-
PacBio - بشپړ اوږدوالی 16S/18S/ITS امپلیکون ترتیب کول
امپلیکون (16S/18S/ITS) پلیټ فارم د مایکروبیل تنوع پروژې تحلیل کې د کلونو تجربې سره رامینځته شوی ، کوم چې معیاري لومړني تحلیلونه او شخصي تحلیلونه لري: بنسټیز تحلیل د اوسني مایکروبیل څیړنې اصلي جریان تحلیل مینځپانګه پوښي ، د تحلیل مینځپانګه بډایه او پراخه ده ، او د تحلیل پایلې د پروژې راپورونو په بڼه وړاندې کیږي؛د شخصي تحلیل محتويات متنوع دي.نمونې غوره کیدی شي او پیرامیټونه د لومړني تحلیلي راپور او څیړنې هدف سره سم په انعطاف سره تنظیم کیدی شي ، ترڅو د شخصي اړتیاو احساس وکړي.د وینډوز عملیاتي سیسټم، ساده او چټک.
-
PacBio - د بشپړ اوږدوالی ټرانسکریټوم (بې حواله)
د پاسیفیک بایوسینس (PacBio) Isoform تسلسل ډیټا د ان پټ په توګه اخیستل ، دا ایپ د دې وړتیا لري چې د بشپړ اوږدوالي لیږد ترتیبونه وپیژني (پرته له غونډې).د حوالې جینوم په وړاندې د بشپړ اوږدوالي ترتیبونو نقشه کولو سره، لیږدونه د پیژندل شوي جینونو، ټرانسکریپټونو، کوډ کولو سیمو او نورو په واسطه اصلاح کیدی شي. پدې حالت کې، د mRNA جوړښتونو ډیر دقیق پیژندنه، لکه د بدیل جلا کول، او نور، ترلاسه کیدی شي.د NGS ټرانسکریپټوم ترتیب کولو ډیټا سره ګډ تحلیل د لیږد په کچه په بیان کې ډیر جامع تشریح او ډیر دقیق مقدار تاییدوي ، کوم چې په لویه کچه د لاندې جریان توپیر څرګندولو او فعال تحلیلونو څخه ګټه پورته کوي.
-
Toolkits
BMKCloud یو مخکښ بایو انفارماتیک پلیټ فارم دی چې د جینومیک برنامو لپاره یو بند حل چمتو کوي ، کوم چې په پراخه کچه د څیړونکو لخوا په بیلابیلو برخو کې د طبي ، کرنې ، چاپیریال او نورو په شمول د څیړونکو لخوا باور لري. د کمپیوټینګ سرچینې، عامه ډیټابیس، بایو انفارمیټیک آنلاین کورسونه، او داسې نور. BMKCloud ډیری وختونه کارول شوي بایو انفارماتیک وسیلې لري چې پکې د جین تشریح، تکامل جینیکیک اوزار، ncRNA، د معلوماتو کیفیت کنټرول، مجلس، ترتیب، د معلوماتو استخراج، بدلونونه، احصایې، ارقام جنریټر، ترتیب تحلیل، او داسې نور
-
کوچنی RNA
کوچني RNAs د لنډ غیر کوډ کولو RNA ډول دي چې اوسط اوږدوالی یې 18-30 nt دی، پشمول miRNA، siRNA او piRNA.دا کوچني RNAs په پراخه کچه راپور شوي چې په مختلفو بیولوژیکي پروسو کې دخیل دي لکه د mRNA تخریب، د ژباړې مخنیوی، د هیټروکروماتین جوړښت، او داسې نور. د کوچني RNA ترتیب تحلیل په پراخه توګه د څارویو/نباتاتو پراختیا، ناروغۍ، ویروس، او نور په مطالعاتو کې کارول شوي. د ترتیب کولو تحلیل پلیټ فارم د معیاري تحلیل او پرمختللي ډیټا کان کیندنې څخه جوړ دی.د RNA-seq معلوماتو په اساس، معیاري تحلیل کولی شي د miRNA پیژندنه او وړاندوینه، د miRNA هدف جین وړاندوینه، تشریح او بیان تحلیل ترلاسه کړي.پرمختللی تحلیل د دودیز miRNA لټون او استخراج ، د وین ډیاګرام نسل ، miRNA او هدف جین شبکې رامینځته کول وړوي.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS د بشپړ جینوم بیا ترتیب کولو تحلیل پلیټ فارم دی ، کوم چې د بایومارکر ټیکنالوژیو کې د بډایه تجربې پراساس رامینځته شوی.دا د کارولو اسانه پلیټ فارم په ساده ډول د یو څو لومړني پیرامیټرو په ترتیب کولو سره د مدغم تحلیل کاري فلو ګړندي سپارلو ته اجازه ورکوي ، کوم چې د Illumina پلیټ فارم او BGI تسلسل پلیټ فارم څخه رامینځته شوي د DNA ترتیب کولو ډیټا لپاره فټ کیږي.دا پلیټ فارم د لوړ فعالیت کمپیوټري سرور کې ځای په ځای شوی ، کوم چې په خورا محدود وخت کې خورا مؤثره ډیټا تحلیل ځواکوي.شخصي شوي ډیټا کان کیندنه د معیاري تحلیل په اساس شتون لري ، پشمول د بدل شوي جین پوښتنې ، د PCR پریمر ډیزاین ، او داسې نور.
-
mRNA (حواله)
ټرانسکریټوم د جینومیک جنیټیک معلوماتو او د بیولوژیکي فعالیت پروټوم ترمنځ اړیکه ده.د انتقالي کچې مقررات د ژوندی موجوداتو ترټولو مهم او په پراخه کچه مطالعه شوي مقرراتو طریقه ده.د ټرانسکریپټوم ترتیب کول کولی شي ټرانسکریپټوم په هر وخت کې یا په هر حالت کې ترتیب کړي، د یو واحد نیوکلیوټایډ لپاره دقیق ریزولوشن سره. دا کولی شي په متحرک ډول د جین لیږد کچه منعکس کړي، په ورته وخت کې نادر او نورمال لیږدونه وپیژني او اندازه کړي، او ساختماني معلومات چمتو کړي. نمونې ځانګړي لیکنې.
په اوس وخت کې، د ټرانسکریټوم ترتیب کولو ټیکنالوژي په پراخه کچه د زراعت، طب او نورو څیړنو برخو کې کارول کیږي، پشمول د څارویو او نباتاتو پراختیا مقررات، د چاپیریال تطبیق، د معافیت تعامل، د جین ځایی کول، د ډولونو جینیکیک ارتقاء او د تومور او جینیاتی ناروغیو کشف.
-
Metagenomics (NGS)
دا تحلیل پلیټ فارم د کلونو تجربو پراساس د شاټګن میټاجینومیک ډیټا تحلیل لپاره ډیزاین شوی.دا مربوط کاري فلو لري چې د عمومي اړتیا لرونکي مختلف میټاجینومیک تحلیلونه لري پشمول د ډیټا پروسس کول ، د نوعې کچې مطالعې ، د جین فعالیت کچې مطالعې ، میټاجینوم بائنینګ ، او داسې نور. سربیره پردې ، د ډیټا کان کیندنې دودیز اوزار د معیاري تحلیل کاري فلو کې شتون لري ، پشمول د جین او ډولونو پوښتنې. , د پیرامیټر ترتیب، شخصي شخصیت تولید، او داسې نور.
-
LncRNA
اوږده غیر کوډ RNAs (lncRNA) یو ډول ټرانسکریپټ دی چې اوږدوالی یې د 200 nt څخه اوږد دی، کوم چې د پروټینونو کوډ کولو توان نلري.راټول شوي شواهد وړاندیز کوي چې ډیری lncRNAs ډیر احتمال لري چې فعال وي.د لوړې کچې ترتیب کولو ټیکنالوژي او د بایو انفارماتیک تحلیلي وسیلې موږ ته دا ځواک راکوي چې د lncRNA ترتیبونه او د موقعیت معلومات په خورا مؤثره توګه څرګند کړو او موږ ته لارښوونه کوي چې د مهم تنظیمي دندو سره lncRNAs کشف کړو.BMKCloud ویاړي چې زموږ پیرودونکو ته د lncRNA تسلسل تحلیل پلیټ فارم چمتو کوي ترڅو ګړندي ، د باور وړ او انعطاف وړ lncRNA تحلیل ترلاسه کړي.
-
GWAS
د جینوم پراخه انجمن مطالعه (GWAS) موخه د جینیاتي ډولونو (جینوټایپ) پیژندل دي چې د ځانګړي ځانګړتیاو (فینوټایپ) سره تړاو لري.د GWA مطالعات د جنیټیک مارکرونو پلټنه کوي چې د لوی شمیر اشخاصو ټول جینوم څخه تیریږي او د نفوس په کچه د احصایوي تحلیلونو له لارې د جینټایپ-فینوټایپ اتحادیې وړاندوینه کوي.د بشپړ جینوم بیاکتنه کولی شي په بالقوه توګه ټول جینیاتي ډولونه کشف کړي.د فینوټائپیک ډیټا سره یوځای کول، GWAS د فینوټایپ اړوند SNPs، QTLs او کاندید جینونو پیژندلو لپاره پروسس کیدی شي، کوم چې د عصري څارویو/نباتاتو نسل پالنه په کلکه ملاتړ کوي.SLAF پخپله پرمختللې ساده جینوم ترتیب کولو ستراتیژي ده، کوم چې د جینوم په کچه ویشل شوي مارکرونه، SNP کشف کوي.دا SNPs، د مالیکول جینیکیک مارکر په توګه، د هدف شوي ځانګړتیاو سره د اتحادیې مطالعې لپاره پروسس کیدی شي.دا د جینیاتي تغیراتو سره تړلي پیچلي ځانګړتیاو په پیژندلو کې د لګښت مؤثره ستراتیژي ده.
-
نانوپور بشپړ اوږدوالی ټرانسکریټومکس
په ژوندی موجوداتو کې پیچلي او متغیر بدیل isoforms د جین بیان او د پروټین تنوع تنظیم کولو لپاره مهم جنیټیک میکانیزمونه دي.د ټرانسکریپټ جوړښتونو دقیق پیژندنه د جین بیان د تنظیم کولو نمونو د ژورې مطالعې اساس دی.د نانوپور ترتیب کولو پلیټ فارم په بریالیتوب سره د ټرانسکریټومیک مطالعه د isoform کچې ته راوړې.د دې تحلیل پلیټ فارم د نانوپور پلیټ فارم کې رامینځته شوي RNA-Seq ډیټا تحلیل کولو لپاره ډیزاین شوی چې د حوالې جینوم اساس باندې رامینځته شوی ، کوم چې د جین کچه او د لیږد په کچه دواړه کیفیتي او کمیتي تحلیلونه ترلاسه کوي.
-
circ-RNA
سرکلر RNA (circRNA) د غیر کوډ کولو RNA یو ډول دی، چې په دې وروستیو کې موندل شوي چې په تنظیمي شبکو کې مهم رول لوبوي چې په وده، چاپیریال مقاومت، او نور کې ښکیل دي. د خطي RNA مالیکولونو څخه توپیر لري، د بیلګې په توګه mRNA، lncRNA، 3′ او 5′ د circRNA پایونه سره یوځای شوي ترڅو یو سرکلر جوړښت رامینځته کړي، کوم چې دوی د Exonuclease هضم څخه ساتي او د ډیری خطي RNA په پرتله خورا مستحکم دي.CircRNA موندل شوي چې د جین بیان تنظیم کولو کې مختلف دندې لري.CircRNA کولی شي د ceRNA په توګه کار وکړي، کوم چې miRNA په سیالۍ سره تړلی، چې د miRNA سپنج په نوم پیژندل کیږي.د CircRNA تسلسل تحلیل پلیټ فارم د circRNA جوړښت او بیان تحلیل ، هدف وړاندوینه او د RNA مالیکولونو نورو ډولونو سره ګډ تحلیل ځواکوي
-
BSA
د بلک شوي سیګریګینټ تحلیل پلیټ فارم د یو ګام معیاري تحلیل او د دودیز پیرامیټر ترتیب سره پرمختللي تحلیلونه لري.BSA یو تخنیک دی چې په چټکۍ سره د فینوټایپ اړوند جینیکیک مارکرونو پیژندلو لپاره کارول کیږي.د BSA اصلي کاري جریان لري: 1. د اشخاصو دوه ګروپونه غوره کول چې خورا مخالف فینوټایپونه لري؛2. د ټولو اشخاصو DNA، RNA یا SLAF-seq (د بایومارکر لخوا رامینځته شوی) راټولول ترڅو د DNA دوه لویه برخه جوړه کړي؛3. د حوالې جینوم یا په منځ کې د توپیر ترتیبونو پیژندل، 4. د ED او SNP-index الګوریتم لخوا د کاندید سره تړلې سیمې وړاندوینه کول؛5. د نوماندانو په سیمو کې د جینونو فعالیت تحلیل او بډایه کول، او داسې نور. په ډیټا کې نور پرمختللي کان کیندنې په شمول د جینیاتي مارکر سکرینینګ او پریمر ډیزاین هم شتون لري.
