د DNA/RNA ترتیب کول - د نانوپور سیکوینسر
د خدماتو توضیحات ځانګړتیاوې
| پلیټ فارم | د کتابتون اندازه | د نظري معلوماتو حاصلات (په هر حجره) | د واحد اساس دقت | غوښتنلیکونه |
| نانوپور | 8Kb، 10kb، 20kb، الټرالونګ، cDNA-PCR | 70-90Gb/Cell | 85-92٪ | د SV زنګ وهل، De novo، د بشپړ اوږدوالی ترتیب، Iso-Seq، د جین تشریح، د DNA میتیلیشن کشف |
د خدماتو ګټې
● د مختلفو نوعو سره د زرګونو تړلو پروژو سره د PacBio ترتیب کولو پلیټ فارم کې د 5 کلونو تجربه.
● BMKGENE د اکسفورډ نانوپور رسمي شریک دی، د دوه ګوني پلیټ فارم RNA/DNA تصدیق سره.
● د بشپړ تجهیزاتو او د کافي ترتیب کولو له لارې د ترتیب کولو اصلي ماډلونه شتون لري.
● د نانوپور پلیټ فارم پراساس، د 10 څخه زیات د حیواناتو او نباتاتو Denovo څیړنې په نړیوالو مشهورو ژورنالونو کې خپرې شوي.
د نمونې اړتیاوې
| د نمونې ډول | مقدار | غلظت (Qubit®) | حجم | پاکوالی | نور |
| جینومیک DNA | د معلوماتو اړتیا پورې اړه لري | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5 په 260 nm کې پاکه چوکۍ، هیڅ ککړتیا نشته | غلظت باید د Qubit او Qubit/Nanopore ≤ 2 لخوا اندازه شي |
| ټول RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5；کوم ککړتیا نشته | د RIN ارزښت ≥7.5 |
د خدمت کاري جریان
د نمونې چمتو کول
د کتابتون جوړول
ترتیب کول
د معلوماتو تحلیل
د پروژې سپارل
د DNA نمونې د معلوماتو کیفیت ارزونه
جدول 1. د پاکو معلوماتو احصایې.
| BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | پاک N50Len | پاک N90Len | cleanMeanLen | پاک میکسلین | cleanMeanQual |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
د RNA نمونې د معلوماتو کیفیت ارزونه
جدول 1. د پاکو معلوماتو احصایې.
| د فایل نوم | د مراجعینو ID | ReadNum | BaseNum | N50 | منځنۍ اوږدوالی | MaxLength | MeanQscore |
| RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | ۳۹۸ | ۴۵۲ | 129,227 | Q12 |
شکل 1. د اوږدوالی ویش ولولئ
شکل 2. د پاکو معلوماتو د کیفیت نمرې ویش
شکل 3. د پاکو معلوماتو اوږدوالی او کیفیت سکور ویش
