BMKCloud Log in
条形بینر-03

محصولات

د غیر حوالې پراساس mRNA ترتیب کول - ایلومینا

د mRNA ترتیب کول د راتلونکي نسل ترتیب کولو تخنیک (NGS) غوره کوي ترڅو د رسول RNA (mRNA) شکل یوکرایوټ په ځانګړي وخت کې ونیسي چې ځینې ځانګړي فعالیتونه فعالوي.تر ټولو اوږده ټرانسکریپټ د یونیګین په نوم یادیږي او د راتلونکو تحلیلونو لپاره د حوالې ترتیب په توګه کارول کیږي، کوم چې د مایعاتو پرته د ډولونو مالیکول میکانیزم او تنظیمي شبکې مطالعې لپاره اغیزمن وسیله ده.

د ټرانسکریپټوم ډیټا اسمبلۍ او یونیګین فعال تشریح وروسته

(1) د SSR تحلیل، د CDS وړاندوینه او د جین جوړښت به مخکې جوړ شي.

(2) په هره نمونه کې د یونیګین بیان اندازه کول به ترسره شي.

(3) د نمونو (یا ګروپونو) تر مینځ په توپیر سره څرګند شوي یونیګین به د یونیګین بیان پراساس کشف شي

(4) د توپیر څرګند شوي یونیګینونو کلستر کول، فعال تشریح او بډایه کول به ترسره شي


د خدماتو توضیحات

بایو انفارماتیک

د ډیمو پایلې

د قضیې مطالعه

برخی

● د هرې حوالې جینوم څخه خپلواک،

● معلومات د لیکونو جوړښت او بیان تحلیل لپاره کارول کیدی شي

● متغیر کلیپینګ سایټونه وپیژنئ

د خدماتو ګټې

● د BMKCloud پر بنسټ د پایلو تحویل: پایلې د BMKCloud پلیټ فارم له لارې د ډیټا فایل او متقابل راپور په توګه وړاندې کیږي، کوم چې کاروونکي ته اجازه ورکوي د پیچلو تحلیلي پایلو لوستل او د معیاري بایو انفارماتیک تحلیل پر بنسټ د ډیټا کان کیندنې دودیز شوي.

● د پلور وروسته خدمتونه: د پلور وروسته خدمتونه د پروژې بشپړیدو وروسته د 3 میاشتو لپاره اعتبار لري، پشمول د پروژې تعقیب، د ستونزو حل کول، پایلې پوښتنې او ځوابونه، او نور.

د نمونې اړتیاوې او تحویلي

د نمونې اړتیاوې:

نیوکلیوټایډونه:

Conc.(ng/μl)

مقدار (μg)

پاکوالی

بشپړتیا

≥ ۲۰

≥ 0.5

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

محدود یا هیڅ پروټین یا DNA ککړتیا په جیل کې ښودل شوي.

د نباتاتو لپاره: RIN≥6.5؛

د څارویو لپاره: RIN≥7.0؛

5.0≥28S/18S≥1.0;

محدود یا هیڅ اساسی لوړوالی

نسج: وزن (وچ): ≥1 g
* د 5 ملی ګرامه څخه کوچني نسجونو لپاره ، موږ وړاندیز کوو چې فلش منجمد (مایع نایټروجن کې) نسج نمونه واستوو.

د حجرو تعلیق: د حجرو شمیر = 3 × 107
* موږ وړاندیز کوو چې منجمد سیل لیسټیټ ولیږدوو.په هغه صورت کې چې حجره له 5 × 10 څخه کوچنۍ شمیرل کیږي5په مایع نایتروجن کې منجمد فلش سپارښتنه کیږي.

د وینې نمونې:
PA×geneBloodRNATube;
6mLTRIzol او 2mL وینه (TRIzol: وینه = 3:1)

وړاندیز شوي نمونې تحویلي

کانټینر:
2 ملی لیتر سینټرفیوج ټیوب (د ټین ورق سپارښتنه نه کیږي)
د نمونې لیبل کول: ګروپ + نقل کول لکه A1, A2, A3;B1, B2, B3...

بار وړل:
1. وچه یخ: نمونې باید په کڅوړو کې بسته شي او په وچه یخ کې ښخ شي.
2.RNAstable ټیوبونه: د RNA نمونې د RNA ثبات ټیوب کې وچې کیدی شي (د بیلګې په توګه RNAstable®) او د خونې په حرارت درجه کې لیږدول کیدی شي.

د خدماتو کاري جریان

نمونه QC

د تجربې ډیزاین

د نمونې تحویل

د سپارلو نمونه

پیلوټ تجربه

د RNA استخراج

د کتابتون چمتو کول

د کتابتون جوړول

ترتیب کول

ترتیب کول

د معلوماتو تحلیل

د معلوماتو تحلیل

د پلور وروسته خدمتونه

د پلور وروسته خدمتونه


  • مخکینی:
  • بل:

  • بایو انفارماتیک

    wps_doc_11

    1.mRNA(denovo) د مجلس اصول

    د تثلیث لخوا، لوستل په کوچنیو ټوټو ویشل شوي، چې د K-mer په نوم پیژندل کیږي.دا K-mers بیا د تخمونو په توګه کارول کیږي ترڅو په کانټیګونو کې وغځول شي او بیا د کانټیګ اوورلیپینګونو پراساس اجزا.په پای کې، De Bruijn دلته په اجزاوو کې د لیکونو پیژندلو لپاره کارول شوی و.

    mRNA- (De-novo) - د تثلیث عمومي کتنه

    mRNA (De novo) د تثلیث عمومي کتنه

    2.mRNA (De novo) د جین څرګندولو کچه

    RNA-Seq د دې وړتیا لري چې د جین بیان خورا حساس اټکل ترلاسه کړي.په عموم ډول، د FPKM د لیږد د څرګندولو وړ حد د 10^-2 څخه تر 10^6 پورې دی

    mRNA-(De-novo)-توزیع-د-FPKM-کثافت-په هره نمونه کې

    mRNA (De novo) په هره نمونه کې د FPKM کثافت ویش

    3.mRNA (De novo) GO د DEGs د غني کولو تحلیل

    GO (جین اونټولوژي) ډیټابیس یو جوړښت شوی بیولوژیکي تشریح سیسټم دی چې د جین او جین محصولاتو دندو معیاري لغتونه لري.دا څو درجې لري، چیرته چې ټیټه کچه وي، دندې خورا مشخصې وي.

    mRNA-(De-novo)-GO-د-د-DEGs-د-دوهم-کچه-د طبقه بندي

    mRNA (De novo) GO په دوهمه کچه د DEGs طبقه بندي

    د BMK قضیه

    په پیاز کې د بلب پړسوب او پراختیا په جریان کې د سوکروز میټابولیزم ټرانسکریټوم تحلیل (Allium cepa L.)

    خپور شوی: د نباتاتو په ساینس کې سرحدونه2016

    د ترتیب کولو ستراتیژي

    Illumina HiSeq2500

    د نمونې ټولګه

    په دې څیړنه کې د یوتا ژیړ خوږ سپین کښت "Y1351" کارول شوی و.د راټولو شویو نمونو شمیره وه
    د بلب د پړسوب (DAS) څخه 15مه ورځ (د 2-cm قطر او 3-4 g وزن)، 30th DAS (5-cm قطر او 100-110 g وزن)، او ∼3 په 40th DAS (7-cm قطر او 260-300 ګرامه).

    کلیدي پایلې

    1. د وین ډیاګرام کې، ټولټال 146 DEGs د پراختیایي مرحلو په ټولو دریو جوړه کې کشف شوي
    2. "کاربوهایډریټ ټرانسپورټ او میټابولیزم" یوازې د 585 یونیجینز (یعنې د تشریح شوي COG 7٪) لخوا نمایش شوی.
    3.Unigenes په بریالیتوب سره د GO ډیټابیس ته تشریح شوي د بلب پراختیا د دریو مختلفو مرحلو لپاره په دریو اصلي کټګوریو کې طبقه بندي شوي.د "بیولوژیکي پروسې" اصلي کټګورۍ کې ډیری نمایندګي "میټابولیک پروسې" وې، وروسته د "حجروي پروسې" په واسطه.د "مالکولي فعالیت" په اصلي کټګورۍ کې هغه دوه کټګورۍ چې ډیری یې استازیتوب کوي "بندي" او "کټالیټیک فعالیت" وو.

    PB-بشپړ-اوږدوالی-RNA-Sequencing-د قضیې مطالعه

    د ارتوولوژس ګروپونو کلسترونو هسټوګرام (COG) طبقه بندي

    PB-بشپړ-اوږدوالی-RNA-Sequencing-د قضیې مطالعه

    د جین اونټولوژي هسټوګرام (GO) طبقه بندي د یونیجینز لپاره چې د بلب څخه اخیستل شوي په دریو پرمختیایي مرحلو کې

    PB-بشپړ-اوږدوالی-RNA-Sequencing-د قضیې مطالعه

    د وین ډیاګرام د پیاز بلب پراختیا په هر دوه مرحلو کې د جینونو توپیر څرګندوي

    حواله

    جانګ سي، جانګ ایچ، ژان زی، او نور.په پیاز کې د بلب پړسوب او پراختیا په جریان کې د سوکروز میټابولیزم ټرانسکریټوم تحلیل (Allium cepa L.)[J].د نباتاتو په ساینس کې سرحدونه، 2016، 7:1425-.DOI: 10.3389/fpls.2016.01425

    نرخ ترلاسه کړئ

    خپل پیغام دلته ولیکئ او موږ ته یې واستوئ

    خپل پیغام موږ ته واستوئ: