د تودوخې نقشه
د میټریکس ډیټا فایل د تودوخې نقشې ډراینګ لپاره کارول کیږي ، کوم چې کولی شي د میټریکس ډیټا فلټر ، نورمال او کلستر کړي.دا اکثرا د مختلف نمونو تر مینځ د جین بیان کچې کلستر تحلیل لپاره کارول کیږي.
د جین تشریح
د جین فنکشن تشریح د مختلف ډیټابیس په وړاندې د FASTA فایل کې د نقشو ترتیبونو سره ترسره کیږي.
د جین تشریح
د اصلي ځایي سمون لټون وسیله
CDS_UTR_ وړاندوینه
دا وسیله د پیژندل شوي پروټین ډیټابیس او ORF وړاندوینې پروړاندې د چاودنې پراساس په ورکړل شوي لیږد ترتیبونو کې د کوډ کولو سیمو (CDS) او غیر کوډ کولو سیمو (UTR) وړاندوینې لپاره ډیزاین شوې.
د منهاټن پلاټ
د مین هټن پلاټ د ډیټا ډیټا د ډیری ډیټا پوائنټونو سره د ډیټا ښودلو وړ کوي.دا عموما د جینوم پراخه اتحادیې مطالعاتو (GWAS) کې کارول کیږي.
سرکوس
د CIRCOS ډیاګرام په جینوم کې د SNP، InDeL، SV، CNV توزیع مستقیم پریزنټشن وړوي.
GO_ غني کول
TopGO یوه وسیله ده چې د فعال غني کولو لپاره ډیزاین شوې.د TopGO-Bioconductor کڅوړه د توپیر بیان تحلیل، د GO غني کولو تحلیل او د پایلو لید لري.دا به د "ګراف" په نوم د محصول سره یو فولډر رامینځته کړي، کوم چې د topGO_BP، topGO_CC او topGO_MF پایلې لري.
WGCNA
WGCNA د جین شریک بیان ماډلونو موندلو لپاره د ډیټا کان کیندنې پراخه کارول کیږي.دا د مختلف ایکسپریشن ډیټاسیټ باندې پلي کیږي پشمول د مایکروري ډیټا او د جین ایکسپریشن ډیټا د راتلونکي نسل ترتیب څخه رامینځته شوي.
InterProScan
د انټر پرو پروټین ترتیب تحلیل او طبقه بندي
GO_KEGG_بډایه کول
دا وسیله د GO د غني کولو هسټوګرام، د KEGG د غني کولو هسټوګرام او د KEGG بډایه کولو لاره د چمتو شوي جین سیټ او اړونده تشریح پراساس رامینځته کولو لپاره ډیزاین شوې.