Aprofunde-se no potencial do estudo da variedade selvagem de espécies de pesquisa, exemplificado por um caso crucial de clientes da BMKGENE.Publicado recentemente na edição deste ano do Plant Biotechnology Journal, o artigo intitulado “Genoma de Hevea brasiliensis selvagem em nível cromossômico: capacitando a reprodução assistida por genômica e desenterrando loci vitais para rendimento elevado de borracha” é uma referência valiosa.
A seringueira brasileira (Hevea brasiliensis) se destaca como uma importante fonte de borracha natural.Ao longo do último século, as metodologias tradicionais de melhoramento desencadearam um aumento notável de seis vezes na produção de borracha.No entanto, a base genética subjacente responsável pelo potencial aumento do rendimento da borracha permanece enigmática.
Este estudo iniciou a construção de um genoma em nível de cromossomo para a seringueira selvagem, empregando uma sinergia de sequenciamento de leitura longa Nanopore, sequenciamento Illumina NGS e tecnologia Hi-C.
Paralelamente, um conjunto de 147 recursos de germoplasma, abrangendo variações de alto rendimento, cepas selvagens e espécies relacionadas, foi reunido para um ressequenciamento abrangente do genoma completo (WGS) usando a plataforma Illumina.Os dados de sequenciamento resultantes foram submetidos a rigorosa análise genética populacional, permitindo a dissecação da estrutura populacional, diversidade e desequilíbrio de ligação.Esta análise esclareceu as variações de domesticação entre as populações.
Outras investigações abrangeram análises abrangendo Fst, π, D de Tajima e LD, com o objetivo de revelar sinais de seleção decorrentes da melhoria do rendimento de látex, concentrando-se principalmente em clones de Wickham.
Culminando em uma Análise de Associação de Todo o Genoma (GWAS), marcadores ligados a características de rendimento e subsequentemente genes relacionados ao rendimento foram identificados.A validação inicial revelou atividades transcricionais distintas em diferentes mutantes para dois genes ERF, proporcionando uma visão preliminar do seu significado funcional.Confirmação adicional está agendada em pesquisas futuras.
A BMKGENE se orgulha de contribuir para o extenso ressequenciamento do genoma completo desta população considerável, juntamente com um papel substancial na análise de bioinformática.Nossa vasta experiência abrange sequenciamento NGS/TGS e análise de bioinformática multiômica em uma variedade de mais de 1.000 espécies.Estamos ansiosos pela perspectiva de parceria com você em seus próximos projetos.
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Horário da postagem: 29 de agosto de 2023