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Sequenciamento de imunoprecipitação de cromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq fornece perfil genômico de alvos de DNA para modificação de histonas, fatores de transcrição e outras proteínas associadas ao DNA.Ele combina a seletividade da imunoprecipitação da cromatina (ChIP) para recuperar complexos específicos de proteína-DNA, com o poder do sequenciamento de próxima geração (NGS) para sequenciamento de alto rendimento do DNA recuperado.Além disso, como os complexos proteína-DNA são recuperados de células vivas, os locais de ligação podem ser comparados em diferentes tipos de células e tecidos, ou sob diferentes condições.As aplicações variam desde a regulação transcricional até vias de desenvolvimento, mecanismos de doenças e muito mais.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Sequenciamento de bissulfito do genoma completo
A metilação do DNA na quinta posição da citosina (5-mC) tem influência fundamental na expressão gênica e na atividade celular.Padrões anormais de metilação têm sido associados a diversas condições e doenças, como o câncer.WGBS tornou-se o padrão ouro para estudar a metilação de todo o genoma em resolução de base única.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Ensaio para cromatina acessível por transposase com sequenciamento de alto rendimento (ATAC-seq)
ATAC-seq é um método de sequenciamento de alto rendimento para análise da acessibilidade da cromatina em todo o genoma, que é importante para o controle epigenético global da expressão gênica.Adaptadores de sequenciamento são inseridos em regiões abertas da cromatina pela transposase Tn5 hiperativa.Após a amplificação por PCR, uma biblioteca de sequenciamento é construída.Todas as regiões abertas da cromatina podem ser obtidas sob uma condição espaço-temporal específica, não apenas limitada aos sítios de ligação de um fator de transcrição, ou a uma determinada região modificada por histonas.
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Sequenciamento de Bissulfito de Representação Reduzida (RRBS)
A pesquisa de metilação do DNA sempre foi um tema quente na pesquisa de doenças e está intimamente relacionada à expressão genética e às características fenotípicas.RRBS é um método preciso, eficiente e econômico para pesquisa de metilação de DNA.O enriquecimento das regiões promotoras e das ilhas CpG por clivagem enzimática (Msp I), combinado com sequenciamento de bissulfito, fornece detecção de metilação de DNA de alta resolução.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
