مایکروبیل ایکولوژي
د کرنې شدت د مایکروبیل شبکې پیچلتیا او په ریښو کې د کیسټون ټیکا کثرت کموي
بشپړ اوږدوالی امپلیکون ترتیب (ITS) |PacBio HIFI
لوړوالی
Aد کرنې شدت د چاپیریال د منفي اغیزو له امله په زیاتیدونکې توګه ستونزې رامینځته شوي چې په شمول د غذایی موادو د کارونې ضعیف موثریت، د ځمکې د اوبو eutrophiation، د خاورې کیفیت خرابیدل او داسې نور. د کرنې بدیل سیسټمونه په پراخه کچه د زیانونو د کمولو لپاره د غیر کښت او عضوي کرنې په شمول په پراخه کچه اختیار شوي.مایکروبیل ټولنه د زراعتي اکوسیستم په تولید او پایښت کې یو مهم رول لوبوي.په هرصورت، دا روښانه نده چې د کرنې مختلف سیسټمونه څنګه د ریښو مایکروبیوټا اغیزه کوي.
تجربوي ډیزاین
تجربې
Sد تیلو او ریښو (DNA) نمونې د 60 کرنیزو ځمکو څخه د غنمو له کروندو څخه وې (20 هر یو)
Grouping: 1. تړون (د کرلو سره)؛2. کنوانسیون (نه کرل)؛3. عضوي کرنيزه ځمکه
Sد مساوي ستراتیژي: د بشپړ اوږدوالي امپلیکون ترتیب (ITS)
Primers: ITS1F-ITS4 (د ITS ټوله سیمه په نښه کول ~ 630 bp)
Sد مساوي پلیټ فارم: PacBio RS II
بایو انفارمیټیک تحلیل
پایلې
Oپه اوسط ډول په هر سایټ کې 357 OTUs پیژندل شوي او د ټولو 60 سایټونو 837 OTUs.د ریښو فنګسي ټولنو الفا تنوع د دریو کرنې سیسټمونو ترمنځ د پام وړ توپیر نه و ښودلی.په هرصورت، د بیټا تنوع تحلیل کې درې جلا کلسترونه رامینځته شوي، چې د ریښو فنګسي ټولنې جوړښت باندې د کرنې سیسټم قوي اغیزې په ګوته کوي.
شکل 1. د الفا تنوع (شینن شاخص او د ټولنې جوړښت) او د بیټا تنوع تحلیل (د اصلي همغږي کینونیکي تحلیل) د ریښو فنګسي ټولنو په اړه
Ten keystone taxa په دریو کرنیز سیسټمونو کې د فنګسي ټولنو د ټولیز شبکې پراساس تعریف شوي: لوړ 10 نوډونه د لوړې درجې سره ، ترټولو لوړ نږدې مرکزيت او ترټولو ټیټ مرکزيت سره غوره شوي.له دوی څخه اوه یې د مایکروریزل امرونو پورې اړه لري.
شکل 2. د ریښو فنګسي ټولنو په ټولیزه توګه د دریو کرنې سیسټمونو شبکه
Fد آرمینګ-سیسټم ځانګړي شبکې په عضوي شبکه کې د پام وړ لوړ ارتباط په ګوته کوي چې دوه چنده ډیر کنارونه او ډیر وصل شوي نوډونه د نوټ او دودیز شبکې په پرتله.سربیره پردې، د عضوي کرنې شبکې د نورو په پرتله خورا ډیر کیسټون ټیکا (هیره) ساتلې، کوم چې د دې پیچلتیا او ارتباط ملاتړ کوي.
شکل 3. د کرنې سیسټم ځانګړي ریښې فنګسي شبکې
Aد کرنې شدت او د ریښو فنګس شبکې ارتباط تر مینځ قوي منفي اړیکه لیدل شوې.د ځنګلونو تصادفي تحلیل د کیسټون ټیکا اصلي چلوونکي په ګوته کړل: د خاورې فاسفورس، بلک کثافت، pH او مایکوریزال استعمار.
شکل 4. د کرنې شدت او د شبکې ارتباط په دریو کرنیز سیسټمونو (A او B) کې؛د ځنګل تصادفي تحلیل (C) او د کرنې شدت او د AMF استعمار (D) ترمنځ اړیکه
ټیکنالوژي
د بشپړ اوږدوالی امپلیکون ترتیب کول
Aد "درېیم نسل ترتیب" په مرحله کې راځي، په نښه شویو سیمو کې محدودیتونه او په ډی نوو مجلس کې ستونزې لرې شوې.Pacific Bioscience (PacBio) په بریالیتوب سره د ترتیبونو لوستل لسګونه کیلوبیسونو ته غځولي دي، کوم چې موږ ته اجازه راکوي چې په باکتریا کې د 16s rRNA (1,000 bp-1,500 bp) یا 18S rRNA (1,500 bp2) او 1,500 bp-000 bp - بشپړ اوږدوالی لوستل ترلاسه کړو. سیمې (400 bp-900 bp) په eukaryotics کې.د جینیاتي ساحې پراخه لید د ډولونو تشریح او فعال جینونو حل خورا ښه کړی.د اساس دقت په اړه اوږده اندیښمن مسله د PacBio CCS ځان اصلاح لخوا حل شوې ، کوم چې د HIFI لوستل د 99٪ څخه ډیر د لوستلو دقت سره رامینځته کوي.
د OTU تشریح کې فعالیت
Tد اوږده لوستلو او د لوړې کچې دواړو ګټو په ترلاسه کولو سره، د تشریح دقت په ډراماتیک ډول لوړ کیدی شي او د مایکروبیل پیژندنې کې د "نوعه کچې" حل ترلاسه کول.
حواله
بنرجي، سمیران، او نور."د کرنې شدت د مایکروبیل شبکې پیچلتیا او په ریښو کې د کیسټون ټیکا کثرت کموي."د ISME ژورنال (2019).
ټکنالوجۍ او مهم ټکي موخه یې د څیړنې په مختلفو ډګرونو کې د بیلابیلو لوړ-پوښتو ترتیب کولو ټیکنالوژیو خورا وروستي بریالي غوښتنلیک شریکول او همدارنګه د تجربوي ډیزاین او ډیټا کان کیندنې کې عالي نظرونه شریکول دي.
د پوسټ وخت: جنوري-08-2022