د جینوم ارتقاء، PANGENOME
پین جینوم څه شی دی؟
راټول شوي شواهد ښیي چې د مختلفو ډولونو تر مینځ توپیر کیدای شي لوی وي.یو واحد جینوم دومره لرې دی چې د یو واحد نسل د جینیاتي معلوماتو بشپړ عکس ترلاسه کړي.د پین-جینوم مطالعې هدف د یو ډول پراخه جینومیک ګراف ترلاسه کول دي او د ډیری فشارونو جینوم ډی نوو مجلس ترسره کولو له لارې د ځانګړتیاو او جینیاتي کوډونو ترمینځ اړیکې ډیکوډ کول دي ، کوم چې د تغیراتو ژور او پراخه کان کیندنې ته اجازه ورکوي.
د پین جینوم مطالعې رجحانات
شکل 1 د پان جینوم د خپرو شویو څیړنیزو مقالو رجحانات.
یادونه: ارقام د طبیعت، حجرو او ساینس لړۍ ژورنالونو کې د خپرو شویو مقالو سرلیکونو لټون کولو لپاره د کلیدي کلمې په توګه د "پین جینوم" اخیستلو پایله ښیې.
a.د ډیری نمونو لوستل د یوې حوالې سره سمون لري او غیر متناسب په ناول کې راټول شوي.د اصلي حوالې په ترتیب کې د دې ناول کنټیګونو په اضافه کولو سره ، د پینګینوم حواله رامینځته کیدی شي.د توزیع وړ سیمې د نقشې کولو پراساس ټاکل کیږي چې ټول لوستل بیرته پینګینوم ته ځي.
ب.د ډیری لاسونو د جینومونو ډی نوو اسمبلۍ د بشپړ جینوم سمون طریقې ته اجازه ورکوي چې د توزیع وړ جینومیک سیمې وپیژني.
ج.د پین-جینوم ګراف د ټول جینوم ترتیبونو یا د نوو ګراف اسمبلی لخوا رامینځته کیدی شي ، کوم چې د ګراف له لارې د ځانګړي لارو په توګه د توزیع وړ سیمو مختلف معلومات په مؤثره توګه ذخیره کوي.
د پین جینوم څنګه جوړ کړئ؟
شکل 2 د پین جینوم طریقې پرتله کول1
a.د ډیری نمونو لوستل د یوې حوالې سره سمون لري او غیر متناسب په ناول کې راټول شوي.د اصلي حوالې په ترتیب کې د دې ناول کنټیګونو په اضافه کولو سره ، د پینګینوم حواله رامینځته کیدی شي.د توزیع وړ سیمې د نقشې کولو پراساس ټاکل کیږي چې ټول لوستل بیرته پینګینوم ته ځي.
ب.د ډیری لاسونو د جینومونو ډی نوو اسمبلۍ د بشپړ جینوم سمون طریقې ته اجازه ورکوي چې د توزیع وړ جینومیک سیمې وپیژني.
ج.د پین-جینوم ګراف د ټول جینوم ترتیبونو یا د نوو ګراف اسمبلی لخوا رامینځته کیدی شي ، کوم چې د ګراف له لارې د ځانګړي لارو په توګه د توزیع وړ سیمو مختلف معلومات په مؤثره توګه ذخیره کوي.
پدې وروستیو کې خپاره شوي پین جینومونه
● د پین جینومونو جنسي تیری2
● د ټماټو پین جینومونه 3
● Rice Pan-genome4
● د لمر ګل پین جینوم5
● د سویابین پین جینوم 6
● Rice Pan-genome7
● وربشی پین جینوم۸
● د غنمو پین جینوم۹
● Sorghum Pan-genome10
● Phytoplankton Pan-genome11
حواله
1. Bayer PE، Golicz AA، Scheben A، Batley J، Edwards D. د نبات پین جینومونه نوې حواله ده.د نیټ نباتات.2020؛6(8):914-920doi:10.1038/s41477-020-0733-0
2. سندره JM، Guan Z، Hu J، et al.اته لوړ کیفیت لرونکي جینومونه د پین-جینوم جوړښت او د براسیکا ناپوس د ایکوټایپ توپیر څرګندوي.د نیټ نباتات.2020؛6(1):34-45.doi:10.1038/s41477-019-0577-7
3. Gao L، Gonda I، Sun H، et al.د روميانو پین-جینوم نوي جینونه او یو نادر ایلیل د میوو خوند تنظیموي.نیټ جینیټ.2019;51(6):1044-1051.doi:10.1038/s41588-019-0410-2
4. Zhao Q، Feng Q، Lu H، et al.د پین-جینوم تحلیل په کرل شوي او وحشي وریجو کې د جینومیک توپیر کچه په ګوته کوي [خپاره شوي سمون په نیټ جینیټ کې څرګندیږي.2018 اګست؛ 50(8):1196].نیټ جینیټ.2018؛50(2):278-284doi:10.1038/s41588-018-0041-z
5. Hübner S، Bercovich N، Todesco M، et al.د لمر ګل د پین-جینوم تحلیل ښیې چې هایبرډیزیشن د جین مینځپانګې او د ناروغیو مقاومت بدل کړی.د نیټ نباتات.2019؛5(1):54-62.doi:10.1038/s41477-018-0329-0
6. Liu Y، Du H، Li P، et al.د وحشي او کرل سویابین پین جینوم.حجره.2020;182(1):162-176.e13.doi:10.1016/j.cell.2020.05.023
7. Qin P، Lu H، Du H، et al.د 33 جنیټیکي پلوه متنوع وریجو لاسرسي د پین-جینوم تحلیل پټ جینومیک تغیرات په ګوته کوي [د چاپ څخه دمخه آنلاین خپور شوی ، 2021 می 25].حجره.2021;S0092-8674(21)00581-X.doi:10.1016/j.cell.2021.04.046
8. Jayakodi M، Padmarasu S، Haberer G، et al.د وربشی پین جینوم د میوټیشن نسل کولو پټ میراث څرګندوي.طبیعت.2020؛588(7837):284-289.doi:10.1038/s41586-020-2947-8
9. Walkowiak S، Gao L، Monat C، et al.د غنمو ډیری جینومونه په عصري نسل کې نړیوال توپیر څرګندوي.طبیعت.2020؛588(7837):277-283doi:10.1038/s41586-020-2961-x
10. Tao Y، Luo H، Xu J، et al.د کرل شوي او وحشي سورغم د پین-جینوم دننه پراخه توپیر [د چاپ څخه دمخه آنلاین خپور شوی، 2021 می 20].د نیټ نباتات.2021؛10.1038/s41477-021-00925-x.doi:10.1038/s41477-021-00925-x
11. Fan X، Qiu H، Han W، et al.Phytoplankton pangenome د متنوع دندو پراخ پروکاریوټیک افقی جین لیږد څرګندوي.Sci Adv.2020؛6(18):eaba0111.خپور شوی 2020 اپریل 29. doi:10.1126/sciadv.aba0111
د پوسټ وخت: جنوري-04-2022