● د مختلفو څیړنو اهدافو لپاره د ډیری ترتیب کولو ستراتیژی شتون لري
● د فنګسي جینوم اسمبلۍ کې خورا تجربه لري چې له 10,000 څخه ډیر قلمي بشپړ جینوم راټول شوي.
● د پلور وروسته مسلکي تخنیکي مالتړ ټیم چې د څیړنې نور ځانګړي اړتیاوې پوره کوي.
خدمت | د ترتیب کولو ستراتیژي | کیفیت تضمین شوی | اټکل شوی د بدلون وخت |
د فنګس ښه نقشه | ایلومینا 50X+نانوپور 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 کاري ورځې |
PacBio HiFi 30X | |||
د فنګل قلم - بشپړ نقشه | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | د کروموزوم انکرینګ تناسب>90% | 45 کاري ورځې |
● د خامو معلوماتو کیفیت کنټرول
● د جینوم مجلس
● د جینوم اجزاو تحلیل
● د جین فعالیت تشریح
● مقایسه جینومیک تحلیل
لپارهد DNA استخراج:
د نمونې ډول | مقدار | تمرکز | پاکوالی |
د DNA استخراج | 1.2 ملی ګرامه | 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
د نسجونو نمونو لپاره:
د نمونې ډول | وړاندیز شوی نمونه درملنه | نمونه ذخیره او بار وړل |
یون سیلولر فنګس | خمیر د مایکروسکوپ لاندې وڅیړئ او د دوی د توزیع مرحله کې راټول کړئ په 1.5 یا 2 ملی لیتر ایپپینډورف کې کلتور (تقریبا 3-4.5e9 حجرې لري) انتقال کړئ.(په یخ کې وساتئ) ټیوب د 1 دقیقو لپاره په 14000 ګرامه کې سینټرفیوج کړئ ترڅو باکتریا راټول کړي او په احتیاط سره سپرناټینټ لرې کړي. ټیوب مهر کړئ او باکتریا لږترلږه د 1-3 ساعتونو لپاره په مایع نایټروجن کې کنګل کړئ.ټیوب په -80 ℃ یخچال کې ذخیره کړئ. | نمونې په مایع نایتروجن کې د 3-4 ساعتونو لپاره کنګل کړئ او په مایع نایتروجن یا -80 درجې کې د اوږدې مودې لپاره ذخیره کړئ.د وچې یخ سره د نمونې لیږد اړین دی. |
میکرو فنګس | په فعاله وده مرحله کې نسج سپارښتنه کیږي. نسج د انډوټوکسین نه پاکو اوبو سره وینځئ، بیا 70٪ ایتونل. نمونه په کریو ټیوبونو کې خوندي کړئ. |
1. د فنګسي جینومیک اجزاو په اړه د سرکوس ډیاګرام
2. مقایسه جینومیک تحلیل: د فایلوجینیک ونې