د جینوم ارتقاء
جینوم دی نوو
مجلس|د جنسیت تعیین د ټول ترتیب کار او جزوی بایو انفارمیټیک خدمات د بایومارکر ټیکنالوژیو لخوا چمتو شوي.
خلاصون
"د سیډراګون په زړه پورې فینوټایپ کې د پاڼو په څیر ضمیمه، د غاښونو پرته ټیوبلر خوله، او نارینه امیندوارۍ شامل دي چې په خلاص "بوډ پیچ" کې د القاح شوي هګیو انکیوبیشن شامل دي.موږ د عام سیډراګون (Phyllopteryx taeniolatus) او د هغې نږدې اړوند ډولونه، د ایلیګیټر پایپ فش (Syngnathoides biaculeatus) نارینه او ښځینه جینومونه ترتیب کړل.د تکامل نوښت څخه د لیږد پروفایلونه ، د پاڼي په څیر ضمیمه ، ښیې چې د جینونو یوه مجموعه په ځانګړي ډول د فن په پراختیا کې دخیل دي او همدارنګه د احتمالي نسج ترمیم او معافیت دفاعي جینونو لپاره د ټران سکریپټونو بډایه کول هم شامل دي.د scpp5 لپاره د زیبرا فش میوټینټونه، چې په ټولو syngnathids کې له لاسه ورکړل شوي، موندل شوي چې د فریینجیل غاښونو نشتوالی یا خراب شوي، د دې فرضیې ملاتړ کوي چې د scpp5 ضایع کول په سینګاتیډز کې د غاښونو له لاسه ورکولو سره مرسته کړې.یو ځایی جنس - ټاکلی لوکس چې د نارینه لپاره ځانګړی amhr2y جین کوډ کوي چې د عام سیډراګون او ایلیګیټر پایپ فش لخوا شریک شوی وپیژندل شو. »
مواد او دودونه:
مواد
Fزموږ عام سیډراګون (P. taeniolatus) او دوه الیګیټر پایپ فش (S. biculeatus) نمونې.دوه عام سیډراګون (یو نارینه او یوه ښځینه) او دوه ایلیګیټر پایپ فش (یو نارینه او یوه ښځینه) اشخاص د ټول جینوم ترتیب لپاره کارول شوي ، او دوه نور نارینه عام سیډراګون اشخاص د جینوم بیاکتنې لپاره کارول شوي.
د جینوم ترتیب کولو ستراتیژي
270/350 bp کتابتون (Hiseq 2500) + Pacbio 20Kb (Sequel) یا Nanopore 30 Kb (MinION) + Hi-C (NovaSeq 6000). ترتیب کول، او دوه نور نارینه عام سیډراګون اشخاص د جینوم بیاکتنې لپاره کارول شوي.
د ټرانسکریټوم ترتیب کول
Fیا عام سیډراګون، دماغ، سترګې، ګل، ځیګر، زړه، پښتورګي، میسینټري، کولمو، عضلات، فین، پوستکي، د پاڼو په څیر ضمیمه، ټیسټس او تخمدان راټول شوي.
د جینوم دی نوو مجلس ستراتیژي
Canu (اصلاح) + WTDBG2 (اسمبلۍ) + پیلون (پولنډ) + لیچیسس (Hi-C).
اصلي پایلې
انځور 1. د عام سیډراګون (P. taeniolatus) او د ایلیګیټر پایپ فش (S. biaculeatus) کلیدي ځانګړتیاوې او د دوی فیلوجینیک موقعیتونه.
انځور 2. مورفولوژي او د عام سیډراګون (P. taeniolatus) کې د پاڼو په څیر ضمیمو کې جینیکیک جوړښت.
انځور 3. په عام سیډراګون (P. taeniolatus) او الګیټر پایپ فش (S. biaculeatus) کې د جنسیت ټاکلو جین.
انځور 4. په زیبرا فش scpp5 homozygous mutants کې د فیرینجیل غاښونو فینوټایپونه.
د پوسټ وخت: جنوري-08-2022