Destaques
Neste webinar de duas horas, é uma grande honra termos convidado seis especialistas na área de genômica agrícola.Nossos palestrantes darão uma interpretação aprofundada de dois estudos genômicos de Rye, que foram publicados recentemente noGenética da Natureza:
1. A montagem do genoma em escala cromossômica fornece insights sobre a biologia, evolução e potencial agronômico do centeio
2. Uma montagem de genoma de alta qualidade destaca características genômicas do centeio e genes agronomicamente importantes
Além disso, estamos felizes em ter um Cientista Sênior de P&D da Biomarker Technologies para compartilhar sua experiência na montagem de novo do genoma.
Agenda
09h00 CET
Observações de boas-vindas
Zheng Hong-kun
Fundador e CEO Biomarker Technologies
Deng Xing Wang
Presidente, Escola de Ciências Agrícolas Avançadas da Universidade de Pequim
09h15
Melhorar o melhoramento do centeio, triticale e trigo através do uso de sequência genômica de referência de alta qualidade
Neste webinar, o Prof. Wang nos deu atualizações gerais sobre o status atual da pesquisa genômica de triticeae e demonstrou o sucesso e os avanços dos dois excelentes trabalhos sobre estudos do genoma do centeio, que foram publicados recentemente na Nature Genetics e apresentam toda a pesquisa. grupos liderando e contribuindo nos trabalhos.
09h25
Genômica de cereais @ IPK Gatersleben
As gramíneas de cereais da tribo Triticeae têm sido uma importante fonte de alimento nas regiões temperadas, que há muito são consideradas um ponto importante no melhoramento e melhoramento de culturas.Entre todas as espécies cultivadas, esta tribo é famosa pelas suas características genómicas extremamente complexas, incluindo grandes tamanhos de genoma, elevado teor de TEs, poliploidia, etc. Nesta sessão, o Prof. Nils Stein deu-nos uma introdução geral sobre IPK Gatersleben e o estado actual dos cereais. pesquisa genômica@IPK Gatersleben.
09h35
A montagem do genoma em escala cromossômica fornece insights sobre a biologia, evolução e potencial agronômico do centeio
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Instituto Leibniz de Genética Vegetal e Pesquisa de Planos de Culturas (IPK)O centeio (Secale cereale L.) é uma cultura cerealífera excepcionalmente resistente ao clima, amplamente utilizada para produzir variedades melhoradas de trigo através de hibridização introgressiva e possuindo todo o repertório de genes necessários para permitir a reprodução híbrida.O centeio é alógamo e apenas recentemente domesticado, o que dá aos centeios cultivados acesso a um conjunto genético selvagem diversificado e explorável.Para aumentar ainda mais o potencial agronômico do centeio, produzimos uma montagem anotada em escala cromossômica do genoma do centeio de 7,9 Mbp e validamos extensivamente sua qualidade usando um conjunto de recursos genéticos moleculares.Demonstramos aplicações deste recurso com uma ampla gama de investigações.Apresentamos descobertas sobre o isolamento genético incompleto do centeio cultivado de parentes selvagens, mecanismos de evolução estrutural do genoma, resistência a patógenos, tolerância a baixas temperaturas, sistemas de controle de fertilidade para reprodução híbrida e os benefícios de rendimento das introgressões de centeio-trigo.
10h05
Uma montagem de genoma de alta qualidade destaca características genômicas do centeio e genes agronomicamente importantes
O centeio é uma valiosa cultura alimentar e forrageira, um importante recurso genético para o melhoramento do trigo e do triticale e um material indispensável para estudos eficientes de genômica comparativa em gramíneas.Aqui, sequenciamos o genoma do centeio Weining, uma variedade de centeio chinesa de elite.Os contigs montados (7,74 Gb) representaram 98,47% do tamanho estimado do genoma (7,86 Gb), com 93,67% dos contigs (7,25 Gb) atribuídos a sete cromossomos.Elementos repetitivos constituíram 90,31% do genoma montado.Comparados aos genomas de Triticeae previamente sequenciados, os retrotransposons Daniela, Sumaya e Sumana mostraram forte expansão no centeio.Análises adicionais da montagem de Weining lançaram nova luz sobre duplicações genéticas em todo o genoma e seu impacto nos genes da biossíntese de amido, organizações físicas de loci complexos de prolamina, características de expressão gênica subjacentes ao traço de título inicial e supostas regiões e loci cromossômicos associados à domesticação no centeio.Esta sequência do genoma promete acelerar os estudos genómicos e de melhoramento genético do centeio e das culturas de cereais relacionadas.
10h35
Desafios, soluções e futuro para a montagem do genoma de novo
Genoma de alta qualidade é a base do estudo genômico.Embora o rápido desenvolvimento no sequenciamento e no algoritmo tenha possibilitado uma montagem do genoma muito mais simples e eficiente, os requisitos de precisão e integridade da montagem também estão aumentando com o aprofundamento dos objetivos de pesquisa.Nesta palestra discutirei as atuais tecnologias populares na montagem do genoma com vários casos de sucesso e darei uma olhada no desenvolvimento futuro.
Horário da postagem: 08 de janeiro de 2022