A BMKGENE forneceu serviços de sequenciamento de transcriptoma espacial para o estudo “STEEL permite delineamento de alta resolução de dados transcriptômicos espaçotemporais”, que foi publicado em Briefings in Bioinformatics.
Este estudo propôs um algoritmo não supervisionado e baseado em aprendizado múltiplo, Spatial Transcriptome cEll typE clustering (STEEL), que identifica domínios do transcriptoma espacial agrupando esferas exibindo perfis de expressão gênica altamente semelhantes e distância espacial próxima na forma de gráficos.
Uma avaliação abrangente do STEEL em conjuntos de dados transcriptômicos espaciais da plataforma 10X Visium demonstra que ele não apenas atinge uma alta resolução para caracterizar estruturas finas do cérebro do camundongo, mas também permite a integração de múltiplas lâminas de tecido analisadas individualmente em uma maior.
Com o avanço das tecnologias de transcriptoma espacial, nosso método terá grande aplicabilidade na identificação de domínios e na reconstrução de atlas de expressão gênica.
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Horário da postagem: 20 de outubro de 2023