د جینوم ارتقاء
د جینوم مقایسه تحلیلونه د ټرانسپوسن منځګړیتوب جینوم پراختیا او په پنبه کې د 3D جینومیک فولډ ارتقاء جوړښت روښانه کوي
د نانوپور ترتیب |Hi-C |د PacBio ترتیب کول |Illumina |RNA - ترتیب کول |3D جینوم جوړښت |ټرانسپوسون |مقایسه جینومیک
په دې څیړنه کې، بایومارکر ټیکنالوژۍ د نانوپور ترتیب کولو، Hi-C او اړونده بایو انفارمیټیک تحلیلونو کې تخنیکي مالتړ چمتو کړ.
خلاصون
د انتقال وړ عنصر (TE) امپلیفیکیشن د جینوم اندازه پراخولو او تکامل منځګړیتوب کونکي ځواک په توګه پیژندل شوی ، مګر د 3D جینومیک جوړښت رامینځته کولو پایلې په نباتاتو کې په پراخه کچه نامعلومې پاتې دي.دلته، موږ د پنبې د دریو ډولونو لپاره د حوالې درجې جینوم اسمبلۍ راپور ورکوو چې د جینوم اندازې کې درې چنده دي، یعنېګوسیپیم روټونډیفولیم(K2)G. arboreum(A2)، اوجی ریمونډی(D5)، د اکسفورډ نانوپور ټیکنالوژۍ کارول.مقایسه جینوم تحلیلونه د نسب ځانګړي TE امپلیفیکیشن توضیحات مستند کوي چې د لوی جینوم اندازې توپیرونو کې مرسته کوي (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) ، او د جینومونو ترمینځ نسبتا ساتل شوي جین مینځپانګه او ترکیبي اړیکې په ګوته کوي.موږ وموندله چې نږدې 17٪ ترکیبي جینونه د فعال ("A") او غیر فعال ("B") برخو ترمینځ د کروماتین حالت بدلون ښیې ، او د TE امپلیفیکشن د جین په سیمو کې د A کمپارټمینټ د تناسب له زیاتوالي سره تړاو درلود (~ 7,000 جینونه. په K2 او A2 کې د D5 په پرتله.یوازې 42٪ د ټوپیولوژیکي تړاو لرونکي ډومین (TAD) حدود د دریو جینومونو په مینځ کې ساتل شوي.زموږ ډاټا د TEs وروستي پراخوالی د نسب - ځانګړي TAD سرحدونو رامینځته کولو وروسته اغیزه کوي.دا څیړنه په نباتاتو کې د لوړ ترتیب کروماتین جوړښت په ارتقاء کې د ټرانسپوسن منځګړیتوب جینوم توسیع رول باندې رڼا اچوي.
د جینوم اسمبلۍ کلیدي احصایې
شکل.د جينوم اسمبلي او د جي روټونډيفوليم (K2) تفصيل
خبرونه او مهم ټکي موخه یې د بایومارکر ټیکنالوژیو سره وروستي بریالي قضیې شریکول دي، د نوي ساینسي لاسته راوړنو نیول او همدارنګه د مطالعې په جریان کې پلي شوي مشهور تخنیکونه.
د پوسټ وخت: جنوري-05-2022