-
Metagenomic Sequencing -NGS
میټاجینوم د ژوندی موجوداتو د ګډې ټولنې ټول جینیاتي موادو ټولګه ته اشاره کوي لکه د چاپیریال میټاګینوم، انساني میټاجینوم او داسې نور. دا د کرنې وړ او غیر کرل کیدونکي مایکرو ارګانیزمونو جینومونه لري.میټاجینومیک ترتیب یو مالیکولر وسیله ده چې د چاپیریال نمونو څخه استخراج شوي مخلوط جینومیک توکي تحلیل کولو لپاره کارول کیږي، کوم چې د ډولونو تنوع او کثرت، د نفوس جوړښت، فیلوجنیټیک اړیکه، فعال جینونه او د چاپیریال فکتورونو سره د ارتباط شبکه کې تفصيلي معلومات وړاندې کوي.
پلیټ فارم:د Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
Metagenomic Sequencing- نانوپور
میټاګینومکس یو مالیکولر وسیله ده چې د چاپیریال له نمونو څخه ایستل شوي مخلوط جینومیک توکي تحلیل کولو لپاره کارول کیږي، کوم چې د ډولونو تنوع او کثرت، د نفوس جوړښت، فایلوجینیک اړیکه، فعال جینونه او د چاپیریال فکتورونو سره د ارتباط شبکه، او نور په اړه مفصل معلومات وړاندې کوي. د نانوپور ترتیب کولو پلیټ فارمونه پدې وروستیو کې معرفي شوي د میټاګینومیک مطالعاتو لپاره.د لوستلو په اوږدوالي کې د دې عالي فعالیت په پراخه کچه د لاندې جریان میټاجینومیک تحلیل ته وده ورکړه ، په ځانګړي توګه د میټاګینوم اسمبلۍ.د لوستلو اوږدوالی څخه په ګټې اخیستنې، د نانوپور پر بنسټ میټاګینومیک مطالعه د دې توان لري چې د شاټ-ګن میټاجینومکس په پرتله ډیر دوامداره مجلس ترلاسه کړي.دا خپره شوې چې د نانوپور میشته میټاګینومکس په بریالیتوب سره د مایکرو بایومونو څخه بشپړ او تړل شوي باکتریا جینومونه تولید کړي (Moss, EL, et. al.,د طبیعت بایوټیک۲۰۲۰)
پلیټ فارم:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS امپلیکون ترتیب کول-PacBio
په 16S او 18S rRNA کې فرعي واحد چې دواړه خورا خوندي او لوړ متغیر سیمې لري د پروکریوټیک او یوکریوټیک ارګانیزمونو پیژندلو لپاره د مالیکولر ګوتو نښه ده.د ترتیب کولو څخه په ګټې اخیستنې، دا امپلیکونونه د محافظت شوي برخو پراساس په نښه کیدی شي او د هایپر - متغیر سیمې په بشپړ ډول د مایکروبیل پیژندنې لپاره مشخص کیدی شي چې د مایکروبیل تنوع تحلیل ، ټیکونومي ، فیلوجیني او داسې نور پوښښ کې مرسته کوي. واحد مالیکول ریښتیني وخت (SMRT ) د PacBio پلیټ فارم ترتیب کول د خورا دقیق اوږد لوستلو ترلاسه کولو توان ورکوي ، کوم چې کولی شي د بشپړ اوږدوالي امپلیکون پوښښ کړي (شاوخوا 1.5 Kb).د جینیاتي ساحې پراخه لید د باکتریا یا فنګسي ټولنې کې د نوعې تشریح کې حل خورا ښه کړی.
پلیټ فارم:د PacBio سیکویل II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
د 16S/18S/ITS امپلیکون ترتیب هدف په مایکروبیل ټولنه کې د فیلوجیني ، ټیکونومي ، او ډولونو کثرت څرګندول دي د کور ساتنې جینیتیک مارکرونو PCR محصولاتو تحقیق کولو له لارې چې دواړه خورا متقابل او هایپر بدلیدونکي برخې لري.د Woeses et al، (1977) لخوا د دې کامل مالیکولر ګوتو نښې معرفي کول د انزوا څخه پاک مایکروبیوم پروفایل کولو ځواک ورکوي.د 16S (بکټریا)، 18S (فنګسي) او داخلي نقل شوي سپیسر (ITS، فنګسي) ترتیب کول د دواړو پراخه ډولونو او همدارنګه نادر او ناپیژندل شوي ډولونو پیژندلو ته اجازه ورکوي.دا ټیکنالوژي په بیلابیلو چاپیریالونو کې د توپیر مایکروبیل ترکیب پیژندلو کې په پراخه کچه پلي شوي او لوی وسیله ګرځیدلې ، لکه د انسان خولې ، کولمو ، ملایانو او داسې نور.
پلیټ فارم:د Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
باکتریا او فنګسي ټول جینوم بیا ترتیب کول
د باکتریا او فنګسي ټول جینوم بیا ترتیب کول د پیژندل شوي بکتیریا او فنګسي جینومونو بشپړولو لپاره یوه مهمه وسیله ده، او همدارنګه د څو جینومونو پرتله کول یا د نوي ژوندی موجوداتو جینومونو نقشه کول.دا خورا مهم دی چې د باکتریا او فنګسي ټول جینومونه ترتیب کړي ترڅو دقیق حواله جینومونه رامینځته کړي ، د مایکروبیل پیژندنې او نورو پرتله کولو جینوم مطالعات ترسره کړي.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
Metatranscriptome تسلسل
د میټاټرانسکریټوم ترتیب کول په طبیعي چاپیریال کې د میکروبونو (دواړه یوکاریوټس او پروکاریوټس) د جین څرګندونه په ګوته کوي (د بیلګې په توګه خاوره ، اوبه ، بحر ، فاضله او کولمو). د ډولونو، د مختلف ډول څرګند شوي جینونو فعال غني کولو تحلیل، او نور.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
فنګسي جینوم
د بایومارکر ټیکنالوژي د ځانګړي څیړنې هدف پورې اړه لري د جینوم سروې ، ښه جینوم او د فنګل بشپړ جینوم چمتو کوي.د جینوم ترتیب، مجلس او فعال تشریح د لوړ پوړ جینوم اسمبلۍ ترلاسه کولو لپاره د راتلونکي نسل ترتیب + دریم نسل ترتیب سره یوځای کولو سره ترلاسه کیدی شي.Hi-C ټیکنالوژي هم د کروموزوم په کچه د جینوم راټولولو اسانتیا لپاره کارول کیدی شي.
پلیټ فارم:د PacBio سیکویل II
Nanopore PromethION P48
د Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
باکتریا بشپړ جینوم
د بایومارکر ټیکنالوژي د صفر تشې سره د باکتریا بشپړ جینوم جوړولو لپاره د ترتیب کولو خدمت چمتو کوي.د باکتریا د بشپړ جینوم جوړښت اصلي کاري فلو کې د دریم نسل ترتیب کول ، مجلس ، فعال تشریح او پرمختللي بایو انفارمیټیک تحلیل شامل دي چې ځانګړي څیړنې اهداف پوره کوي.د باکتریا جینوم خورا پراخه پروفایل کول د دوی د بیولوژیکي پروسو لاندې بنسټیز میکانیزمونو څرګندولو ځواک ورکوي ، کوم چې کولی شي په لوړو یوکریوټیک ډولونو کې د جینومیک څیړنو لپاره ارزښتناکه حواله هم چمتو کړي.
پلیټ فارم:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq پلیټ فارم
د PacBio سیکویل II
