com base na enorme experiência acumulada na equipe de P&D da BMK durante anos.É uma ferramenta de fácil utilização, especialmente para pesquisadores que não estão se especializando em bioinformática.Esta plataforma permite análises básicas relacionadas à genética evolutiva, incluindo construção de árvores filogenéticas, análise de desequilíbrio de ligação, avaliação de diversidade genética, análise de varredura seletiva, análise de parentesco, PCA, análise de estrutura populacional, etc.
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Conjunto de genoma baseado em Hi-C
Hi-C é um método projetado para capturar a configuração cromossômica combinando sondagens de interações baseadas em proximidade e sequenciamento de alto rendimento.Acredita-se que a intensidade dessas interações esteja negativamente correlacionada com a distância física nos cromossomos.Portanto, os dados Hi-C poderiam orientar o agrupamento, ordenação e orientação de sequências montadas em um rascunho de genoma e ancorando-as em um certo número de cromossomos.Esta tecnologia permite uma montagem do genoma em nível de cromossomo na ausência de um mapa genético baseado na população.Cada genoma precisa de um Hi-C.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq / DNBSEQ
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Sequenciamento do genoma de planta/animal de novo
De novosequenciamento refere-se à construção do genoma completo de uma espécie usando tecnologias de sequenciamento, por exemplo, PacBio, Nanopore, NGS, etc., na ausência de um genoma de referência.A notável melhoria no comprimento de leitura das tecnologias de sequenciamento de terceira geração trouxe novas oportunidades na montagem de genomas complexos, como aqueles com alta heterozigosidade, alta proporção de regiões repetitivas, poliplóides, etc. resolução de elementos repetitivos, regiões com conteúdo anormal de GC e outras regiões altamente complexas.
Plataforma: Plataforma PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq
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Sequenciamento de Exoma Completo Humano
O sequenciamento completo do exoma (WES) é considerado uma estratégia de sequenciamento econômica para identificar mutações causadoras de doenças.Embora os exons ocupem apenas aproximadamente 1,7% de todo o genoma, eles representam diretamente o perfil das funções proteicas totais.No genoma humano, foi relatado que mais de 85% das mutações relacionadas a doenças ocorrem na região codificadora de proteínas.
A BMKGENE oferece serviços abrangentes e flexíveis de sequenciamento de exoma humano com diferentes estratégias de captura de éxons disponíveis para atender a vários objetivos de pesquisa.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Sequenciamento de Fragmentos Amplificados com Locus Específico (SLAF-Seq)
A genotipagem de alto rendimento, especialmente em populações em grande escala, é uma etapa fundamental nos estudos de associação genética, que fornece base genética para a descoberta funcional de genes, análise evolutiva, etc. Em vez de re-sequenciamento profundo do genoma inteiro, sequenciamento do genoma de representação reduzida (RRGS ) é introduzido para minimizar o custo de sequenciamento por amostra, ao mesmo tempo que mantém uma eficiência razoável na descoberta de marcadores genéticos.Isso geralmente é conseguido extraindo fragmentos de restrição dentro de um determinado intervalo de tamanho, que é denominado biblioteca de representação reduzida (RRL).O sequenciamento de fragmentos amplificados de locus específico (SLAF-Seq) é uma estratégia autodesenvolvida para genotipagem de SNP com ou sem um genoma de referência.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq -
Illumina e BGI
A tecnologia de sequenciamento da Illumina, baseada em Sequenciamento por Síntese (SBS), é uma inovação NGS adotada globalmente, responsável por gerar mais de 90% dos dados de sequenciamento do mundo.O princípio do SBS envolve a geração de imagens de terminadores reversíveis marcados com fluorescência à medida que cada dNTP é adicionado e subsequentemente clivado para permitir a incorporação da próxima base.Com todos os quatro dNTPs reversíveis ligados ao terminador presentes em cada ciclo de sequenciamento, a competição natural minimiza o viés de incorporação.Esta tecnologia versátil suporta bibliotecas de leitura única e de pares, atendendo a uma variedade de aplicações genômicas.As capacidades de alto rendimento e precisão do sequenciamento Illumina o posicionam como uma pedra angular na pesquisa genômica, capacitando os cientistas a desvendar as complexidades dos genomas com detalhes e eficiência incomparáveis.
DNBSEQ, desenvolvido pela BGI, é outra tecnologia NGS inovadora que conseguiu diminuir ainda mais os custos de sequenciamento e aumentar o rendimento.A preparação de bibliotecas DNBSEQ envolve fragmentação de DNA, preparação de ssDNA e amplificação por círculo rolante para obter as nanobolas de DNA (DNB).Estes são então carregados em uma superfície sólida e subsequentemente sequenciados por síntese combinatória de sonda-âncora (cPAS).
Nosso serviço de sequenciamento de bibliotecas pré-fabricadas facilita aos clientes a preparação de suas bibliotecas de sequenciamento a partir de diversas fontes (mRNA, genoma completo, amplicon, entre outros).Posteriormente, essas bibliotecas podem ser enviadas aos nossos centros de sequenciamento para controle de qualidade e sequenciamento nas plataformas Illumina ou BGI.
