●Plataformas:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten e BGI-DNB-T7
●Modos de sequenciamento:PE50, PE100, PE150, PE250
●Controle de qualidade de bibliotecas antes do sequenciamento
●Sequenciamento de entrega de dados e controle de qualidade:entrega de relatório de controle de qualidade e dados brutos em formato fastq após demultiplexação e filtragem de leituras Q30.
●Versatilidade dos serviços de sequenciamento:o cliente pode optar por sequenciar por pista, célula de fluxo ou quantidade de dados.
●Versatilidade de plataformas:Bibliotecas DNB podem ser transferidas para plataformas Illumina
●Ampla experiência na plataforma de sequenciamento Illumina:com milhares de projetos fechados com diversas espécies.
●Entrega do relatório de CQ de sequenciamento:com métricas de qualidade, precisão dos dados e desempenho geral do projeto de sequenciamento.
●Processo de sequenciamento maduro:com curto tempo de resposta.
●Rigoroso controle de qualidade: implementamos requisitos rigorosos de controle de qualidade para garantir a entrega de resultados consistentemente de alta qualidade.
Quantidade de dados (X) | Concentração (qPCR/nM) | Volume |
X ≤ 50GB | ≥ 2nM | ≥ 20 μl |
50 GB ≤ X < 100 GB | ≥ 3nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 GB | ≥ 4nM | ≥ 20 μl |
Plataforma | Concentração (qPCR/nM) | Volume |
HiSeq X Dez | ≥ 2nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000SP | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5nM | ≥ 25 μl |
Além da concentração e da quantidade total, também é necessário um padrão de pico adequado.
Um relatório sobre a qualidade da biblioteca é fornecido antes do sequenciamento, avaliando a quantidade e a fragmentação da biblioteca.
Tabela 1. Estatísticas sobre dados de sequenciamento.
ID da amostra | BMKID | Leituras brutas | Dados brutos (pb) | Leituras limpas (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuição de qualidade ao longo das leituras em cada amostra
Figura 2. Distribuição de conteúdo base
Figura 3. Distribuição do conteúdo lido nos dados de sequenciamento