د لوړې کچې جین ټایپ کول، په ځانګړې توګه په لویه پیمانه نفوس کې، د جینیاتي اتحادیې مطالعاتو کې یو بنسټیز ګام دی، کوم چې د فعال جین کشف، ارتقاء تحلیل، او نور لپاره جنیټیک اساس چمتو کوي. ) د هر نمونې د ترتیب کولو لګښت کمولو لپاره معرفي شوی، پداسې حال کې چې د جینیاتي مارکر کشف کې مناسب موثریت ساتل کیږي.دا عموما د ټاکل شوي اندازې حد کې د محدودیت ټوټې استخراج له لارې ترلاسه کیږي، کوم چې د کم شوي نمایش کتابتون (RRL) نومیږي.Specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-Seq) د نوي SNP کشف او د لوی نفوس د SNP جینټایپ کولو لپاره پخپله پرمختللې ستراتیژي ده.
تخنیکي کاري جریان
SLAF vs موجود RRL میتودونه
د SLAF ګټې
د لوړ جینیاتي مارکر کشف موثریت- د لوړې کچې ترتیب کولو ټیکنالوژۍ سره په ګډه، SLAF-Seq کولی شي په ټول جینوم کې موندل شوي سلګونه زره ټګونه ترلاسه کړي ترڅو د متنوع څیړنیزو پروژو غوښتنه پوره کړي، یا د حوالې جینوم سره یا پرته.
دودیز او انعطاف وړ تجربوي ډیزاین- د مختلف تحقیق اهدافو یا ډولونو لپاره، د انزایمیک هضم مختلف ستراتیژۍ شتون لري پشمول د واحد انزایم، دوه اړخیز انزایم او څو انزایم هضم.د هضم ستراتیژي به په سیلیکو کې مخکې له مخکې ارزول کیږي ترڅو د غوره انزایم ډیزاین ډاډمن کړي.
په انزایمیک هضم کې لوړ موثریت- مخکې ډیزاین شوی انزیماتیک هضم په کروموزوم کې ډیر مساوي توزیع شوي SLAFs چمتو کوي.د ټوټې راټولولو موثریت کولی شي له 95٪ څخه ډیر لاسته راوړي.
د تکرار ترتیب څخه ډډه وکړئ- په SLAF-Seq ډیټا کې د تکراري سلسلې سلنه له 5٪ څخه ټیټه شوې، په ځانګړې توګه په هغه ډولونو کې چې د تکرار عناصرو لوړه کچه لري، لکه غنم، جوار او نور.
د ځان پرمختللی بایو انفارمیټ ورک فلو- BMK د SLAF-Seq ټیکنالوژۍ لپاره د تطبیق وړ بایو انفارماتیک کاري فلو رامینځته کړی ترڅو د وروستي محصول اعتبار او دقت ډاډمن کړي.
د SLAF غوښتنلیک
د جنتيکي تړاو نقشه
د لوړ کثافت جنیټیک نقشه جوړول او په کریسانتیمم کې د ګلونو ډوله ځانګړتیاو کنټرول کولو ځای پیژندل
ژورنال: د باغدارۍ څیړنه خپره شوې: 2020.7
GWAS
د سویابین په تخمونو کې د آیسوفاون مینځپانګې سره د نوماند جین پیژندنه د جینوم پراخه اتحادیې او د لینکج نقشه کولو په کارولو سره
ژورنال: د نبات ژورنال خپور شوی: 2020.08
ارتقايي جینیات
د نفوس جینومیک تحلیل او د نوو مجلس د تکامل لوبې په توګه د زیان رسوونکو وریجو اصلیت څرګندوي
ژورنال: مالیکولر پلانټ خپور شوی: 2019.5
په پراخه کچه جلا جلا تحلیل (BSA)
GmST1، چې د سلفوټرانسفیریز کوډ کوي، د سویابین موزیک ویروس د G2 او G3 فشارونو ته مقاومت ورکوي.
ژورنال: نبات، حجره او چاپیریال خپور شوی: 2021.04
حواله
سن ایکس، لیو ډي، جانګ ایکس، او نور.SLAF-Seq: د لوی پیمانه نوي SNP کشف او جینټایپ کولو یوه مؤثره میتود د لوړې کچې ترتیب کولو په کارولو سره [J].لومړی پلس، 2013، 8(3):e58700
سندره X، Xu Y، Gao K، et al.د لوړ کثافت جنیټیک نقشه جوړول او په کریسانتیمم کې د ګلونو ډوله ځانګړتیاو کنټرول کولو ځای پیژندنه (کریسانتیمم × موریفولیم رامات.).Hortic Res.۲۰۲۰؛ ۷:۱۰۸
وو ډي، لي ډي، ژاو ایکس، او نور.د سویابین په تخمونو کې د اسوفلاوون مینځپانګې سره د نوماند جین پیژندنه د جینوم پراخه اتحادیې او لینکج نقشه کولو په کارولو سره.پلانټ J. 2020;104(4): 950-963.
Sun J، Ma D، Tang L، et al.د نفوس جینومیک تحلیل او د نوو مجلس د تکامل لوبې په توګه د ویډي وریجو اصلیت څرګندوي.د مول نبات.2019;12(5):632-647.د مول نبات.۲۰۱۸;11(11):1360-1376.
Zhao X، Jing Y، Luo Z، et al.GmST1، چې د سلفوټرانسفیریز کوډ کوي، د سویابین موزیک ویروس G2 او G3 فشارونو ته مقاومت ورکوي.د نبات حجرو چاپیریال.2021؛10.1111/pce.14066
د پوسټ وخت: جنوري-04-2022