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Sequenciamento Metagenômico -NGS
Metagenoma refere-se a uma coleção de material genético total de uma comunidade mista de organismos, como metagenoma ambiental, metagenoma humano, etc. Ele contém genomas de microrganismos cultiváveis e não cultiváveis.O sequenciamento metagenômico é uma ferramenta molecular utilizada para analisar materiais genômicos mistos extraídos de amostras ambientais, que fornece informações detalhadas sobre diversidade e abundância de espécies, estrutura populacional, relação filogenética, genes funcionais e rede de correlação com fatores ambientais.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
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Sequenciamento Metagenômico-Nanopore
Metagenômica é uma ferramenta molecular usada para analisar materiais genômicos mistos extraídos de amostras ambientais, que fornece informações detalhadas sobre diversidade e abundância de espécies, estrutura populacional, relação filogenética, genes funcionais e rede de correlação com fatores ambientais, etc. para estudos metagenômicos.Seu excelente desempenho no comprimento de leitura melhorou amplamente a análise metagenômica downstream, especialmente a montagem do metagenoma.Aproveitando as vantagens do comprimento de leitura, o estudo metagenômico baseado em Nanopore é capaz de obter uma montagem mais contínua em comparação com a metagenômica shotgun.Foi publicado que a metagenômica baseada em Nanopore gerou com sucesso genomas bacterianos completos e fechados a partir de microbiomas (Moss, EL, et. al,Biotecnologia da Natureza, 2020)
Plataforma:Nanopore PromethION P48
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Sequenciamento de Amplicon 16S/18S/ITS-PacBio
A subunidade no rRNA 16S e 18S contendo regiões altamente conservadas e hipervariáveis é uma impressão digital molecular perfeita para identificação de organismos procarióticos e eucarióticos.Aproveitando o sequenciamento, esses amplicons podem ser direcionados com base nas partes conservadas e as regiões hipervariáveis podem ser totalmente caracterizadas para identificação microbiana, contribuindo para estudos que abrangem análise de diversidade microbiana, taxonomia, filogenia, etc. ) o sequenciamento da plataforma PacBio permite a obtenção de leituras longas altamente precisas, que podem abranger amplicons completos (aproximadamente 1,5 Kb).A visão ampliada do campo genético melhorou muito a resolução na anotação de espécies na comunidade de bactérias ou fungos.
Plataforma:Sequela II do PacBio
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Sequenciamento de Amplicon 16S/18S/ITS-NGS
O sequenciamento do amplicon 16S/18S/ITS visa revelar a filogenia, a taxonomia e a abundância de espécies em uma comunidade microbiana, investigando produtos de PCR de marcadores genéticos domésticos que contêm partes altamente conversadas e hipervariáveis.A introdução dessas impressões digitais moleculares perfeitas por Woeses et al, (1977) permite o perfil do microbioma livre de isolamento.O sequenciamento de 16S (bactérias), 18S (fungos) e espaçador transcrito interno (ITS, fungos) permite a identificação tanto de espécies abundantes quanto de espécies raras e não identificadas.Esta tecnologia tem se tornado uma ferramenta amplamente aplicada e importante na identificação da composição microbiana diferencial em vários ambientes, como boca humana, intestinos, fezes, etc.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
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Re-sequenciação completa do genoma bacteriano e fúngico
O re-sequenciamento completo do genoma bacteriano e fúngico é uma ferramenta crítica para completar os genomas de bactérias e fungos conhecidos, bem como para comparar vários genomas ou para mapear genomas de novos organismos.É de grande importância sequenciar genomas inteiros de bactérias e fungos para gerar genomas de referência precisos, para fazer identificação microbiana e outros estudos comparativos de genoma.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
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Sequenciamento de Metatranscriptoma
O sequenciamento do metatranscriptoma identifica a expressão gênica de micróbios (eucariontes e procariontes) em ambientes naturais (ou seja, solo, água, mar, fezes e intestino). Especificamente, este serviço permite obter perfis completos de expressão gênica de comunidades microbianas complexas, análise taxonômica de espécies, análise de enriquecimento funcional de genes expressos de forma diferente e muito mais.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Genoma Fúngico
A Biomarker Technologies fornece levantamento do genoma, genoma fino e genoma completo do fungo, dependendo do objetivo específico da pesquisa.O sequenciamento, montagem e anotação funcional do genoma podem ser alcançados combinando o sequenciamento de próxima geração + o sequenciamento de terceira geração para obter a montagem do genoma de alto nível.A tecnologia Hi-C também pode ser empregada para facilitar a montagem do genoma no nível cromossômico.
Plataforma:Sequela II do PacBio
Nanopore PromethION P48
Plataforma Illumina NovaSeq
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Genoma Completo de Bactérias
A Biomarker Technologies fornece serviço de sequenciamento na construção de genoma completo de bactérias com lacuna zero.O principal fluxo de trabalho de construção completa do genoma de bactérias inclui sequenciamento de terceira geração, montagem, anotação funcional e análise bioinformática avançada, cumprindo objetivos específicos de pesquisa.Um perfil mais abrangente do genoma das bactérias permite a revelação dos mecanismos fundamentais subjacentes aos seus processos biológicos, o que também poderia fornecer uma referência valiosa para pesquisas genômicas em espécies eucarióticas superiores
Plataforma:Plataforma Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq
Sequela II do PacBio
