Transcriptoma Espacial BMKMANU S1000
Esquema Técnico do Transcriptoma Espacial BMKMANU S1000
Vantagens do BMKMANU S1000
1) Resolução subcelular: Cada área de captura continha> 2 milhões de pontos espaciais com código de barras com diâmetro de 2,5 µm e espaçamento de 5 µm entre centros de pontos, permitindo a análise do transcriptoma espacial com resolução subcelular (5 µm).
2) Análise de resolução multinível: Análise flexível multinível variando de 100 μm a 5 μm para resolver diversas características do tecido com resolução ideal.
3) Perfil abrangente do transcriptoma: As transcrições capturadas de toda a lâmina de tecido podem ser analisadas, sem restrição no número de genes alvo e na área alvo.
Especificações de serviço
| Biblioteca | Estratégia de sequenciamento | Saída de dados recomendada |
| Biblioteca de cDNA S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Gb/amostra |
Requisitos de amostra
| Amostra | Número | Tamanho | Qualidade do RNA |
| Bloco de tecido incorporado em OCT | 2-3 blocos/amostra | Aproximadamente.6,8x6,8x6,8mm3 | RIN≥7 |
Para obter mais detalhes sobre orientações de preparação de amostras e fluxo de trabalho de serviço, sinta-se à vontade para falar com umEspecialista BMKGENE
Fluxo de trabalho de serviço
Projeto de experimento
Entrega de amostra
Pré-experiência
Código de barras espacial
Construção de biblioteca
Sequenciamento
Análise de dados
Serviços pós-venda
Os dados gerados pelo BMKMANU S1000 são analisados utilizando o software “BSTMatrix”, desenvolvido de forma independente pela BMKGENE, incluindo:
1) Geração de matriz de expressão gênica
2) Processamento de imagem HE
3) Compatível com software downstream de terceiros para análise
4) O “BSTViewer” online ajuda a obter resultados de visualização em diferentes resoluções.
1. Agrupamento pontual
2.Distribuição espacial
Nnota: Resoluçãonível=13 (100 µm, esquerda); 7 (50 µm, certo)
3.Mapa de calor de agrupamento de abundância de expressão de marcador
4. Análise de dados entre amostras
