په 2021 کې، BMKGENE د 31 De novo جینوم څیړنې په بریالیتوب سره په لوړ اغیزو ژورنالونو کې د 320 څخه ډیر اغیزې فکتورونو سره په بریالیتوب سره خپرې کړې. د 15 مقالو په ګډه لیکل شوي چې 4 یې د BMKGENE لخوا د لومړي لیکوال په توګه شریک شوي.
د 2022 کال له پیل څخه سمدلاسه ، دمخه په ترتیب سره د "طبیعي جینیات" او "مالکولر پلانټ" ژورنال کې دوه څیړنې مقالې خپرې شوې.هغه دا دي، "د خورا متفاوت لیچي جینوم څخه دوه مختلف هاپلوټایپونه د ابتدايي او ناوخته پخیدو کښتونو لپاره د خپلواک کورني پیښې وړاندیز کوي" (د لیچي جینوم څیړنه چې د باغدارۍ کالج لخوا ترسره شوې، د جنوبي چین کرهنیز پوهنتون، او ساینسي همکارانو، په طبیعي ګیني کې خپره شوې. )، او "د ایګیلوپس د پنځو سیتوپسس ډولونو جینوم سلسله او د پولیپلایډ غنم B-سبجینوم اصل" (پنځه سیتوپسس ډوله جینوم، د شمال ختیځ نورمال پوهنتون د پروفیسور باو لیو څیړنیز ټیم لخوا ترسره شوی.).موږ به دا دوه مقالې هم وڅیړو او له خپلو لوستونکو سره به یې شریک کړو.
اوس ، راځئ چې په 2021 کې د BMK او زموږ د همکارۍ تاسیساتو لخوا په ګډه لیکوال شوي عالي څیړنیزو مقالو ته یو نظر واچوو.
د نبات جینوم - په څو ډولونو کې پرمختګ.
1. د لوړ کیفیت جینوم مجلس د جوی جینومیک ځانګړتیاوې او د زراعتي پلوه مهم جینونه په ګوته کوي
د همکارۍ تاسیسات: د هینان زراعت پوهنتون
ژورنال: طبیعي جینیات
د اغیزې فکتور: 38.31
په دې پروژه کې، د وینینګ رای جینوم، د چینایي جوارو یو غوره ډول، ترتیب شوی و.راټول شوي کانټیګز (7.74 Gb) د اټکل شوي جینوم اندازې (7.86 Gb) 98.47٪ حسابوي، او 93.67٪ کانټیګز (7.25 Gb) اوو کروموزومونو ته ځانګړي شوي.تکراري عناصر د راټول شوي جینوم 90.31٪ تشکیلوي.د وینینګ مجلس نور تحلیلونه د جینوم پراخه جین نقلونو او د نشایسته بایوسینتیز جینونو باندې د دوی اغیزو باندې نوي رڼا واچوله، د پیچلي پرولامین لوسي فزیکي تنظیم، د جین څرګندولو ځانګړتیاوې د ابتدايي سرلیک ځانګړتیا او د کورني کورني کولو پورې تړلې کروموزوم سیمې او په ریو کې لوسي.دا جینوم ترتیب ژمنه کوي چې د جوارو او اړوندو حبوباتو فصلونو کې د جینومیک او نسل ورکولو مطالعات ګړندي کړي.
2. پرته له ټوټو ګلاب: جینومیک بصیرت د رطوبت موافقت سره تړاو لري
د همکارۍ تاسیسات: د کونمینګ د بوټانو انسټیټیوټ، د چین د علومو اکاډمۍ
ژورنال: د ملي ساینس بیاکتنه
د اغیز فکتور: 17.273
په دې پروژه کې، د 'Basye's Thornless' (BT، د Rosa wichuraiana یو له ټوټو څخه پاک کښت)، 'اولډ بلش' (OB، د ګلابو په کورني کولو کې بنسټ ایښودونکی جینوټایپ)، د دوی F1 هایبرډ او BCF1 نمونې راټولې شوې.او د لوړ کیفیت ریفرنس جینوم اسمبلۍ رامینځته شوې ترڅو د ډډ ډبرې پراختیا پورې اړوند جینیاتي عناصر وپیژني.د جینوم اندازه شاوخوا 530.6 Mb ده.د راټول شوي جینوم کیفیت تصدیق کولو لپاره، تحلیل لکه د جنیټیک نقشې پرتله کول، BUSCO، NGS بیا راټولول، د OB هاپلوټائپ سره پرتله کول، د اساسی غلطی شرح کنټرول ترتیب او د جینوم پراخه LTR اسمبلی شاخص ارزښت چیک (LAI = 20.03) ترسره شو.دا څیړنه د ډډ د ډبرو پیچلي میراث نمونه او تنظیمي میکانیزم په ګوته کوي او موږ ته یې د ګلاب بیولوژي او د ماین مالیکول مارکرونو مطالعې لپاره یو بنسټ او نوې سرچینې چمتو کړې چې د مهمو ځانګړتیاو سره تړاو لري.
3. په کوکومیس کې د ترکیب شوي الوپولیپلایډونو بشپړ جینوم ترتیب د ایلوپولیپلایډیزیشن جینوم ارتقاء په اړه بصیرت څرګندوي.
د همکارۍ تاسیسات: د نانجینګ کرهنیز پوهنتون
ژورنال: پرمختللی ساینس
د اغیزې فکتور: 16.801
دې څیړنې د مصنوعي allotetraploid د لوړ کیفیت جینوم راپور ورکړی چې د کاکبر (C. sativus, 2n = 14) او د هغې د ځنګلي نسبي ډولونو (C. hystrix, 2n = 24) او ورپسې د کروموزوم نقل کولو تر مینځ د متقابل هایبرډیزیشن په کارولو سره ترلاسه شوی ، کوم چې لومړی دی. په بشپړ ډول ترتیب شوي مصنوعي الوپولیپلایډ.د جینوم اسمبلۍ د "PacBio+BioNano+Hi-C+Illumina" ترتیب کاري فلو پلي کړ، په پایله کې د جینوم اندازه 530.8Mb او د N50 = 6.5Mb سره مخ شوه.لوستل 19 سیوډوکروموزومونو او سبجینومونو ته ځانګړي شوي.پایلو ښودلې چې د جینوم نقل کولو پرځای هایبرډیزیشن په اټومي او cp جینومونو کې د ډیری جینومیک بدلونونو لامل کیږي.دا وړاندیز وکړ چې ثابت هیټروزایګوسیت C.×hytivus چمتو کوي د فشار د زیاتوالي سره.پایلې د نبات د پولیپلویډی تکامل په اړه نوي لیدونه وړاندې کوي او د راتلونکي فصلونو لپاره د نسل پالنې احتمالي ستراتیژي وړاندې کوي.
4. مقایسه جینوم تحلیلونه په پنبه کې د 3D جینومیک فولډینګ د ټرانسپوسن منځګړیتوب جینوم توسیع او د ارتقایی جوړښت څرګندونه کوي
د همکارۍ تاسیسات: د هوزونګ زراعت پوهنتون
ژورنال: مالیکولر بیولوژي او ارتقا
د اغیز فکتور: 16.242
دې پروژې د نانوپور سیکوینسینګ څخه د پنبې د دریو ډولونو د جینوم راټولولو لپاره کارولې دي: Gossypium rotundifolium (K2، د جینوم اندازه = 2.44Gb، contigN50 = 5.33Mb)، G. arboreum (A2، د جینوم اندازه = 1.62Gb، Mb1615)، او کانټیګ = 165. G. raimondii (D5، د جینوم اندازه = 0.75Gb، contigN50 = 17.04 Gb).د ټولو دریو جینومونو له 99٪ څخه ډیر د Hi-C له لارې راټول شوي.د BUSCO تحلیل پایلې په ترتیب سره 92.5٪، 93.9٪ او 95.4٪ دي.دا ټولې شمیرې په ګوته کوي چې درې غونډې جینومونه د حوالې درجې دي.د جینوم پرتله کولو تحلیلونو د نسب ځانګړي TE امپلیفیکیشن توضیحات مستند کړي چې د لوی جینوم اندازې توپیرونو کې مرسته کوي.دا څیړنه په نباتاتو کې د لوړ ترتیب کروماتین جوړښت په ارتقاء کې د ټرانسپوسن منځګړیتوب جینوم توسیع رول باندې رڼا اچوي.
5. د کروموزوم پیمانه راټولول او د بایوماس فصل تحلیل او تحلیل Miscanthus lutarioriparius genome
د همکارۍ اسانتیا: د مالیکولي نباتاتو په علومو کې د غوره والي لپاره د CAS مرکز
ژورنال: د طبیعت مخابرات
د اغیزې فکتور: 14.912
دې پروژې د اکسفورډ نانوپور ترتیب او های-سي ټیکنالوژیو سره یوځای کولو سره د Miscanthus lutarioriparius جینوم د کروموزوم پیمانه مجلس راپور ورکړ.د 2.07Gb مجلس د جینوم 96.64٪ پوښي، د 1.71 Mb د کنټیګ N50 سره.د ټولو ترتیبونو شاوخوا 94.30٪ په 19 سیوډوکروموزومونو کې لنگر شوي.د BAC ترتیب سره پرتله کولو، LAI ارزونې، د BUSCO ارزونه، د NGS ډیټا سره بیا راټولول، د ټرانسکریټوم ډیټا بیا راټولول، جینوم د لوړ کیفیت او دوام په توګه ارزول شوی.د M. lutarioriparius Allotetraploid اصل د سینټرومیریک سپوږمکۍ تکرارونو په کارولو سره تایید شوی.د M. lutarioriparius د تندیم نقل جینونه نه یوازې د فشار غبرګون پورې اړوند شرایطو کې فعاله بډایه کیږي، بلکه د حجرو دیوال بایوسینتیسس.د جین نقلونه شاید د C4 فوتوسنتز کې رول ولوبوي او په ټیټ تودوخې کې د Miscanthus C4 فوتوسنتز سره مرسته کوي.څیړنې د څو کلن نباتاتو مطالعې لپاره مهم حواله چمتو کړې.
6. د کروموزوم په کچه د کیمپټوتیکا اکومیناټا جینوم اسمبلۍ د کیمپټوتیسین بایوسینتیسیز ارتقایی اصل په اړه لید وړاندې کوي
د همکارۍ تاسیسات: د سیچوان پوهنتون
ژورنال: د طبیعت مخابرات
د اغیزې فکتور: 14.912
دې پروژې د لوړ کیفیت، کروموزوم په کچه د C. acuminata جینوم اسمبلۍ راپور ورکړی، د جینوم اندازه 414.95Mb او د N50 1.47Mb سره.موږ وموندله چې C. acuminata یو خپلواک بشپړ جینوم نقل تجربه کوي او ډیری جینونه چې له هغې څخه ترلاسه شوي د کیمپټوتیسین بایوسینتیسس پورې تړاو لري.د LAMT جین فعال انحراف او د دوه SLAS جینونو مثبت تحول، له همدې امله، دواړه په C. acuminata کې د کیمپټوتیسین بایوسینتیسس کې ډیره مرسته کړې.پایلې د ثانوي میټابولیټ په ارتقايي اصل کې د جینیاتي بدلونونو په پیژندلو کې د لوړ کیفیت جینوم اسمبلۍ په اهمیت ټینګار وکړ.
7. د ایلیل تعریف شوي جینوم د کاساوا د تکامل په جریان کې بایلیک توپیر څرګندوي
د همکارۍ تاسیسات: د چین د تودوخې زراعتي علومو اکاډمۍ
خبریال: مالیکولی نبات
د اغیز فکتور: 13.162
دې پروژې د پیسفیک بایوسینس (PacBio) ترتیب کولو پلیټ فارم په کارولو سره د contigN50 1.1Mb سره د کاساوا لپاره د حوالې جینوم راټول کړ.د BUSCO، LAI شاخص، او د لوړ کثافت جنیټیک نقشې لخوا د ارزونې وروسته، راټول شوي جینوم د حوالې درجې په توګه تایید شوی.بې کاره سیمې پیژندل شوي او کنټیګونه د Hi-C لینکونو په کارولو سره په 18 سیوډوکروموزومونو کې لنگر شوي.دا د کاساوا لپاره د لوړ کیفیت او ایلیل تعریف شوي حوالې جینوم په هوموولوژس کروموزومونو کې د متنوع دوه ایلیلونو په پیژندلو کې ارزښتناکه دی ، دا اجازه ورکوي چې د دوه ایلیلونو توپیر او د بیان تسلط کشف کړي او د دوی اصلي ارتقایی محرک قوتونه.دا په کاساوا او نورو خورا متفاوت فصلونو کې د نسل پالنې ستراتیژیو نوښت اسانه کړی.
8. د پالونیا د ګړندۍ ودې او د پاولونیا د جادوگرانو د جوارو په جوړولو کې جینومیک لیدونه
د همکارۍ تاسیسات: د هینان زراعت پوهنتون
خبریال: مالیکولی نبات
د اغیز فکتور: 13.162
دې پروژې د Paulownia fortunei د لوړ کیفیت اټومي جینوم راټول کړ، د 511.6 Mb اندازه، د 93.2٪ سلسلې په 20 سیوډوکروموزومونو کې لنگر شوي.لوړ فوتوسنتیتیک موثریت د C3 فوتوسنتیزیز او د کراسولیسین اسید میټابولیزم لارې د ادغام له لارې ترلاسه کیږي، کوم چې ممکن د پاولونیا ونو د خورا ګړندۍ ودې عادت سره مرسته کړې وي.د PaWB فایټوپلازما اضافي جینوم ترتیب، د فعال تحلیلونو سره یوځای، دا په ګوته کوي چې تاثیر کوونکی PaWB-SAP54 په مستقیم ډول د Paulownia PfSPla سره اړیکه لري، چې په پایله کې د ubiquitin- منځګړیتوب لارې په واسطه د PfSPla تخریب سبب کیږي او د ویچس د جوړیدو لامل کیږي.معلوماتو د پاولونیا بیولوژي او د PaWB د جوړولو لپاره تنظیمي میکانیزم په اړه د پام وړ لیدونه وړاندې کړل.
د څارویو جینوم - د ډولونو د تکامل ژور لید
1. د Nautilus pompilius جینوم د سترګو تکامل او بایومینرالیزیشن روښانه کوي
د همکارۍ تاسیسات: د جنوبي چین سمندر د بحرونو انسټیټیوټ، CAS
ژورنال: طبیعي ایکولوژي او تکامل
د اغیز فکتور: 15.462
دې پروژې د Nautilus pompilius لپاره بشپړ جینوم وړاندې کړ.دا د ترتیب شوي سیفالوپوډونو په مینځ کې لږترلږه جینوم لري ، کوم چې 730.58Mb دی د contigN50 = 1.1Mb سره.د BUSCO ارزونې پایله 91.31٪ ده.د ټرانسکریپټوم، پروټوم، جین کورنۍ او فیلوجینیک تحلیل سره یوځای، دا جینوم د سیفالوپډ نوښتونو، لکه د پنهول سترګو او بایومینرالیزیشن په اړه بنسټیز حواله چمتو کړه.څیړنې ښودلې چې د Hox جین کلستر بشپړتیا ته زیان ممکن د Mollusks د شیل ورکیدو سره تړاو ولري.په مهمه توګه، ډیری جینومیک نوښتونه په شمول د جین ضایع کول، خپلواک انقباض او د ځانګړو جین کورنیو پراخول او د دوی اړوند تنظیمي شبکې احتمال د نوټیلس پنهول سترګو تکامل رامینځته کړی.نوټیلس جینوم د تکامل سناریوګانو او جینومیک نوښتونو د بیارغونې لپاره ارزښتناکه سرچینه جوړه کړه چې د موجوده سیفالوپډونو شکل لري.
2. د سیډراګون جینوم تحلیل د دې فینوټایپ او د جنسیت ټاکلو ځای ته بصیرت وړاندې کوي
د همکارۍ تاسیسات: د جنوبي چین سمندر د بحرونو انسټیټیوټ، CAS
ژورنال: ساینس پرمختګونه
د اغیزې فکتور: 14.132
دا پروژه د عام سیډراګون (Phyllopteryx taeniolatus) نارینه او ښځینه جینومونه ترتیبوي او د هغه نږدې ډولونه، د ایلیګیټر پایپ فش (Syngnathoides biaculeatus).د Phyllopteryx taeniolatus لپاره د جینوم اندازه ~ 659 Mb（♂） and ~ 663 Mb（♀） ده، د 10.0Mb او 12.1mb د contigN50 سره.د Phyllopteryx taeniolatus لپاره د جینوم اندازه 637 Mb（♂）او ~648 Mb（♀） ده، د 18.0Mb او 21.0Mb د contigN50 سره.د فیلوجینیټیک تحلیل له لارې، عام سیډراګون او ایلیګیټر پایپ فش د Syngnathinae خور ټیکسون دي، او شاوخوا 27.3 ما مخکې جلا شوي.د تکامل نوښت څخه د لیږد پروفایلونه، د پاڼي په څیر ضمیمه، ښیې چې د جینونو یوه ټولګه په ځانګړي ډول د فن په پراختیا کې دخیل دي او همدارنګه د احتمالي نسجونو ترمیم او د معافیت دفاعي جینونو لپاره د ټران سکریپټونو بډایه کول.یو ځایی جنس - ټاکلی لوکس چې د نارینه لپاره ځانګړی amhr2y جین کوډ کوي چې د عام سیډراګون او ایلیګیټر پایپ فش لخوا شریک شوی وپیژندل شو.دې پروژې د تطبیقي تکامل مطالعې لپاره مهم شواهد وړاندې کړل.
د پوسټ وخت: سپتمبر-19-2022