Metagenomic Sequencing- نانوپور
د خدماتو ګټې
● د لوړ کیفیت راټولول - د ډولونو د پیژندنې او فنکشني جین وړاندوینې دقت لوړول
● د باکتریا جینوم جلا کول بند شوي
● په متنوع سیمو کې ډیر پیاوړی او د باور وړ غوښتنلیک، د بیلګې په توګه د رنځجنیک مایکرو ارګانیزمونو یا انټي بیوټیک مقاومت اړوند جینونو کشف
● مقایسه میټاجینوم تحلیل
د خدماتو مشخصات
| پلیټ فارم | ترتیب کول | وړاندیز شوي ډاټا | د بدلون وخت |
| نانوپور | ONT | 6 G/10 G | 65 کاري ورځې |
بایو انفارماتیک تحلیلونه
● د خامو معلوماتو کیفیت کنټرول
● Metagenome مجلس
● غیر بې ځایه جین سیټ او تشریح
● د ډولونو تنوع تحلیل
● د جنیټیک فعالیت تنوع تحلیل
● د ګروپ بین الافغاني تحلیل
● د تجربی فکتورونو په وړاندې د اتحادیې تحلیل
د نمونې اړتیاوې او تحویلي
د نمونې اړتیاوې او تحویلي
د نمونې اړتیاوې:
لپارهد DNA استخراج:
| د نمونې ډول | مقدار | تمرکز | پاکوالی |
| د DNA استخراج | 1-1.5 μg | 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
د چاپیریال نمونې لپاره:
| د نمونې ډول | د نمونې اخیستلو وړاندیز شوی طرزالعمل |
| خاوره | د نمونې اندازه: نږدې5 g;پاتې وچ شوي مادې باید له سطحې لرې شي؛لوی ټوټې ټوټې کړئ او د 2 ملي میتر فلټر څخه تیر کړئ؛د ریزرویشن لپاره په جراثیمي EP-tube یا cyrotube کې د Aliquot نمونې. |
| پاخه | د نمونې اندازه: نږدې5 g;د ذخیره کولو لپاره په جراثیمي EP-ټیوب یا کریوټیوب کې د الیکوټ نمونې راټول او راټول کړئ. |
| د کولمو منځپانګه | نمونې باید د اسپټیک حالت لاندې پروسس شي.راټول شوي نسجونه د PBS سره مینځل؛PBS سینټرفیوژ کړئ او په EP-ټیوبونو کې پریپیټینټ راټول کړئ. |
| سلج | د نمونې اندازه: نږدې5 g;د ریزرویشن لپاره په جراثیمي EP-ټیوب یا کریوټیوب کې د الیکوټ سلج نمونه راټول کړئ |
| د اوبو بدن | د محدود مقدار مایکروبیل نمونې لپاره، لکه د نل اوبه، د څاه اوبه، او داسې نور، لږ تر لږه 1 لیټره اوبه راټول کړئ او د 0.22 μm فلټر څخه تیر کړئ ترڅو په جھلی کې مایکروبیل غني کړي.جھلی په جراثیمي ټیوب کې ذخیره کړئ. |
| پوستکی | د پوټکي سطح په احتیاط سره د کاټن سویب یا جراحي تیغ سره وخورئ او په جراثیمي ټیوب کې یې ځای په ځای کړئ. |
وړاندیز شوي نمونې تحویلي
نمونې په مایع نایتروجن کې د 3-4 ساعتونو لپاره کنګل کړئ او په مایع نایتروجن یا -80 درجې کې د اوږدې مودې لپاره ذخیره کړئ.د وچې یخ سره د نمونې لیږد اړین دی.
د خدمت کاري جریان
د نمونې سپارل
د کتابتون جوړول
ترتیب کول
د معلوماتو تحلیل
د پلور وروسته خدمتونه
1. Heatmap: د ډولونو بډایه کلستر کول
2. فعلي جینونه د KEGG میټابولیک لارو ته تشریح شوي
3. د نسلونو د اړیکو شبکه
4. د کارډ د انټي بیوټیک مقاومت جینونو سرکوس
د BMK قضیه
نانوپور میټاګینومکس د باکتریا ټیټ تنفسي انفیکشن ګړندي کلینیکي تشخیص وړوي
خپور شوی:د طبیعت بایو ټیکنالوژي، 2019
تخنيکي ټکي
ترتیب کول: نانوپور منین
کلینیکي میټاګینومکس بایو انفارمیټکس: کوربه د DNA تخریب ، WIMP او ARMA تحلیل
چټک کشف: 6 ساعته
لوړ حساسیت: 96.6٪
کلیدي پایلې
په 2006 کې، د ټیټ تنفسي انتان (LR) په ټوله نړۍ کې د 3 ملیون انسانانو د مړینې لامل شو.د LR1 رنځجن کشف کولو لپاره ځانګړی میتود کښت دی ، کوم چې ضعیف حساسیت لري ، د اوږدې مودې په اوږدو کې او د انټي بیوټیک درملنې په لومړیو کې د لارښود نشتوالی دی.ګړندی او دقیق مایکروبیل تشخیص له اوږدې مودې راهیسې بیړنۍ اړتیا وه.د ختیځ انګلیا پوهنتون څخه ډاکټر جسټین او د هغه ملګرو په بریالیتوب سره د نانوپور میشته میټاجینومیک میتود د رنځجن کشف لپاره رامینځته کړ.د دوی د کاري فلو له مخې، د کوربه DNA 99.99٪ له مینځه وړل کیدی شي.د ناروغیو او انټي بیوټیک مقاومت لرونکي جینونو کشف په 6 ساعتونو کې بشپړ کیدی شي.
حواله
چارالامپوس، ټي، کی، جی ایل، ریچارډسن، ایچ، آیډین، اې، او او ګریډي، جې.(۲۰۱۹).د نانوپور میټاګینومکس د باکتریا ټیټ تنفسي انفیکشن ګړندي کلینیکي تشخیص وړوي.د طبیعت بایو ټیکنالوژي، 37(7)، 1.
