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Tomando como entrada dados de sequenciamento de isoformas da Pacific Biosciences (PacBio), este aplicativo é capaz de identificar sequências transcritas completas (sem montagem).Ao mapear sequências completas em relação ao genoma de referência, os transcritos podem ser otimizados por genes conhecidos, transcritos, regiões codificantes, etc. Neste caso, pode ser alcançada uma identificação mais precisa de estruturas de mRNA, como splicing alternativo, etc.A análise conjunta com dados de sequenciamento do transcriptoma NGS permite uma anotação mais abrangente e uma quantificação mais precisa na expressão no nível do transcrito, o que beneficia amplamente a expressão diferencial a jusante e a análise funcional.