Mapa de calor
O arquivo de dados matriciais é usado para desenho de mapa de calor, que pode filtrar, normalizar e agrupar dados matriciais.É usado principalmente para análise de agrupamento do nível de expressão gênica entre diferentes amostras.
Anotação genética
A anotação da função genética é realizada mapeando sequências no arquivo FASTA em vários bancos de dados.
Anotação genética
Ferramenta básica de pesquisa de alinhamento local
CDS_UTR_Predição
Esta ferramenta foi projetada para prever regiões codificantes (CDS) e regiões não codificantes (UTR) em determinadas sequências de transcrição com base na explosão contra banco de dados de proteínas conhecidas e previsão de ORF.
Conspiração de Manhattan
O gráfico Manhattan permite a exibição de dados com um grande número de pontos de dados.É comumente usado em estudos de associação genômica ampla (GWAS).
Circos
O diagrama CIRCOS permite a apresentação direta das distribuições SNP, InDeL, SV, CNV no genoma.
GO_Enriquecimento
TopGO é uma ferramenta projetada para enriquecimento funcional.O pacote TopGO-Bioconductor consiste em análise de expressão diferencial, análise de enriquecimento GO e visualização dos resultados.Irá gerar uma pasta com saída chamada "Graph", que contém resultados para topGO_BP, topGO_CC e topGO_MF.
WGCNA
WGCNA é um método de mineração de dados amplamente utilizado para descobrir módulos de coexpressão genética.É aplicável a vários conjuntos de dados de expressão, incluindo dados de microarranjos e dados de expressão gênica originados do sequenciamento de próxima geração.
InterProScan
Análise e classificação de sequências de proteínas InterPro
GO_KEGG_Enriquecimento
Esta ferramenta foi projetada para gerar histograma de enriquecimento GO, histograma de enriquecimento KEGG e via de enriquecimento KEGG com base no conjunto de genes fornecido e na anotação correspondente.