● Altamente experiente: Mais de 200.000 amostras foram processadas no BMK cobrindo diversos tipos de amostras, incluindo cultura de células, tecidos, fluidos corporais, etc. e mais de 7.000 projetos de mRNA-Seq fechados cobrindo diversas áreas de pesquisa.
● Sistema de controle de qualidade rigoroso: Os principais pontos de controle de qualidade em todas as etapas, incluindo preparação de amostras, preparação de bibliotecas, sequenciamento e bioinformática, estão sob monitoramento rigoroso para fornecer resultados de alta qualidade.
● Vários bancos de dados disponíveis para anotação de funções e estudos de enriquecimento para atender diversos objetivos de pesquisa.
● Serviços pós-venda: Serviços pós-venda válidos por 3 meses após a conclusão do projeto, incluindo acompanhamento de projetos, solução de problemas, perguntas e respostas de resultados, etc.
Biblioteca | Estratégia de sequenciamento | Dados recomendados | Controle de qualidade |
Poli A enriquecido | Illumina PE150 | 6 GB | Q30≥85% |
Nucleotídeos:
Conc.(ng/μl) | Quantidade (μg) | Pureza | Integridade |
≥ 20 | ≥ 0,5 | DO260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 Contaminação limitada ou inexistente de proteínas ou DNA mostrada no gel. | Para plantas: RIN≥6,5; Para animais: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevação limitada ou nenhuma elevação da linha de base |
Tecido: Peso (seco):≥1g
*Para tecidos menores que 5 mg, recomendamos o envio de amostra de tecido congelado (em nitrogênio líquido).
Suspensão celular:Contagem de células = 3×106- 1×107
*Recomendamos enviar lisado celular congelado.Caso a contagem de células seja menor que 5×105.
Amostras de sangue:Volume≥1 ml
Microrganismo:Massa ≥ 1g
Recipiente: tubo de centrífuga de 2 ml (folha de estanho não é recomendada)
Rotulagem da amostra: Grupo+réplica, por exemplo, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Envio:
Bioinformática
Eucariótico Fluxo de trabalho de análise de sequenciamento de mRNA
Bioinformática
ØControle de qualidade de dados brutos
ØAlinhamento do genoma de referência
ØAnálise da estrutura da transcrição
ØQuantificação de expressão
ØAnálise de expressão diferencial
ØAnotação e enriquecimento de função
1.Curva de saturação de dados de mRNA
2.Análise de expressão diferencial - gráfico do vulcão
3.Anotação KEGG em DEGs
4.Classificação GO em DEGs